Но едва Оттон покинул Рим, как Иоанн XII уже почувствовал тяжкое иго императорской власти. Последствия похода Оттона в Рим превзошли расчеты Иоанна; освободитель церковного государства оказался повелителем папы, решившим быть действительным императором. Такой монарх, как Оттон, не мог, конечно, Удовольствоваться смиренным положением Карла Лысого. И вот Иоанн нашел, что лучше считать все происшедшее несбывшимся и, подстрекаемый знатью, вступил в переговоры с Беренгаром и Адальбертом. Императорская партия в Риме следила, однако, за каждым шагом Иоанна и дала знать о его измене Оттону, когда он весной 963 г. был в Павии. Посланные этой партии рассказали Оттону, какую развратную жизнь ведет Иоанн, говорили, что он обратил Латеран в дом терпимости и расточает достояние церкви, раздавая города и имения своим наложницам; что ни одна порядочная женщина уже не решается отправиться в Рим на богомолье, опасаясь стать жертвой развратного папы; что город разорен, церкви разрушены и через их развалившиеся крыши на алтари льет дождь. Ответ, которым Оттон извинил поведение Иоанна, является убийственной характеристикой положения папства того времени. «Папа, – сказал Оттон, – еще мальчик, и примеры достойных людей его исправят». Чтоб удостовериться в положении дел в Риме, Оттон отправил туда своих послов, а сам направился осаждать замок S.-Leone, где находились Беренгар и Вилла. Летом 963 г., во время нахождения здесь Оттона, к нему явились папские нунции, Димитрий, сын Мелиоза, и протоскриниарий Лев; они должны были выразить неудовольствие, что Оттон завладел церковными имениями и намерен присвоить себе также замок S.-Leone, собственность Св. Петра. Оттон, действительно не спешивший с возвращением некоторых патримониев, ответил, что он передаст имения церкви только тогда, когда они окончательно будут отняты у узурпаторов. Имея в своих руках доказательства вероломства Иоанна, Оттон, кроме того, мог показать нунциям перехваченные письма Иоанна к греческому императору и к венграм, которых папа в этих письмах призывал напасть на Германию. Отправленные затем в Рим императорские послы объявили папе, что их государь готов и присягой, и Божьим судом на поединке очистить себя от подозрения в нарушении данной им раньше клятвы. Но послы эти не нашли благосклонного приема едва только они удалились в сопровождении папских нунциев, как в Риме появился Адальберт. Этот юный претендент играл по отношению к Оттону ту же печальную роль, на которую некогда был обречен судьбою Адельхис. В то время как отец Адальберта защищал замок S.-Leone, он сам неутомимо носился всюду, разыскивая союзников. Он призывал на помощь византийцев, устремился в Фраксинету к сарацинам, затем, как некогда Секст Помией, направился на Корсику и отсюда вел переговоры с папой; наконец он высадился в Чивита-Веккии, и ворота Рима дружественно раскрылись перед ним.
Получив об этом известие, Оттон осенью 963 г. оставил замок S.-Leone и пошел в Рим. В городе уже начались те раздоры между императорской и духовной партиями, которые затем продолжались в течение многих веков. Императорская партия, призвавшая Оттона, как только Адальберт появился в Риме, заняла Иоаннополис и укрепилась в нем; папская партия, или националисты, предводимые Адальбертом и самим папой, одетым в шлем и броню, расположились в Леонине, Иоанн решил защищать Рим и двинулся к Тибру навстречу Оттону; но мужество скоро покинуло папу. Противная партия увеличивалась с каждым днем; народ, который некогда с такой решимостью отражал приступы Гуго, теперь трепетал при мысли об ужасах штурма. Боясь измены, папа, собрав церковные сокровища, бежал вместе с Адальбертом в Кампанью и здесь скрылся, вероятно, в Тиволи. Тогда приверженцы Иоанна сложили оружие и представили заложников, и 3 ноября 963 г. император во второй раз вступил в Рим.
Собрав духовенство, знать и вождей народа, Оттон заставил их всех принести клятву в том, что отныне они не будут ни посвящать, ни даже избирать папы без согласия его самого и его сына. Таким образом, Оттон лишил римлян того права, которое они сами всегда считали своим самым драгоценным правом и видели в нем единственное выражение независимости своего города, – права, посягать на которое не отваживались даже Каролинги. Право избрания верховного главы церкви принадлежало собственно всей христианской общине, а не небольшому числу римских избирателей. Привлечь к участию в выборах всех христиан, однако, не представлялось практической возможности. Поэтому избрание с незапамятных времен молчаливым соглашением было предоставлено Риму, или, вернее, каждый епископ Рима уже в силу того, что он был этим епископом, являлся и главой всей церкви. Такова была огромная привилегия, принадлежавшая духовенству, знати и народу Рима, и единственным ее ограничением раньше было только право императора как главы всего государства утверждать произведенные выборы.
6 ноября Оттон созвал собор в базилике Св. Петра. Как и при патриции Карле, предстояло под председательством светской власти произвести суд над обвиняемым папой; но Иоанн XII, в противность Льву III, не дал своего согласия на этот суд и не присутствовал на нем; точно также и епископы не отвергали своей компетентности судить лицо, занимающее апостольский престол. Времена оказались теперь иными; император в силу своей власти явился устроителем нарушенного церковного правления; беспощадно, перед лицом всего света выставил он позор папы, помазавшего его самого на царство, и призвал народ судить папу. Повинуясь велению императора, собор впервые судил и низложил папу, не выслушав его, и затем объявил его преемником кандидата, указанного императором.
Лиутпранд, бывший в то время епископом кремонским, излагает акты этого собора как очевидец; им отмечены все присутствовавшие на соборе епископы римской области, и мы узнаем отсюда, что очень древние епископства все еще продолжали существовать, несмотря на грабежи сарацин, по крайней мере, по имени. Из пригородных присутствовали епископы следующих мест: Albano, Ostia, Portus, Praenestae, Silva Candida и Sabina; далее – Gabium, Velletri, Forum Claudii (Oriolum), Bleda и Nepi, Cere, Tibur, Alatri и Anagni, Trevi, Ferentino, Norma и Veruli, Sutri, Narni, Gallese и Falerii, Orta и Terracina. Лиутпрандом отмечены только 13 кардиналов следующих церквей-титулов: Balbina, Anastasia, Lorenzo in Damaso, Chrysogonus, Equitius, Susanna, Pammachius, Galixtus, Caecilia, Lorenzo in Lucina, Sixtus, IV Coronatorum и Santa Sabina. Многие кардиналы последовали за бежавшим Иоанном, а некоторые церкви-титулы могли быть уже упраздненными. Историк называет в числе присутствовавших всех министров папского двора, диаконов и регионариев, нотариусов и даже примицерия цеха певчих. Еще более обращает на себя внимание упоминание о некоторых римских магнатах, среди которых мы встречаем имена, уже известные нам. Стефан, сын суперисты Иоанна, Димитрий, сын Мелиоза, Кресцентий Мраморная Лошадь (здесь впервые так названный), Иоанн Мизина (правильнее де Мизина), Стефан де Имиза, Феодор де Руфина, Иоанн де Примицерио, Лев де Казунули, Рихард, Петр де Канапара, Бенедикт и его сын Булгамин были в то время самыми знатными римлянами, принадлежавшими к императорской партии; другие знатные лица сопровождали папу в его бегстве или оставались в своих замках в Кампаньи. Представителями римского плебса являлись начальники милиции, главой которой был Петр, прозывавшийся Imperiola. Его присутствие, отмеченное особо, доказывает, что народ уже представлял организацию, обеспечивавшую ему некоторую самостоятельность; начало этой организации было положено Альбериком. Если бы последний даровал римлянам какую-либо конституцию, восстановил сенат и народных трибунов и учредил должности двух ежегодно назначаемых консулов, то все эти городские сановные должности не ускользнули бы от внимания такого наблюдателя, как Лиутпранд; но он ни одним звуком не упоминает ни о сенате и сенаторах, ни о Других лицах магистрата, а говорит только о городских вельможах, о милиции и ее начальнике как представителе «плебса» и затем перечисляет всех известных нам придворных сановников.