В 1667 г. великое противостояние России и Польши завершилось. С тех пор влияние России на Польшу стало постепенно возрастать уже без военных действий. Россия перестала ее бояться. Андрусовское перемирие послужило своеобразной вехой в жизни России. Поляки с Восточной Украины ушли, здесь появились свои землевладельцы — зажиточные казаки, войсковые старшины. Но Андрусовское перемирие, естественно, не могло решить внутренних проблем Украины.
Прежде чем приступить к рассказу о дальнейших событиях, обратимся к другим аспектам жизни России (или, как чаще говорили в те времена, Московского государства), в которой происходили интересные и печальные события в течение всей 13-летней войны с Польшей.
Первые два военных года были самыми счастливыми в царствовании Алексея Михайловича. Блестящие воинские успехи подняли дух царя. Однако из-за затяжной войны казна страны быстро опустела. С 1658 г. начался выпуск медных денег, которые вскоре обесценились. Цены на продукты и товары неимоверно возросли, началась инфляция. К тому же рынок заполнился фальшивыми деньгами. В 1662 г. в Москве из-за дороговизны и взяточничества отдельных высокопоставленных лиц (тестя царя князя Ильи Милославского и других) вспыхнул бунт, но его быстро погасили. Но жалобы на медные деньги продолжались. Началась массовая порча медных денег, за что казнено было более 7 тысяч человек, 15 тысячам были отсечены руки, ноги, многие отправлены в ссылку. Лишь в 1663 г. вышел царский указ об отмене их выпуска. Снова перешли на изготовление денег из серебра.
Но не только военные дела беспокоили царя. Его также тревожили взаимоотношения с патриархом Никоном — сильной и властолюбивой личностью. Сначала патриарх во всем помогал Алексею, но затем начал проводить свою независимую церковную политику, постоянно вторгаясь и в светские дела. Да и называть он себя стал великим государем. Таким образом, в Москве опять появилось два великих государя. Этот титул в свое время носил патриарх Филарет, но не как патриарх, а как отец царя и соправитель. Теперь же Никон, присвоив этот титул, по существу приравнял патриаршую власть к царской. Тон грамот Никона явно указывал на двоевластие. Когда великий государь-царь был в походе, великий государь-патриарх управлял государством из Москвы.
Каждый государь накопил немало опыта: один — в походах, другой — в правлении. К тому же у Никона резко проявились отрицательные черты характера. Он был жестоким, самолюбивым, несдержанным. Никон успел нажить много врагов среди вельмож. Сама царица, ее родственники Милославские, родственники царя по матери Стрешневы стали врагами Никона. Наконец патриарх возбудил против себя духовных лиц, дав указание внести в печатные славянские (русские) церковные книги исправления на основе греческой церковной литературы. Культовое однообразие устанавливалось по греческим образцам. В церковные обряды вносились поправки. Изменился характер проповедей. Все это вызывало недовольство не только многих служителей церкви, но и простого народа. Никон, подобно другим реформаторам церкви, стал креститься тремя перстами. Для исправления русских рукописей прибыло греческое духовенство. Приехавший в Москву патриарх Антиохийский Макарий, вместе с другими греческими архиереями, объявил в Успенском соборе Москвы, что необходимо креститься тремя перстами, и проклял тех, кто крестился двумя. Московский Собор, состоявшийся в 1656 г., поддержал патриарха Макария. Но на местах оппозиция церковным новшествам была очень сильна. Против нововведений Никона выступил один из самых знаменитых монастырей России — Соловецкий. В русской православной церкви произошел раскол, который привел к возникновению старообрядчества.
К царю на Никона пришла челобитная. Патриарха обвиняли в том, что он «возлюбил стоять высоко, ездить широко». Царь не хотел идти на прямой разрыв с патриархом — он был слишком мягок. Алексей Михайлович стал постепенно удаляться от Никона. Холодность и удаление царя раздражали Никона. В свою очередь и Никон решил отойти от царя. Этим воспользовались враги патриарха Никона.
10 июля 1658 г. произошел окончательный разрыв царя Алексея с патриархом Никоном, который стал добиваться у царя особых привилегий. Никон ушел в Воскресенский монастырь, добровольно в 1666 г. отказался от сана патриарха. К Никону запретили ездить. Алексея Михайловича долго мучили сомнения в правоте своих отношений к Никону. Для разбора дела о Никоне в Москву приехали патриархи из Александрии и Антиохии. Его судили, признали виновным. Никона сослали в Ферапонтов монастырь. Еще долго шла переписка Никона и царя Алексея с взаимными упреками. Новым патриархом был избран Иосаф II.
Осенью 1666 г. в Соловецком монастыре, отказавшемся принять исправленные богослужебные книги, произошло волнение. Царю пришлось вести с монахами настоящую борьбу. В 1668 г. в монастырь был послан отряд, но монахи, быстро вооружившись, разогнали стрельцов. Тогда стрельцы начали затяжную осаду монастыря, которая продолжалась несколько лет.
В это же время восстало донское казачество. Во главе стоял Степан Разин. Как описывают его современники, Разин был в донском войске казак известный, ловкий. Это был человек лет сорока, среднего роста, крепкого телосложения.
Иностранные источники повествуют, что брат Разина, находясь со своими казаками в войске Юрия Долгорукого, просил у воеводы отпустить его на Дон. Ему отказали. Тогда состоялся побег. Беглеца поймали и повесили. Оставшиеся в живых братья Степан и Фрол решили отомстить боярам и воеводам.
Степан Разин появился на Волге севернее Царицына в мае 1667 г. Он со своим отрядом нападал на плывущие по Волге караваны, грабил их. Казаки, в основном недавние беглые, голытьба, быстро признали Разина атаманом. Собрав полторы тысячи казаков, Разин на судах поплыл вниз по Волге. По пути он ограбил несколько городков, высек встретившегося черноярского воеводу Семена Беклемишева и морем приплыл к устью реки Яик (Урал). Степан взял Яицкий городок, убив 170 человек, и надолго расположился там. Осенью Разин грабил и татар, и торговые суда мусульманских купцов. Проходила зима. Голытьбе было привольно в Яицком городке. Они завели дружбу с калмыками, торговали с ними. Степан Разин ждал казаков с Дона, но вместо них пришли ратные люди царя. Весной 1668 г. казаки снова сели на суда и ушли в Каспийское море. А в это время на Волге с новой силой вспыхнуло народное восстание. Собралось человек 700 под предводительством Сергея Кривого. Этот атаман, разбив стрельцов, ушел к Разину.
Степан Тимофеевич хорошо «погулял» по морю. Он разорил берег от Дербента до Баку и, достигнув Решта, предложил свою службу персидскому шаху, прося земель для заселения. Переговоры затянулись. Жители Решта внезапно напали на казаков и убили 400 человек. Разин отплыл от этого города и объявил, что он приехал торговать. Сначала казаки пять дней торговали с местными жителями, на шестой день по условному знаку на них неожиданно напали, учинили расправу и ограбили. Захватив много пленных, Разин, встав на зимовку, укрепился на одном из островов Каспия и начал с персами обмен пленными. За трех-четырех христиан казаки давали по одному персу.
Весной 1669 г. Разин переплыл на восточный берег Каспийского моря, где разгромил туркменские улусы. В одной из стычек он потерял своего товарища Сергея Кривого. Казаки расположились на Свином острове. Здесь на них напал персидский флот с 4 тысячами воинов. Персы потерпели полное поражение. Только три судна успели спастись с командующим флотом Менеды-ханом, но его сын и дочь попали в плен к победителям. Ханская дочь стала наложницей атамана, о чем и поется в русской народной песне.
Казаки понимали, что им следует возвращаться на родину. В начале августа в Астрахани снова услышали о Разине. Начались переговоры между воеводой Семеном Львовым и атаманом Степаном Разиным. Шесть выборных казаков отправились в Москву, для того чтобы принести царю челобитную. Их выслушали, отпустили, но они не вернулись к Разину. Воеводы в Астрахани стали требовать от Разина перед его отпуском на Дон сдачи всех имевшихся у него пушек. Атаман казаков, отдав государю 21 пушку и морские струги, 20 пушек оставил у себя. Затем Разин с казаками отправился на Дон. 1 октября он приплыл к Царицыну. Поступил приказ, чтобы казаков в город не впускать и вина им не продавать. Но простой люд, видя в Разине защитника от боярской и царской власти, перешел на его сторону. Он был впущен в Царицын без сопротивления. В Царицыне возник конфликт между Разиным и воеводой. Воеводе пришлось спасаться от толпы разинцев, на волю были выпущены «тюремные стрельцы», воеводе и чиновникам угрожали расправой.