Однако летом 1826 года персы возобновляют военные действия против России, и Аббас-Мирза во главе огромной армии входит в Карабах. В это же время персидский хан Еревана пытается вернуть армянские области, перешедшие к русским. Эта очередная, четвертая русско-персидская война продлится два года (1826-1828). Вначале персы отвоевывают Гюмри и Гандзак, что, казалось бы, свидетельствует об их намерении продвигаться дальше на Тифлис, чтобы впоследствии возвратить себе грузинские и армянские территории, освобожденные русскими.

Но вновь Армянская церковь встает на защиту народа. С благословения и при поддержке высшего духовенства многие армяне записываются добровольцами в русские войска. В 1827 году армянский епископ Тифлиса Нерсес из Аштарака (или Аштаракеци), который через некоторое время станет католикосом, пишет Воззвание к армянскому народу. Он призывает всех, не жалея себя, встать на защиту родины. Истинный патриот, необычайно деятельный человек, настоящий армянский Гарибальди, он лично встает во главе армян, присоединившихся к русскому наступлению.

И вот, несмотря на жестокую, сорокавосьмидневную осаду, персам так и не удается взять крепость города Шуши, в героической обороне которой, бок о бок с малочисленным гарнизоном из 350 солдат принимали участие даже женщины и дети. 3 сентября 1826 года русско-армянское двухтысячное подразделение побеждает персидский передовой отряд из 10 000 человек и освобождает город Гандзак.

В апреле 1827 года русские войска под командованием генерала Паскевича и армянские добровольцы во главе с архиепископом Нерсесом входят в Эчмиадзин; в июне они завоевывают Нахичеван, а 1 октября 1827 года, после трехмесячной осады, освобождают, наконец, и Ереван. Паскевич готов идти дальше на Тегеран, но тут шах объявляет о готовности уступить России свои армянские территории, и на этом война заканчивается.

По Туркменчайскому договору (февраль 1828), подписанному благодаря посредничеству русского писателя А.С. Грибоедова, который в ту пору был послом в Персии, Россия официально получила от шаха Ереванскую, Нахичеванскую и Вагаршапатскую области, а также весомую контрибуцию в двадцать миллионов рублей. Таким образом, вся Восточная Армения была освобождена от персов и вошла в состав Российской империи.

Но в апреле 1828 года, через два месяца после заключения мира с персами, Россия объявляет войну туркам, поддерживая греков, поднявших восстание против султана. Русско-турецкая война 1828-1829 годов проходит на Балканах и на Кавказе. Россия занимает почти все армянские территории Турции, за исключением Вана и юго-запада древней Армении. Однако в конце конфликта, согласно условиям Адрианопольского мира (1829), по которому Турция признала независимость Греции, царским войскам приходится покинуть завоеванные армянские земли на территории Турции. Дело в том, что западные державы поддерживали Османскую империю и, главное, с большим неудовольствием наблюдали за постоянным усилением международного влияния русских царей. Тем не менее, России удается поставить перед турками условие, чтобы армяне из Османской империи в течение восемнадцати месяцев могли переселяться в Восточную Армению или в другие части Российской империи.

Такое же условие относительно армян, проживавших в Иране, Россия поставила перед персами. Итак, незамедлительно тысячи армянских семей, находившихся в опасности, бегут под защитой русских в Восточную Армению. На протяжении всего XIX века около 150 000 армян, подданных Персидской и Османской империй, переселяются на армянские территории, подвластные русскому царю: в Ахалкалак, Ширак, Ереван и Севан. Однако примерно половина беженцев так и не достигает места назначения, погибнув от голода и переутомления на дорогах, ведущих в Россию.

И все же, благодаря этим мерам, историческая Армения стала быстро заселяться. Среди наиболее активных организаторов миграции армянского населения был все тот же Грибоедов вместе с архиепископом Эрзерума Карапетом Багратуни. Царское правительство наделило новых армянских поселенцев землями и на пять лет освободило от налогов.

С середины XIX века Восточная Армения, завоеванная Россией, во всем будет делить судьбу царской империи.

Армяне считали русские завоевания не оккупацией, а, скорее, освобождением. Люди относились к русским как к освободителям и христианским защитникам от мусульманского угнетения, тем более, что во главе царских войск на Кавказе стояли армянские генералы, такие как Лазарев и Тер-Гукасов, или Мадатов, выходец из Карабаха. Пушкин, в 1829 году принимавший участие в турецкой кампании генерала Паскевича и в освобождении городов Карс и Эрзерум, передал нам ликование армянского населения при въезде русских солдат в Эрзерум: «Мы въехали в город, представлявший удивительную картину. Турки с плоских кровель своих угрюмо смотрели на нас. Армяне шумно толпились в тесных улицах. Их мальчишки бежали перед нашими лошадьми, крестясь и повторяя: "Християн! Християн!.."» (Путешествие в Арзрум).

Позднее, во время русско-турецкой войны 1877-1878 годов, русские войска на Кавказе, взявшие Карс и Эрзерум, возглавлял прославленный армянский генерал Лорис-Меликов (Меликян). Лорис-Меликов был не только доблестным полководцем, но и весьма талантливым государственным деятелем. Он занимал пост министра внутренних дел (с полномочиями первого министра) при Александре II. Чтобы остановить распространение терроризма, он провел ряд либеральных мер и подготовил план постепенного перехода к конституционной монархии. Царь принял реформы и проект конституции, предложенный Меликовым, 1/13 марта 1881 года, но был убит в этот же самый день, через несколько часов после того, как наложил положительную резолюцию.

Его преемник Александр III окружил себя министрами и советниками крайне консервативных воззрений. Среди них был и юрист Константин Победоносцев. Под влиянием этих лиц новый царь начал свое правление с обнародования манифеста, превозносившего самодержавие, отправил в отставку Лорис-Меликова и стал проводить политику жесточайшего противодействия любым реформам. И если такой нещадный консерватизм, как известно, был пагубным для Российской империи в целом, то не менее губительным, как мы увидим, он оказался и для армянских общин.

Появление «Русской Армении», то есть Армении, входившей в состав христианской империи, означало выход армянского народа из исторической изоляции среди исламских народов. В самом деле, Армения с XI века была частью исламских империй, и все соседние страны, за исключением Грузии, были мусульманскими. Конечно же, и по этой причине армяне проявляли большую верность русским царям, чем другие завоеванные кавказские народы.

С другой стороны, несмотря на то, что в свое время Николай I обещал предоставить Армении политическое самоуправление, завоеванные армянские территории становятся русскими провинциями, во всем похожими на другие провинции империи. В первое время, в 1828 году, учреждается Армянская область, включающая значительную часть исторической Армении, но без Карабаха и Лори. Во временный Совет управления территорией входит и армянский архиепископ Тифлиса Нерсес Аштаракеци (1770-1857), защитник национальных интересов, который лично участвовал в войне с персами в 1827 году и получил от России точные ручательства, что Армении будет предоставлено самоуправление.

Однако весьма скоро русские начинают проводить политику ассимиляции Армении. В 1836 году царское правительство закрывает множество армянских школ. Архиепископ Нерсес, основавший в 1824 году в Тифлисе знаменитый лицей Нерсесяна, ведет активную борьбу с русификацией, навязываемой царским режимом. Его незамедлительно ссылают в Бессарабию. Впрочем, впоследствии, в 1843 году, он становится католикосом под именем Нерсеса V.