В 608 году армянский католикос Абраам издал «Всеобщую эпистолу» (письменное послание), положившую конец всем отношениям между грузинской и армянской церквами.

Вскоре Иран добился больших преимуществ в войне с Византией и перешел к активному преследованию диофизитства. Кирион и эрисмтавар Адарнасе вынуждены были покинуть Картли. Кирион продолжил свою деятельность в Фазисе в сане митрополита.

Следует отметить, что хотя после учреждения католикосата картлийская церковь стала автокефальной, еще в течение определенного времени избираемого картлийским церковным собором католикоса утверждал патриарх Антиохии. Первым католикосом, которому не потребовалось утверждения патриархом Антиохии, был Григол II, церковный деятель 60-ых годах VIII века.

В 60–80-ых годах IX века во главе церкви стоял Арсен I Диди (из Сапары). Он был воспитанником учеников Григола Хандзтели. Григол Хандзтели сам поддержал Арсена I на должность католикоса. Арсену принадлежит сочинение, написанное на тему грузинско-армянского церковного раскола.

IX–X века – это период борьбы за объединение Грузии.

Постепенно в этой борьбе первенство захватило Абхазское царство. Одним из факторов, препятствующих объединению Грузии было то, что Западная Грузия в церковном отношении подчинялась Константинопольскому патриарху и поэтому испытывала влияние Византийской империи. В первой половине X века длительная борьба абхазских царей принесла свои плоды. Первоначально из подчинения Константинопольскому патриархату вышли западногрузинские епархии и объединились вокруг абхазского (западногрузинского) католикоса. На следующем этапе объединенная западногрузинская церковь подчинилась Мцхетскому католикосу. Таким образом произошло церковное объединение Грузии.

Первым патриархом объединенной грузинской церкви был Мелхиседек I. Он величался «Святейшим и блаженнейшим католикосом-патриархом всея Грузии». При его активном участии был построен Мцхетский храм Светицховели. Он часто бывал в Константинополе, повидимому, с определенной дипломатической миссией.

В 60-ых годах XI века в Грузию по приглашению Баграта IV-го приехал Георгий Мтацминдели. Тяжелая политическая ситуация в стране не позволила Георгию Мтацминдели и Баграту IV довести церковную реформу до конца. Этим делом занялся Давид IV Агмашенебели. Серьезным шагом в этом направлении был созыв Руис-Урбнисского церковного собора в 1103 году, на котором помимо решения о смещении недостойных духовных лиц было принято еще около десяти важных решений. В этот период католикосом-патриархом был Иоанэ VI.

Большим влиянием и авторитетом пользовался католикос-патриарх Николоз Гулаберисдзе, ставший католикосом в 50-ых годах XII века. В 1178 году Николоз отправился в Иерусалим. Перед этой поездкой он побывал в Афонском Иверском монастыре и разрешил здесь многие проблемы. В Иерусалиме он многое сделал для усиления Крестового монастыря (вернул ей земли). В 1178 г. Георгий III освободил церковь от налогов и присвоил ей статус неприкосновенности. Николоз Гулаберисдзе вернулся из Иерусалима после того, как царица Тамар призвала его для участия в церковном соборе. На этом соборе были смещены некоторые недостойные епископы и определены новые церковные правила.

В 1213 году (по некоторым данным в 1207 или 1210 г.) на грузинский царский престол вступил сын царицы Тамар Георгий IV. У Георгия было и другое имя – Лаша, поэтому в историю он вошел под двумя именами: Георгий-Лаша. После смерти Тамар и с приходом к власти молодого царя вассальные страны стали выходить из повиновения Грузии. Первой о своем отказе от уплаты дани заявила Гандза. Необходимо было как можно быстрее подчинить ее вновь, дабы другие вассальные страны не последовали ее примеру. По решению амирспасалара Иванэ Мхаргрдзели грузинское войско осадило Гандзу. Однако осада затянулась, а Георгий-Лаша, повидимому, спешил и перешел к активным военным операциям. Вместе с 4 тысячами воинов царь решил пойти в обход города. Увидев, что Георгий-Лаша с малочисленным войском отделился от основных сил, гандзинцы открыли городские ворота и напали на грузин. Однако царь не дрогнул перед многочисленным врагом. Разгорелась ожесточенная борьба. Вскоре к царскому войску присоединилась и основная часть. Гандзинцы отступили назад и вновь заперлись в городе. После боя Иванэ Мхаргрдзели упрекнул царя в поспешных и самовольных действиях. Осада города продолжалась. Гандзинский атабаг вынужден был вновь подчиниться грузинскому царю и попрежнему платить ему дань.

Инцидент у Гандзы был первым проявлением противоречий между царем и дидебулами. Позднее эти противоречия еще более углубились. Дело в том, что Георгий-Лаша, как видно, был довольно свободной личностью. Его убеждения и стремления в определенной мере были неприемлемыми для современного ему общества. К тому же, царь, подобно своему славному предку Давиду Агмашенебели, собирался править единолично и с интересами дидебулов не особенно считался. Георгий-Лаша окружил себя сверстниками риндами. Среди ученых нет единого мнения о том, кем были ринды и чем они занимались. Само слово «ринди» по-персидски означает пьяницу, буяна. Однако, упомянутые летописцем ринды, вероятно, являлись представителями одного из распространенных на Востоке религиозно-философских течений.

Дидебулы грубо вмешивались в личную жизнь царя. Когда Георгий IV привел в жены женщину низкого происхождения и притом замужнюю, он тем самым нарушил вековую традицию: цари единой Грузии приводили в жены представительниц царского рода из соседних государств. У царя родился сын Давид от любимой женщины, но как незаконный наследник он никогда бы не смог занять царский престол. Спустя несколько лет, дидебулы и духовные лица разлучили царя с этой женщиной и вернули ее мужу. Георгий-Лаша до конца жизни остался верен своей любви и не женился вообще.

Противоречия внутри царского двора, естественно, отражались и на общем положении страны. Тем не менее Грузия оставалась одной из сильных государств на Ближнем Востоке. Крестоносцы с надеждой взирали на Грузию и ждали от нее помощи. В 1217 году начался пятый крестовый поход и продлился 4 года. Грузины серьезно готовились принять участие в этом походе, но неожиданное появление монголов у границ Грузии помешало им.

Монголы жили в Центральной Азии. Начиная с X века, в их стране родовой строй начал разлагаться. В 1206 году на своем собрании (курултаи) монголы избрали хана Темучина, названного ими Чингисом. Чингис-хан провел крупную военно-административную реформу и разделил монголов на тысячные (каждая такая единица обязана была вывести 1000 воинов). У самого Чингис-хана была стотысячная гвардия, в которой была установлена железная дисциплина. Военно-стратегическая тактика монголов включала в себя следующие основные элементы: предварительная разведка, заманивание неприятеля, быстрое маневрирование и уничтожение военных сил врага в отдельности, по частям. Монголы во главе с Чингис-ханом быстро завоевали Сибирь и Китай (заняли его столицу Пекин).

В 1219 году монголы появились уже в Средней Азии, где они столкнулись с Хорезмским царством.

Хорезмское царство в конце XII века освободилось от господства сельджуков и особенно усилилось при шахе Мухаммеде (1180–1120). При нем Хорезмское царство охватывало Среднюю Азию, Северный Иран, часть Афганистана. Вассалом хорезмского шаха был азербайджанский атабаг Узбег. Несмотря на то, что в подчинении у Мухаммеда находилась огромная военная сила, он не смог оказать достойного сопротивления монголам. Войско Чингис-хана разгромило Хорезмское государство. Мухаммед бежал от монголов на один из островов Каспийского моря, где он вскоре и умер. После Мухаммеда борьбу с монголами возглавил его сын Джалал-ад-Дин. Чингис-хан поручил своим лучшим полководцам Джебе и Субудаю найти Мухаммеда. Им была также поручена разведка тех стран, которые монголы собирались поработить. Одной из этих стран была Грузия.