Возможно, что проклятие римского епископа было не вполне безразлично для Пирра и нарушало его покой, когда он, по смерти Павла, снова занял свое место в Константинополе. Патриарха Павла Феодор также предал анафеме; защищая с таким мужеством римское вероучение, этот папа умер 13 мая 649 г. Феодор оставил городу немного построек; им, вероятно, была только окончена латеранская часовня, начатая его предшественником, да еще построена в Латеране часовня Св. Себастиана. Затем им были построены или реставрированы две церкви вне города – церковь Св. Валентина на кладбище у Фламиниевой дороги, недалеко от Мильвийского моста, и церковь Св. Евпла за Остийскими воротами, вблизи пирамиды Кайя Цестия. Обе эти церкви погибли; первая была разрушена, вторая, вероятно, превращена в церковь S.-Salvator in Via Ostiensi.

Борьба с монофелитами была в полном разгаре, когда умер Феодор, и его преемнику довелось стать жертвой ненависти византийского патриарха.

Мартин I, происходивший из умбрийского города Тудертума, ныне Тоди, и бывший раньше нунцием в Константинополе, вступил на престол Петра уже в июне или июле 649 года. Римское духовенство совершило над ним посвящение раньше, чем было получено императорское утверждение и новый папа выступил решительным противником греческой церкви. 5 октября он созвал в Латеране собор, на который съехалось из городов и с островов Италии 150 князей церкви. Предстояло обсудить «typus», или эдикт, который был издан Константом II в 648 г. и которым всякие споры о единой и двух волях воспрещались всем христианам. Император потребовал у Мартина подчинения этому эдикту, озабочивавшему императора гораздо более чем возвращение отнятых у него арабами провинций. В Италию был послан новый экзарх Олимпий, и ему было предписано принять меры, чтобы эдикт был признан епископами, владетельными князьями, народом и даже чужестранцами. Экзарх должен был захватить в свои руки папу и заставить епископов принять эдикт, но раньше надлежало узнать, каково в этом отношении настроение войска в Риме, и, если бы это настроение оказалось враждебным, оставить все по-старому, пока войска как в Риме, так и в Равенне не окажутся на стороне экзарха.

Все это бросает некоторый свет на отношения Рима к экзарху: этот императорский чиновник больше уже не смел распоряжаться городом по своему усмотрению, и в этом случае мы в первый раз встречаем ясное и вполне определенное указание на существование войска, организованного в виде милиции из знатных граждан и владетельных лиц. Это войско, хотя и получало – правда, не всегда – свое жалованье из Константинополя, но по своему характеру было национально-римским. Без его согласия замысел экзарха не мог быть выполнен.

Прибыв в Рим, Олимпий нашел Латеранский собор в полном разгаре его деятельности, и уже были осуждены, и эктезис, и тип (typus), и Кир Александрийский, и все три патриарха – Сергий, Пирр и Павел. Имея в виду приказ императора, экзарх с помощью части своих собственных наемников, части тех, кого ему удалось подкупить в римском войске, и затем разными другими интригами старался посеять раскол на соборе. Городом овладело большое волнение; экзарху пришлось долго пробыть в Риме, и нет сомнения, что он занимал тогда древний дворец цезарей. Все старания экзарха оказались, однако, тщетными, точно так же как оказалось неудачным и покушение на жизнь папы, которое по крайней мере приписывается экзарху книгой пап. Притворившись примирившимся с Мартином, экзарх явился в церковь S.-Maria Maggiore и подошел к алтарю, чтобы принять причастие из рук папы; в эту минуту, как было условлено, телохранитель экзарха должен был кинжалом нанести папе удар, но Господь, всегда охраняющий своих слуг, говорит летописец, поразил спатара слепотой, и он перестал видеть папу. Затем, продолжает летописец Олимпий действительно примирился с Мартином, покаялся ему и удалился в Сицилию, где сарацины уже успели укрепиться; здесь он потерпел поражение и после того, среди разных мятежных замыслов, умер от какой-то болезни.

Его место в Равенне заступил в 652 или 653 г. Феодор Каллиопа; он являлся уже во второй раз и имел от императора приказ во что бы то ни стало сломить упорство Мартина. 15 июня 653 г., в сопровождении каммерария Пелария, экзарх вступил с войском в Рим. Во исполнение лежавшей на нем обязанности, Мартин приказал выйти навстречу экзарху духовенству, сам же, сославшись на приступ подагры, остался в Латеранском дворце. Экзарх проследовал во дворец цезарей и там принял послов; он уверил их, что сожалеет о болезни папы, и объявил им, что в воскресенье утром он сам явится к папе, чтоб засвидетельствовать ему свое глубокое почтение. Затем, опасаясь, что папский дворец полон вооруженных людей, экзарх приказал сначала сделать в нем обыск и после того окружил его своими войсками, чему римляне не оказали никакого сопротивления.

Окруженный священниками, папа покоился на своем ложе перед главным алтарем латеранской базилики. Экзарх явился в сопровождении вооруженных людей и сообщил духовенству императорский декрет, которым предписывалось низложить Мартина как узурпатора, занимавшего святой престол без утверждения императора. Духовенство ответило на это анафемой; затем поднялся страшный шум; византийцы мечами сшибли с алтарей светильники, стащили с ложа беззащитного Мартина и повлекли его во дворец цезарей. В ночь на 18 июня папу посадили на корабль, который уже стоял на Тибре готовый к отплытию, и повезли к Порто. Все духовенство готово было сопровождать папу в заточение, но экзарх разрешил папе взять с собой только шесть пажей или слуг и приказал затворить ворота, опасаясь, что римляне бросятся освобождать своего епископа. Несчастный папа после долгого путешествия морем был сначала высажен на остров Наксос, а затем в сентябре перевезен в Константинополь, где как оскорбитель величества был заключен в тюрьму. В числе предъявленных ему обвинений было, между прочим, и то, что он вместе с Олимпием участвовал в заговорах и призвал сарацинов в Сицилию.

Мы не можем войти здесь в изложение ни тяжких мучений, которым был подвергаем в Константинополе Мартин, ни его долго тянувшегося процесса и мужественной самозащиты, и только упомянем о том, как закончилась история этого епископа-героя, так высоко поднявшего уважение к папскому сану. Низложенный императорским эдиктом, он был сослан в древний Херсонес в Крыму и здесь, покинутый друзьями и врагами и удручаемый бедствиями, умер 16 сентября 655 г. как мученик за первенство Рима. Тело Мартина было погребено сначала в церкви Влахернской Божьей Матери в Константинополе и позднее перенесено в Рим. Об этом перенесении, однако, не упоминают ни книга пап, ни составленные Бедой и Адо жизнеописания мучеников. По римскому преданию, тело Мартина было погребено в Риме в церкви Свв. Сильвестра и Мартина Турского; между тем эта древняя церковь – титул Equitius – была посвящена обоим папам только в 844 г.

Сергием II. Память папы Мартина, святость которого была признана и греческой церковью, празднуется до настоящего времени 12 ноября.

После низложения Мартина и удаления его в ссылку император потребовал избрания ему преемника. Этому насилию, нарушавшему канонические правила, изгнанник принужден был молча подчиниться, и 10 августа 654 г. в папы был посвящен Евгений, сын Руффиана, римлянин из первого авентинского округа. Вскоре же стало очевидным, в какой сильной степени римский народ уже охвачен интересами церкви. Петр, снова ставший византийским патриархом, не замедлил выслать римскому епископу свое изложение веры, или синодик, так как по существовавшему обычаю константинопольские патриархи и папы вслед за избранием их обменивались такими синодиками. Присланное Петром изложение веры было составлено в таких неопределенных выражениях, что встретило со стороны римлян протест и было отвергнуто и народом, и духовенством. Это принудило Евгения предать осуждению синодик Петра. Таким образом римляне дали почувствовать, что они относятся к насилию, которое было совершено над папой Мартином, как к национальному оскорблению.