Пройдя плановый ремонт, 4-го июня 40-го года «Шарнхорст», «Гнейзенау» и «Адмирал Хиппер» вновь отправились к берегам Норвегии, чтобы начать операцию «Джуно» под командованием генерала-адмирала Вильгельма Маршала. Эскадру сопровождали четыре эсминца, два тральщика и два миноносца, а также танкер с горючим. Боевым заданием предстоящей операции кригсмарине предусматривалась атака английских кораблей в водном районе, примыкающем к городу Харстаду.
8-го июня тяжелому крейсеру «Адмирал Хиппер» удалось обнаружить и потопить английский траулер, а «Гнейзенау», действуя совместно с эсминцами, отправил на дно британский танкер. Поскольку небо прояснилось, для разведки с немецких кораблей запустили гидросамолеты и обнаружили новые цели, как на севере, так и на юге. Эскадра разделилась. «Адмирал Хиппер» с эсминцами ушел севернее, где вскоре потопил большое пассажирское судно «Орама», после чего проследовал в Тронхейм для заправки.
Ближе к вечеру наблюдатели с «Шарнхорста» обнаружили дымы на горизонте, а через некоторое время увидели британский авианосец, сопровождаемый двумя эсминцами. Оба линейных крейсера начали преследование. Причем, сначала немецким морякам казалось, что преследуют они авианосец типа «Арк Ройял» и лишь спустя некоторое время выяснилось, что это «Глориес», сопровождаемый эсминцами «Ардент» и «Акаста». Авианосец в этот момент занимался эвакуацией из Норвегии истребительных эскадрилий и не был готов к морскому бою. Из-за сильного ветра с него не запускали самолеты даже для воздушной разведки, а торпедоносцы, имеющиеся на борту, не были подготовлены к вылетам.
Немецкие корабли, делая 29 узлов при довольно значительном волнении, постепенно догоняли британский авианосец. К половине шестого бой уже начался. «Шарнхорст» главным калибром стрелял по «Глориесу» с дистанции двадцать пять километров, а «Гнейзенау» с четырнадцати километров отгонял противоминным калибром британский эсминец «Ардент», отправленный навстречу немецким кораблям для их распознавания. Уже на десятой минуте боя очередной залп «Шарнхорста» удачно поразил цель. Одиннадцатидюймовый снаряд пробил полетную палубу, взорвавшись в самолетном ангаре и вызвав пожар, что сделало запуск самолетов невозможным. А те самолеты, которые уже готовились к старту на полетной палубе взрывная волна смела за борт.
Таким образом, авианосец остался без своего главного оружия, которое составляли ударные самолеты. Без самолетов авианосец мог противопоставить преследователям только свои восемь пятидюймовых пушек. Такое же число орудий имели и оба эсминца вместе. Но, у эсминцев были еще и торпеды. «Акаста» спешно ставил дымовую завесу, а «Ардент» попробовал провести атаку на немецкие корабли, выпустив четыре торпеды. Но немцы их вовремя заметили и смогли уклониться. «Ардент», при этом, получил попадание снаряда в котельное отделение и, потеряв скорость, выставил дымовую завесу, укрывшись за ней.
Дым, поставленный «Акастой», мешал стрельбе, но немецкие линейные крейсеры применили новый метод прицеливания, используя радары, помимо оптических приборов, что позволило добиться следующих попаданий. Второе попадание оказалось смертельным для командования авианосца. Одиннадцатидюймовый снаряд разорвался прямо на мостике, разворотив всю надстройку и убив всех офицеров, находившихся там, включая командира авианосца Ойли-Хьюза. К шести часам вечера весь «Глориес» уже охватило пламя пожаров, хотя он все еще пытался спасаться бегством. Командование взял на себя старший офицер Ловелл.
В этот момент командир эсминца «Ардент» лейтенант-коммандер Баркер решил провести атаку последними четырьмя торпедами. Выскочив из-за дымовой завесы, эсминец произвел пуск торпед по немецким кораблям, подойдя ближе, чем в прошлый раз. Но, и от этого торпедного залпа линейным крейсерам тоже удалось уклониться. А сам эсминец попал в зону уверенного поражения противоминной артиллерией. Получив несколько попаданий, он потерял ход, и, охваченный пожарами, в 18:22 затонул.
Командир эсминца «Акаста» коммандер Гласферд, наблюдая гибель «Ардента» тоже предпринял торпедную атаку, на полном ходу перерезая курс немецких кораблей. Пытаясь точно попасть торпедами, эсминец сблизился с линейными крейсерами на критическую для себя дистанцию. Дав два залпа по четыре торпеды, «Акаста» получил множество попаданий, загорелся и, потеряв ход, начал тонуть, но продолжал стрелять из кормовых пушек до самого конца, пока не скрылся под водой в начале восьмого, через несколько минут после того, как на дно пошел «Глориес».
«Гнейзенау» снова удалось от торпед уклониться. Но, одна из торпед «Акасты» попала в правый борт «Шарнхорста» возле кормовой башни. Сорок восемь моряков при взрыве торпеды погибли, а две с половиной тысячи тонн воды хлынули в пробоину. Торпеда ударила в то место, где гребной вал проходил сквозь противоторпедную защиту. Затопленными оказались три десятка отсеков, а вал правого винта оказался поврежден очень сильно, часть его просто была уничтожена. Средний гребной вал тоже получил повреждения. Все это привело к тому, что линейный крейсер осел на корму на три метра и получил крен в три градуса на правый борт. Башня «Цезарь» тоже перестала действовать, а ее погреба затопило.
Поскольку британские корабли до самой своей гибели сообщали координаты, запрашивая помощь, «Шарнхорст» и «Гнейзенау» поторопились убраться с места боя в Тронхейм. На одном левом валу «Шарнхорст» мог выдавать не более двадцати узлов, но до порта дошел. К счастью для линейного крейсера, там имелся ремонтный корабль «Хаскаран», специалисты которого смогли временно подлатать «Шарнхорст».
Отбиваясь от английских бомбежек, за десять суток удалось отремонтировать приводы среднего гребного вала, после чего на двух валах со скоростью не более двадцати четырех узлов уйти в Киль, сделав по пути остановку в Ставангере. В Германии линейный крейсер долго ремонтировали. В новый поход «Шарнхорст» смог отправиться только в самом конце декабря под командованием адмирала Гюнтера Лютьенса. Но, из-за сильного шторма, когда вода заливала не только носовые оконечности, но и надстройки, а очень высокие волны угрожали повредить корпуса, начало рейдерской операции «Берлин» пришлось отложить. Однако, в конце января немецкие корабли уже находились в Северной Атлантике.
В проливах Каттегат и Скагеррак немецкую эскадру заметила английская агентура. И королевский флот в ночь на 26-е января вышел из Скапа-Флоу, чтобы не допустить прорыв немцев между Фарерскими островами и Исландией. Но, моряки кригсмарине вовремя обнаружили английские корабли с помощью радаров, что позволило им изменить курс и проскользнуть на океанский простор. Впрочем, до 22-го февраля успехов не было. Только в этот день в полутысяче миль к востоку от острова Ньюфаундленд «Шарнхорст» и «Гнейзенау» наткнулись на транспортный конвой. Суда пытались разбежаться, но, обнаруживая их при помощи гидросамолетов, линейные крейсера потопили некоторые из них. «Гнейзенау» отправил на дно четыре судна, а «Шарнхорст» потопил только один танкер.
Чтобы избежать возмездия от британских боевых кораблей, рейдеры отправились южнее, пытаясь блокировать маршрут из Кейптауна к Гибралтару севернее мыса Верде-Айлендс. Заправившись с танкеров у Азорских островов, 7-го марта неподалеку от африканского берега с «Шарнхорста» удалось обнаружить английский линкор «Малайа», имеющий восемь пятнадцатидюймовых орудий, охраняющий дюжину торговых судов. Это был конвой SL-67, который шел в метрополию.
Адмирал Лютьенс принял решение не вступать в бой с линкором, и распорядился навести на конвой подводные лодки, после чего U-124 и U-105, находящиеся поблизости, в ночь с 7-го на 8-е марта потопили несколько судов. Тем не менее, англичане обнаружили немецкие рейдеры с помощью гидросамолета, и линкор «Малайа» подошел на двадцать четыре километра. Орудия немецких кораблей уже вполне могли добивать до противника, но адмирал Лютьенс снова не решился вступать в боевое столкновение с линкором. Приказав увеличить ход до максимального, адмирал увел корабли в Центральную Атлантику. Попутно рейдеры потопили 9-го марта случайно подвернувшийся греческий пароход «Марафон».
