Окружение Марии подстрекало ее к побегу и бунту против сына, ее главными союзниками были флорентийский аббат Ручеллаи и бывший член Католической лиги герцог д’Эпернон, у которого возникли некоторые разногласия с королем. С их помощью в ночь на 22 февраля 1619 года Мария Медичи совершила свой знаменитый побег из окна замка Блуа по веревочным лестницам. Ей уже было 44 года, она не была такой худенькой, как в юности – королева располнела за эти годы из-за своего пристрастия к сладостям. В побеге Марии помогали приближенные герцога д’Эпернона графы Дюплесси и де Бренн, сам герцог ждал ее в Лоше. С собой она прихватила немного платьев и большую часть драгоценностей, но одну шкатулку потеряла по дороге. Де Бренн приготовил карету на берегу реки Луары недалеко от замка, и в 6 часов утра они вместе с Дюплесси помогали королеве спуститься с высоты около 40 метров по веревочной лестнице. Первую часть спуска королева храбро преодолела сама, со всеми своими платьями и шкатулками с украшениями. Но когда добралась до террасы – силы ее оставили, и она отказалась наотрез спускаться дальше. Пришлось завернуть Марию вместе со всеми ее вещами в одеяло, обвязать веревкой, которая еле выдерживала такую тяжесть, и таким образом спустить ее к подножию стены. После этого они быстро добрались до кареты и выехали в Лош. А оттуда Мария Медичи вместе с герцогом д’Эперноном добрались до Ангулема, где стояли его войска.

В Париже только на следующий день стало известно о побеге королевы-матери из Блуа. Людовик XIII от ярости рвал и метал, искал виновных, чтобы достойно их наказать. Сначала он хотел воевать с матерью, но потом решил сделать попытку примирения через посредника – епископа Ришелье. Он отправил ему приказ выехать из Авиньона в Ангулем и встретиться там с Марией Медичи. Королева хочет одного – власти, но Людовик к тому времени уже успел завоевать уважение подданных своими методами правления, как настоящий сын Генриха IV. Это уже не робкий, заикающийся подросток, это король, поэтому и вести он себя будет по-королевски.

Приехавший в Ангулем Ришелье убеждает Марию начать переговоры с сыном и принять его условия. Людовик предлагал матери вернуться в Париж ко двору, занять снова свои прежние апартаменты в Лувре и получать то же самое содержание. При этом ей возвращали все ее наряды и драгоценности, а также сын обязался уплатить ее долги. Но она не должна была пытаться оспаривать его власть, а вести себя именно как королева-мать. Мария принимает предложение короля, а Ришелье получает должность канцлера. С этого момента королева полностью доверяет Ришелье. Так был заключен Ангулемский мир, который положил конец первой войне между матерью и сыном.

В Париж Мария Медичи не спешит, она согласилась на встречу с сыном в замке Кузьера, куда приехала заранее. Король приехал туда на следующий день, и они встретились в парке замка на большой аллее. После письменного примирения состоялось личное. Людовик вел себя как почтительный и любящий сын, а Мария – как снисходительная мать, которая прощает своему ребенку его шалости. Вместе с королем прибыла его жена Анна Австрийская, и все вместе они отправились в Тур. Мария была неприятно поражена тем, что сын не пытается поговорить с ней с глазу на глаз, всегда в присутствии Анны. Она чувствует, что Людовик XIII что-то скрывает, и сама становится подозрительной. Королева-мать снова хотела безраздельной власти, вкус которой уже успела почувствовать во времена регентства. Но оказалось, что сын не собирается допускать ее в Королевский совет, на что Мария так надеялась. Власть для нее стала навязчивой идеей, как опиум, который один раз попробуешь – и уже жить без него не можешь. Но как раз этого Людовик XIII не собирался больше допустить – он не хотел делить власть со своей матерью.

Мария наотрез отказалась возвращаться в Париж. Вместо этого она пожелала отправиться в Анжер, губернаторство, которое получила от сына. Оттуда посыпались ее претензии королю: не оплатили ее долги, не поставили ее в известность о бракосочетании дочери Кристины, выделенные ей апартаменты ее не устраивают и так далее. Канцлер Ришелье во всем поддерживал Марию и умело разжигал вражду между матерью и сыном. Новая война между матерью и сыном началась 7 июля 1620 года, когда произошло сражение при городке Пон де Се между войсками королевы-матери и Людовика XIII. Битва длилась всего три часа, и армия короля одержала победу. Мирные переговоры от имени Марии Медичи теперь ведет сам канцлер Ришелье, который добивается для нее новых привилегий. Снова состоялась церемония примирения в замке Бриссак, только теперь она была уже более холодной. Епископ Ришелье выступал посредником и стремился угодить Людовику XIII, но при этом старался остаться верным слугой Марии Медичи. Благодаря своим миротворческим талантам, осторожности и гибкости Ришелье получил обещание короля добиться для него сана кардинала.

Переговоры завершились 10 августа подписанием Анжерского мирного договора, и королева-мать возвращается в Париж через три года после своей ссылки. Главной целью Марии было попасть в королевский совет, но Людовик пока ее туда не допускает. Наконец, король идет на некоторые уступки и разрешает матери иногда присутствовать на заседаниях совета, но не позволяет участвовать в особо важных делах. Марию это мало устраивает, она очень разочарована, но пока приходится мириться.

Между тем королева-мать снова занимается благоустройством своего любимого Люксембургского дворца, работы над которым были прерваны после ее изгнания. Когда строительство здания было завершено, Мария Медичи решает закрыть пространство между окнами живописными полотнами. Она вызывает в Париж известного живописца фламандского барокко Питера Пауля Рубенса, с которым познакомилась еще на собственной свадьбе, и заказывает ему две серии картин на темы «Триумф Марии Медичи» и «Триумф Генриха IV». Художнику удалось выполнить только часть задуманного цикла. Первую серию он написал полностью – 24 больших полотна в настоящее время являются частью коллекции Лувра. Лучшими из них считаются картины: «Прибытие Марии Медичи в Марсель», «Свадьба во Флоренции» и «Коронация Марии Медичи». Следующий цикл в честь Генриха IV Рубенс только начал писать и уже закончил семь полотен, когда столкнулся с проблемами оплаты. Потом ему отменили заказ, и эта серия осталась незавершенной. Две картины из цикла о жизни короля «Битва при Иври» и «Торжественный въезд Генриха IV в Париж» в настоящее время находятся во флорентийской галерее Уффици.

Мария закупает еще больше участков земли и становится хозяйкой поместья площадью 24 гектара. Она активно занимается обустройством сада: по ее заказу высаживают деревья, кусты, клумбы с цветами, строят террасы, устанавливают фонтаны. Некоторые вязы, посаженные при Марии Медичи, сохранились до сих пор. Для своих младших детей, Гастона Орлеанского и Генриетты Марии, она устраивает в садах небольшой зоопарк с животными. Особняк Мария обставляет мебелью и украшает гобеленами по своему вкусу.

После смерти королевы в 1642 году в Люксембургском дворце жили герцоги Орлеанские: сын Марии Гастон и его старшая дочь Анна Мария Луиза Орлеанская, герцогиня де Монпансье, по прозвищу «Великая Мадемуазель». Дело в том, что она долго не выходила замуж, пока не сочеталась тайным браком с Антоненом Номпаром де Комоном, герцог де Лозен. Ее кузен король Людовик XIV этот брак не признал законным. В 1778 году Людовик XVI передал дворец с садом своему брату, будущему королю Людовику XVIII. Сейчас в Люксембургском дворце заседает сенат Франции.

Наступили мирные годы, когда царило полное согласие между Марией, Людовиком и Ришелье. 5 сентября 1622 года Арман дю Плесси получил сан кардинала Римско-католической церкви по протекции Людовика XIII. На окончательное решение короля в значительной степени повлияла Мария Медичи, которая активно хлопотала за своего любимца. После этого кардинал Ришелье стал активно появляться при дворе и участвовать в политических интригах. Положение в государстве было плачевным из-за разногласий католиков и гугенотов, и Людовику XIII был нужен человек, способный найти выход из тупика. Таким человеком оказался Ришелье. Мария способствовала введению кардинала в Королевский совет 29 апреля 1624 года. Ее целью было получить там союзника для своего возвращения в правительство. А 13 августа 1624 года Арман дю Плесси де Ришелье становится номинальным главой Совета и первым министром короля. Он добился высокого положения и с этого момента стремился отдалиться от королевы-матери, чтобы максимально приблизиться к монарху.