Утрата Холландии и Аитапе повышала моральную ответственность командующего 18-й армией. Учитывая оперативную ценность Холландии и особенно то влияние, которое окажет эта потеря на сферу непосредственной национальной обороны, он задумал без промедления отбить Холландию и Аитапе, сковать стремительное продвижение противника на запад и тем самым способствовать боевым действиям войск 2-го фронта. Свои силы, находившиеся к востоку от реки Сепик, 18-я армия быстро сосредоточила в окрестностях Вевака, и, хотя ее силы были истощены 1000-километровым маршем по непроходимым джунглям, она была полна решимости все поставить на карту и разгромить противника на подступах к Аитапе. 29 апреля план наступления был доведен до всех подразделений, и им было приказано начать подготовку. Эту решимость разделяли и одобряли войска 2-го фронта.

По принятой 18-й армией диспозиции 20-й и 41-й дивизиям вменялось в обязанность вести наступление на Аитапе, а 51-й дивизии — обеспечить базу в районе Вевака. Предполагалось, что армия завершит подготовку к наступлению до первой декады июня.

В апреле по распоряжению Ставки войскам 2-го фронта были приданы 35-я и 32-я дивизии.

В начале мая они погрузились на восемь транспортов и в сопровождении трех эскадренных миноносцев, нескольких охотников за подводными лодками и под прикрытием авиации двинулись в южном направлении. 6 мая в открытом море, северо-западнее Манадо, десант был атакован подводными лодками противника. Три транспорта («Атё Мару», «Тадзима Мару» и «Амацуяма Мару») были потоплены. 32-я дивизия потеряла пехотный полк и половину орудий, а 3 5-я — пехотный полк и большую часть орудий.

В период с 25 декабря 1943 года по 16 января 1944 года в районе Сарми высадились основные силы 36-й дивизии, переведенной из Северного Китая. Приданные ей подразделения прибыли к первой декаде марта. Местность, окружающая Сарми, представляет собой зону джунглей, обычных для Новой Гвинеи. Множество речушек, болот — все это резко ухудшало положение войск и препятствовало их действиям.

Задача дивизии состояла в том, чтобы «занять позиции на подступах к Сарми, во взаимодействии с военно-воздушными силами соорудить авиационные базы, разгромить в этом важном районе противника, который перейдет в наступление, и создать опорный пункт для решающих сражений в районе к северу от Австралии». Дивизия бросила свои основные силы в первую очередь на строительство аэродромов в пункте Савар и в районе нижнего течения реки Воске и одновременно прилагала усилия к тому, чтобы проложить пути сообщения и линии связи, соорудить пункты выгрузки военных материалов, склады и т. п. С 21 апреля этот район стал подвергаться непрерывным налетам вражеской авиации.

17 мая после трехчасовой бомбардировки и обстрела из корабельных орудий противник на 11 транспортах и 20 легких десантных судах, прикрываемых примерно 30 боевыми кораблями, приблизился к берегу и начал высадку десантов на о-вах Вакде и на противоположном от него берегу Новой Гвинеи — в пунктах Тоэм и Араре. 18 мая, как только прояснилась обстановка, командир дивизии приказал отдельному отряду Мацуяма перейти в наступление против десантных войск. Вечером 27 мая отдельный отряд Мацуяма после бомбовых ударов, нанесенных 7-й авиадивизией, атаковал противника на ближних подступах к р. Тор, вышел на морское побережье и открыл огонь по войскам, отходившим на десантных судах в направлении о-вов Вакде. В тот же день 223-й пехотный полк начал подготовку к лобовой атаке на подступах к Араре. 30 мая отдельные подразделения полка после ночной атаки ворвались в расположение войск противника, уничтожили артиллерийские и самоходные орудия. Ночью 2 июня противник был оттеснен к устью р. Тор. Однако его сопротивление становилось все более упорным. 6 июня он возобновил наступление на левом берегу Тора, и в конце концов этот район снова оказался в руках его превосходящих сил.

Тем временем в период с последней декады мая до второй декады июня войска, отходившие из района Холландии, минуя верхнее течение р. Тор, стали прибывать в окрестности Сарми. Однако это была только часть войск, сумевших преодолеть естественные препятствия, пережить голод и эпидемии за время 400-километрового перехода.

Спустя десять дней после высадки десанта на подступах к Сарми, а именно 27 мая, противник начал высадку на о. Биак. Развернувшиеся здесь боевые действия означали поворотный момент в положении на фронте к северу от Австралии.

С 25 декабря 1943 года на о. Биак был дислоцирован отдельный отряд, выделенный из состава 36-й дивизии и непосредственно подчинявшийся 2-й армии. В этот отдельный отряд входили большая часть 222-го пехотного полка, часть тыловых войск дивизии, батарея целевых зенитных орудий, три аэродромно-строительных отряда, служба тыла непосредственного армейского подчинения и авиационное подразделение участка обороны. Кроме того, в состав отдельного отряда входил 19-й охранный отряд.

Остров Биак представлял собой важный опорный пункт 2-го фронта. Поэтому первоочередное внимание было уделено подготовке к бою авиации.

Однако к этому времени 6-я авиационная дивизия была почти полностью уничтожена в действиях к востоку от Холландии, и даже 7-я авиационная дивизия располагала только 40–50 боеспособными самолетами и нуждалась в пополнении. Действовавшая на этом направлении 23-я воздушная флотилия тоже имела не более 20 самолетов.

Начиная с первой декады мая противник стал подвергать о. Биак непрерывным бомбардировкам, а 27 мая обрушил на юго-восточное побережье острова бомбовые удары, огонь корабельной артиллерии и в окрестностях Босника начал высадку десанта с танков-амфибий и десантных кораблей. В море было обнаружено около 40 десантных судов. Прибывший на остров как раз в это время для инспекции начальник штаба фронта собирался покинуть Биак, однако, увидев обстановку, решил остаться на некоторое время, чтобы лично руководить боевыми действиями.

В этот день в отражении десанта приняли участие 7-я авиационная дивизия и 23-я воздушная флотилия, хотя они понесли потери, но сумели тем не менее добиться значительных результатов.

На тему о том, в каких пределах использовать военно-воздушные силы в противодесантных действиях на о. Биак, разгорелась острая дискуссия в штабе главнокомандующего Южной группой армий. В конце концов было решено оказать острову поддержку силами 7-й авиадивизии. В тот же день и военно-морской флот принял решение направить 90 самолетов 1-го воздушного флота из района Палау в район Хальмахера для отражения десанта.

Признавая важность о. Биак, командование Южной группы армий собиралось в будущем выделить из стратегических резервов и перебросить в этот район 2-ю морскую мобильную бригаду, располагавшуюся в Замбоанга (западная оконечность о. Минданао), и обсуждало этот вопрос с командованием Юго-Западного флота. Однако, как только поступило известие о высадке десанта противника на о. Биак, споры были немедленно прекращены и Ставка дала согласие на это решение.

Боевые действия на о. Биак наряду с операцией «А» стали в данный момент стержневой операцией.

С 31 мая командование Южной группой армий подчинило 2-му фронту 2-ю морскую мобильную бригаду, а командование 2-го фронта придало ее 2-й армии. Командование военно-морского флота решило превратить 16-й боевой отряд в транспортную группу, 5-ю дивизию крейсеров и четыре эскадренных миноносца — в охранный отряд, а линейный корабль «Фусо» и два эсминца — в резервный конвойный отряд. 1 июня главные силы бросили якорь в Давао. Командир 2-й морской мобильной бригады контр-адмирал Тамада, командир 16-го боевого отряда контр-адмирал Сакон Макото и старшие штабные офицеры из Южной группы армий, Юго-Западного флота, от войск 2-го фронта и 2-й армии устроили совещание и пришли к соглашению о высадке контрдесанта 4 июня в районе Корима, на северном берегу о. Биак. Корабли снялись с якоря и отправились из Давао в район десантирования. В то время эту операцию по вторжению на о. Биак называли операцией единения.