В апреле 1631 года умирает Франческо Мария II делла Ровере, и по закону его внучка должна была унаследовать герцогство Урбинское. Но в это дело вмешался римский папа Урбан VIII, который решил вернуть Урбино Папской области. Две вдовствующие герцогини не осмелились выступить против решения понтифика, и герцогство было для них потеряно. Взамен Виктория делла Ровере и семейство Медичи получили во владение все имущество ее предков, среди которых было богатейшее собрание картин вымершего рода. Среди них знаменитые полотна Тициана Вечеллио: «Венера Урбинская», «Венера и Купидон», ранняя «Мария Магдалина» с роскошными рыжими волосами, которые едва прикрывают обнаженное тело, «Флора», портреты предков Виктории герцогов Урбинских Франческо Мария I делла Ровере и его жены Элеоноры Гонзага.

Из произведений Рафаэля Санти в приданом Виктории были: портреты герцогов Урбинских Гвидобальдо да Монтефельтро и Елизаветы Гонзага, портрет папы Юлия II, картина «Молодой человек с яблоком» и диптих (двойной портрет) работы художника Пьеро делла Франческа, на котором изображены герцог Федерико да Монтефельтро и его жена Баттиста Сфорца. Это первые реалистичные портреты в профиль эпохи зрелого Ренессанса, они были написаны в 1472–1477 годах. Таким образом, благодаря этому браку коллекция Медичи существенно пополнилась шедеврами живописи. Сегодня они являются одной из величайших жемчужин галереи Уффици и Палатинской галереи дворца Питти. Кроме коллекции живописи во Флоренцию привезли множество драгоценностей, мебель и обстановку, которые принадлежали династии делла Ровере.

О свадьбе герцога Фердинанда II Медичи со своей двоюродной сестрой Викторией делла Ровере было официально объявлено только в 1634 году, уже после смерти ее деда и матери Фердинанда Марии Магдалины Австрийской. Но бракосочетание состоялось через три года, 6 апреля 1637 года, когда невесте было 15 лет, а жениху – 27. По случаю свадьбы была организована обычная череда праздников, банкетов, турниров и театральных представлений. Самым интересным из них было шоу «Освобождение Иерусалима», которое состоялось в только что законченном амфитеатре в саду Боболи. В декабре того же года умерла Кристина Лотарингская, и на следующий год Виктория была коронована как великая герцогиня Тосканы.

Их брак оказался несчастливым: религиозная и высоконравственная Виктория совершенно не разделяла научных интересов своего мужа, ей абсолютно не нравился тот образ жизни, который вел великий герцог. Он был веселым и легким в общении человеком с разносторонними интересами, галантным кавалером с тонким чувством юмора. Фердинанд любил завязывать любовные интрижки, но не с хорошенькими женщинами, а со своими молодыми и красивыми пажами. У него были обнаружены гомосексуальные наклонности, которые не замечали или не хотели замечать его мать и бабушка.

Рассказывают такую историю: однажды его мать Мария Магдалина принесла ему длинный список советников и придворных, которые были замечены в содомии. Она положила перечень перед ним и спросила, что герцог намеревается с этим делать. Фердинанд внимательно прочитал список и заметил, что там не хватает одного имени. Герцогиня спросила: «Какое?» Тогда Фердинанд взял перо и добавил в конце перечня свое собственное имя. Мария Магдалина не смутилась: она решила, что у ее сына слишком доброе сердце, и таким образом он хочет защитить своих подданных. На ее повторный вопрос о том, что же он собирается предпринять, Фердинанд ответил встречным вопросом: «А что бы вы предприняли, матушка?» Герцогиня ответила, что подобные извращенцы заслуживают только смертной казни путем сожжения живьем на костре. Фердинанд взял список, бросил его в огонь камина и сказал: «Ваша воля выполнена, государыня».

Первые несколько лет супружеской жизни Фердинанд исправно старался выполнить свой супружеский долг с целью произвести на свет наследника престола. К несчастью, Виктории очень трудно давались роды, несмотря на пышную фигуру с широкими бедрами. В 1639 году она родила сына Козимо, который умер через два дня. Следующей родилась дочь, которая умерла сразу же после рождения, ей даже имени дать не успели. Надпись на ее маленькой могиле в капелле герцогов переводится с латыни: «Тот, кто читает, пусть не спрашивает моего имени. Я была дочерью великого герцога Тосканы. Крещеная после вступления в жизнь, я сразу же счастливо искала пути небесные». Наконец, в 1642 году, после долгих и тяжелых родов, появился на свет их второй сын Козимо. Он выжил и стал наследником престола, а затем и шестым, предпоследним герцогом Тосканы из рода Медичи под именем Козимо III.

Вскоре после этого Виктория случайно застала мужа в постели с его молодым любовником, пажом Бруто делла Молара, и прекратила с ним отношения. Она часто уезжала на виллу в Поджо-а-Кайано, жила с мужем врозь и занималась воспитанием сына. Весь в отца, мягкий и слабохарактерный, Фердинанд Медичи сначала был под каблуком своей матери и бабушки, а после их смерти оказался под сильным влиянием своей властной жены. Он хотел дать сыну современное светское образование и обучать его наукам, но Виктория настояла на религиозном воспитании и в этом победила. После долгих ссор и споров герцог махнул рукой и позволил жене воспитывать сына так, как она сама считает нужным. Для Фердинанда было важнее всего, чтобы не было скандалов, которые он не переносил.

Примерно через 17 лет после рождения Козимо они однажды сошлись в спальне, непонятно каким образом. Скорее всего, Виктория сочла своим долгом произвести на свет еще одного потомка рода Медичи, чтобы в случае смерти первого был другой наследник престола. Так 12 ноября 1660 года родился их второй и последний сын Франческо Мария Медичи, который был на 18 лет младше своего брата Козимо. 38-летняя Виктория чудом выдержала роды и вновь прекратила супружеские отношения с мужем, теперь уже навсегда. Франческо Мария был ее любимчиком, она его баловала и воспитала тоже в религиозном духе. Впоследствии он стал кардиналом, был в хороших отношениях со своим старшим братом и племянниками, которые были ненамного его младше. От имени Фердинанда кардинал Франческо Мария управлял Сиеной, был любителем искусства и меценатом. Он скончался в 1711 году в возрасте 50 лет.

Правление Фердинанда II Медичи было самым мирным за всю историю герцогства Тосканского, великий герцог избегал войн и кровопролитных сражений. Так же, как и его отец Козимо II, он предпочитал умело лавировать между Францией, Австрией, Испанией и Папским государством. Ему нравилось дружить со всеми, не ссориться и не вступать в конфликты ни с кем. Фердинанд старался устраивать праздники и развлечения для народа, но они были уже бледной тенью прежних церемоний, которые устраивали его предки. Проблема была в отсутствии достаточной суммы денег в герцогской казне. Как только Фердинанд достиг совершеннолетия, он позволил матери и бабушке запустить туда руки, чем они немедленно воспользовались и накупили драгоценностей. Чтобы справиться с серьезным финансовым положением, великий герцог предпринял попытку реорганизовать налоговую систему, а в 1649 году распустил часть флота, чтобы не платить за его содержание.

Подданные любили Фердинанда за кроткий и мягкий характер. Кроме того, когда герцог начал управлять государством самостоятельно, он сократил расходы двора и значительно упростил этикет. Его популярность еще более возросла, когда во время эпидемии чумы 1630–1633 годов, в отличие от многих других представителей знати и правительства, Фердинанд со своими братьями помогал населению и лично раздавал милостыню. За четыре года до этого 16-летний герцог перенес оспу и выжил – в те времена это было просто чудо. Художник Юстус Сустерманс написал тогда два его портрета, на которых видна сыпь на лице, а на другом сыпь настолько сильная, что у принца даже не открывались глаза. Эти портреты находятся в запасниках галереи Уффици, их не выставляют, потому что они неэстетичны. Когда Фердинанда спросили, не боится ли он заразиться чумой, он ответил, что после оспы ему уже ничего не страшно. После эпидемии чумы и нескольких лет неурожая в Тоскане наступил глубокий экономический кризис. Несмотря на это, герцог продолжил осушение болот Мареммы и долины Кьяны в области Ареццо и занимался оздоровлением территории всей Тосканы. Он заботился о сельскохозяйственном производстве, в частности о производстве вин, масел и шелка-сырца.