Ни Лефорт, ни Петр не вмешивались тогда во внутренние дела государства, ими занимался Лев Кириллович Нарышкин.

28 февраля 1690 г. у Петра Алексеевича родился сын Алексей.

Петр по-прежнему увлекался своими потехами, но это ему стоило дорого. Так, 2 июня 1690 г. при «штурме» Семеновского двора ему опалило лицо. В октябре 1691 г. проходил великий и страшный «бой» у генералиссимуса Фридриха, то есть князя Федора Юрьевича Ромодановского, «за стольный город Пресбург». Рейтары (кавалеристы) ротмистра Петра Алексеевича в этом бою отличились. Образец мужества показал и сам ротмистр, взявший в плен неприятельского «генералиссимуса». Ближний стольник, князь Иван Долгорукий «от тяжкия своея раны, паче же изволением Божиим, переселился в вечные кровы, по чину Адамову, идеже и всем нам по времени быти», — писал Петр. В 1694 г. происходили «бои» в самых обширных размерах, так, в одном из «потешных» походов участвовало 7,5 тысяч человек. Потехи не обходились без раненых и убитых.

Наряду с потехами на суше шли потехи на воде. Весной 1691 г. Петр состроил яхту и спустил ее на воду. 1 мая 1692 г. близ Переяславля-Залесского на Плещеевом озере был спущен первый корабль, вскоре тут появилась целая учебная флотилия. Царица Наталья Кирилловна, не имея возможности удержать сына в Москве, должна была сама отправляться на место его любимых потех. Но Плещеево озеро для Петра стало мало, он поехал на Кубенское — то оказалось мелко.

Неодолимая сила тянула его к морю. В 1693 г. с большой свитой царь выехал в Архангельск. Там он устроил верфь и заложил корабль. По праздникам Петр ходил в церковь, сам читал «Апостол» и пел с певчими на клиросе. Обедал у архиепископа Холмогорского Афанасия, ужинал с иностранцами, с которыми толковал о море, о флоте. 18 сентября царь объявил о своем намерении возвратиться в Москву. Предварительно он уничтожил верфь. Петр начал готовиться к морскому походу, но внезапно 24 января 1694 г., на 42-м году жизни, после пятидневной болезни, умерла царица Наталья Кирилловна. Петр сильно переживал смерть матери.

1 мая 1694 г. царь отправился во второй морской потешный поход. Адмиралом был назначен известный «генералиссимус» Фридрих (Федор Юрьевич Ромодановский), «человек, зело смелый к войне, а паче к водяному пути», как в шутку выражался о нем Петр. Вице-адмиралом был бывший «польский король» Иван Иванович Бутурлин, контр-адмиралом — Патрик Гордон (в России его именовали Петр Иванович). Вся «армия» двинулась через Вологду, Великий Устюг в Архангельск, затем на Соловецкие острова. По дороге приключилась сильная буря, но «моряки» выстояли и спаслись. По этому случаю Петр собственными руками изготовил крест в полторы сажени и поставил его на том месте, где вышел на берег. Надпись на кресте на голландском языке гласила: «Этот крест сделал шкипер Петр в лето Христово 1694 г.».

В Архангельск из Голландии прибыл заказанный Петром 44-пушечный фрегат «Святое Пророчество». Именно на этом корабле Петр впервые поднял российский флаг, который состоял из трех горизонтальных полос белой, лазурной и красной. Это была вариация голландского флага с той разницей, что поменяли местами красную и белую полосы. Событие, по обычаю, ознаменовалось большими пирами. После пиров царь со своим флотом в три корабля отправился провожать немецкие корабли и доплыл до мыса Святой Нос в Белом море. В первых числах сентября 1694 г. Петр был уже в Москве.

Кроме потех, было еще одно любимое дело царя — приготовление и запуск фейерверков.

Петр, несмотря на свою молодость и потешный характер занятий, успел уже из окружающего общества притянуть к себе лучшие силы. Возле русских людей — Федора Ромодановского, Тихона Стрешнева, Федора Апраксина, Гаврилы Головкина, Трубецких, Куракиных, Никиты Репнина, Ивана Бутурлина, Андрея Матвеева, Федора Головина видим иностранцев — Франца Лефорта, Патрика Гордона, Андрея Виниуса, Адама Вейде, Андрея Кревета, Якова Брюса. Виниус при Петре был произведен в думные дьяки. В Посольском приказе переводчиком назначили Петра Шафирова, будущего вице-канцлера.

Внешняя политика Петра за четыре года его правления после Софьи не изменилась. Иностранными делами по-прежнему заведовал Лев Нарышкин. Он отличался спокойствием, но не предприимчивостью.

Падение Софьи и Голицына не нарушило отношений гетмана Украины Мазепы с русским правительством. После гетмана первым лицом Малороссии был генеральный писарь Василий Кочубей.

В России не боялись нарушать договор с Польшей, но и Польша отвечала тем же. Поляки, ранее входившие в антитурецкую коалицию, сносились с крымским ханом с целью заключить союз, направленный против России.

Петр окреп. Потехи уже не могли удовлетворять его потребностей. Белое море, как видно, показалось ему мало. Петр стал мечтать о Балтике, но выход к морю преграждали шведы. Шли также разговоры о Каспийском море. Наконец остановились на плане выхода к Черному морю, которое в то время контролировали турки.

На начало 1695 г. был назначен поход на Азов (по-турецки город назывался Саад-уль-Ислам, что означает Оплот Ислама). Петр понимал, что именно этот город дает выход к морю на юге страны. Всего на Азов направилось свыше 150 тысяч воинов. Шла дворянская конница под начальством боярина Бориса Шереметева, а также 31-тысячное войско нового строя —  Преображенский, Семеновский, Бутырский и Лефортовский полки. Возглавляли поход три генерала — Федор Головин, Франц Лефорт и Патрик Гордон. Бомбардирскую роту вел бомбардир Петр Алексеевич.

29 июня 1695 г. войско приблизилось к Азову. 8 июля начала действовать русская батарея, но турки постоянно получали подкрепление с моря. Петр понял, что Азов это не «игра». Два штурма города не удались. 27 сентября решили отступить от Азова. Успешно действовали Шереметев и Мазепа, захватив четыре небольших турецких опорных городка, в их числе Кази-Керим и Таган.

22 ноября 1695 г. царь торжественно вступил в Москву. Хотя первое предприятие Петра не увенчалось успехом, он не пал духом. Петр проявил небывалую деятельность, чтобы быстрее забыть неудачи первого азовского похода. Именно с этого момента начинается настоящее царствование Петра Великого.

В 1696 г. приступили к строительству флота: 26 тысяч плотников должны были срубить 1300 стругов, 300 лодок, 100 плотов. Адмиралом строящегося флота царь назначил Лефорта. Петр носил теперь звание капитана. 27 ноября был объявлен новый поход. Военачальниками назначили генералиссимуса Алексея Шеина и генерала Федора Головина.

В период подготовки ко второму походу на Азов, среди шума и суеты, как-то незаметно для всех на 30-м году жизни скончался царь Иоанн Алексеевич. Это случилось 29 января 1696 г. У царицы Прасковьи Федоровны, вдовы Иоанна Алексеевича, урожденной Салтыковой, после смерти мужа осталось пять дочерей.

Первым делом царя-самодержца Петра была поездка в Воронеж, где было начато строительство кораблей. Плотники, служилые люди из-за тяжелых условий труда бежали с верфи. Но флот был построен: 2 корабля, 23 галеры, 4 брандера.

23 апреля суда с войском двинулись на юг. На первом корабле плыл царь Петр Алексеевич, в звании капитана. Русский флот загородил дорогу туркам в устье Дона. Азов остался без помощи. Нападение татар на русский лагерь было отбито. Начались осадные работы. Обстрел города прошел с большим успехом 16 июля. Штурм города также был удачным. Хотя город не пал, но турки 18 июля объявили о готовности сдаться. Турецких воинов выпустили из Азова с женами, детьми и при оружии.

Москва торжествовала. 31 июля 1696 г. ударили в колокола. Эта была первая победа русского оружия над турками. Память россиян еще хранила неудачи Чигиринского похода.

Петр тут же, не отдохнув от ратных дел, осмотрел ближайшие приморские места и на мысу Таган-Рог решил построить крепость и гавань. Азов был сильно укреплен. Мечети превратили в православные храмы. Город стал снова русским.

За большую победу над турками царь раздал награды сообразно старым традициям: Алексей Шеин получил медаль в 13 червонцев, кубок с крышкой, золотой кафтан на соболях, увеличение жалованья и вотчину в 305 дворов. Франца Лефорта удостоили медали в 7 червонцев, такого же кафтана и вотчины в 140 дворов. Остальные генералы, полковники и офицеры, смотря по чину, получили медали, кубки, кафтаны, вотчины. Рядовому составу выдали по золотой копейке.