Так как немедленно после своего образования Евком установил жесткий контроль над денежными операциями ЕКОПО, а национализированные банки отказывались выдавать Комитету принадлежавшие ему деньги, Комитет оказался в труднейшей ситуации. Даже библиотека ЕКОПО в августе 1918 г. была реквизирована и перевезена в Евком к услугам только что образованной редакции Ди Коммуне. ЦК ЕКОПО, потеряв самостоятельность и большинство источников финансирования, пытался какое-то время продолжать свою деятельность, обменивая финансовые обязательства иностранных еврейских организаций помощи на средства, собранные русскими сионистами для отправки в Палестину, а также на деньги частных лиц, стремившихся перевести их за границу. Так, хотя и в трудных условиях, ЕКОПО продолжал функционировать вплоть до бегства его председателя Слиозберга в Финляндию в марте 1920 г.
Аналогичные трудности испытывали и другие центральные организации помощи. Октябрьский переворот нарушил всякую планомерность в работе Петроградского комитета ОЗЕ. Государственные субсидии практически прекратились, в условиях обнищания не приходилось полагаться на самообложение. На поддержку действовавших учреждений Комитет тратил остатки иностранных пожертвований предыдущих лет и мелкие суммы, поступавшие от советов Петроградской и Московской общин.
Весной 1918 г. ОЗЕ выработал подробную программу работ «на переходной период», большая часть которой так и осталась на бумаге из-за нехватки средств. Вдобавок ко всему в июне 1918 г. Евотдел запретил ОЗЕ контактировать с иностранными миссиями без разрешения Наркомнаца, предупредив, что игнорирование запрета «будет рассматриваться как измена отечеству, а виноватые будут подвергаться беспощадной революционной каре». Видимо, власти не хотели утечки за границу информации о положении беженцев, которая собиралась в ОЗЕ и в ЕКОПО. Запрет означал и невозможность получения иностранной помощи через дипломатические каналы. Бюджет Общества 1918 г. уменьшился в 6 раз, но масштабы работы сократились не так сильно благодаря самоотверженности служащих ОЗЕ. К концу 1918 г. учреждения Общества все еще функционировали в 102 городах 35 губерний России.
Петроградский Комитет осуществлял координацию всей работы в течение еще нескольких месяцев 1919 г., сосредотачивая свои усилия на помощи возвращавшимся военнопленным и инвалидам войны. На это дело Общество сумело получить финансовую поддержку государства. В ответ на новую вспышку погромов и эпидемий в различные районы страны посылались группы помощи ОЗЕ. В Петрограде был образован кружок из 70 студентов-медиков старших курсов для их подготовки к работе в учреждениях ОЗЕ. Для координации своей деятельности и ведения переговоров с властями ОЗЕ, ЕКОПО и ОРТ образовали Объединенный комитет.
9 декабря 1919 г. по решению Петросовета ОЗЕ было перерегистрировано. В 1918 —1919 гг., в трудный для печатного дела период, ОЗЕ выпускало собственный ежемесячник Известия Петроградского ЦК ОЗЕ (Известия ОЗЕ). Под руководством М.Грана, А.Брамсона, ЕДембо, Н.Ботвинника, В.Бинштока не прекращалась кропотливая работа по накоплению материалов о социальной биологии и психофизиологии (тогда писали — психо-физики) евреев, отражавших тяжелые потрясения российского еврейства в годы революции, погромов, мировой и гражданской войн. Приводились в порядок архив, музей и библиотека Общества. На пути осуществления планов ОЗЕ стояли не только финансовые трудности, но и изоляция Петрограда от провинции. Поэтому часть бремени Комитет переложил на местные еврейские общины — Москвы, Крыма и т.д.
Октябрьская революция привела к упадку деятельность ОРТа: он лишился своих вкладов в банках, правительственной помощи и почти всех частных пожертвований. Борясь с финансовым крахом, Комитет ОРТа, как и другие общественные организации, прибегал к ссудам у частных лиц в обмен на обязательства возвратить деньги за счет пожертвований за границей. Но это была капля в море. В 1918 г. у ОРТа оставалось лишь 20 бюро труда и 10 кооперативных столовых для рабочих. Окончание войны и демобилизация поставили перед ОРТом задачу смягчения последствий надвигавшейся безработицы. Было начато обследование экономического состояния еврейского населения. В ответ на голод и разруху в Петрограде, в апреле 1918 г. ОРТ приступил к организации артели огородников для выращивания овощей на пустующих окраинах города. В начале мая уже возделывались первые две десятины земли, которые удалось получить Правлению. Чтобы спасти население от голода, руководители ОРТа Борис Бруцкус и Яков Цигельницкий предложили основывать сельскохозяйственные поселения, но угроза погромов в деревне отталкивала петроградских евреев от этого.
В Петрограде работа ОРТа сосредоточилась на издательской деятельности, трудной и с финансовой и с цензурной точек зрения. В 1918 —1919 гг. удалось выпустить три номера Бюллетеня Петроградского ЦК ОРТа, после которого в 1920 —1922 гг. вышли несколько номеров журнала Дер Эрд-Арбетер (Земледелец). В те же годы Петроградский ОРТ издал несколько книг на идиш по сельскому хозяйству. В начале 1919 г., после непродолжительного ареста, в составе делегации ЦК выехал на Украину, а оттуда за границу, председатель ОРТа Леонтий Брамсон. Отъезд Брамсона и других членов ЦК еще более ослабили роль петроградского ОРТа.
После ликвидации большевиками Совета еврейских общин нужда в общественных организациях снова возросла: на них, как и при самодержавии, вновь легли функции, отнятые у демократической общины. В июле 1920 г. по инициативе Евкома образовался Еврейский общественный комитет (Евобщестком или Идгезком — идиш) для помощи пострадавшим от войны и погромов. Хотя Евобщестком с самого начала был поставлен под контроль еврейских коммунистических учреждений, представители ЕКОПО, ОЗЕ, ОРТа также были включены в его состав, так как их участия потребовали иностранные организации помощи. Присоединение к Евобщесткому позволило общественным организациям выйти из финансового тупика и расширить свою деятельность.
Комитеты общественных организаций были переведены в Москву, однако их петроградские отделения продолжали работу. Во второй половине 1920 г. в Петроградский Комитет ОЗЕ входили М.Гран, Я.Эйгер, Н.Гарвинт, В.Биншток, Г.Гольдберг, М.Эльяссон, Г.Дембо, Н.Шварц, а Петроградское Правление ОРТа состояло из Б.Бруцкуса, Д.Хазана, М.Гинзбурга, И.Каменецкого, Я.Цегельницкого, М.Матисона (Магидсон?). В Петрограде ОЗЕ имело амбулаторию и санаторий на 35 пациентов. По согласованию с Евобщесткомом ОЗЕ помогало как еврейским, так и латышским беженцам. Видимо, в немалой степени благодаря петроградским общественным организациям помощи, в особенности ОЗЕ и ЕКОПО, в тяжелейший период военного коммунизма заболеваемость и смертность петроградских евреев были значительно ниже, чем у остального населения. Усилия же ОРТа по оказанию помощи евреям в переходе к земледельческому труду приносили, очевидно, более чем скромные результаты даже на Украине и в Белоруссии, не говоря уж о самом Петрограде.
Работа общественных организаций в Евобщесткоме проходила в трудных условиях из-за непрерывного давления Наркомнаца и Евсекций. Политика Евсекции по отношению к ЕКОПО, ОЗЕ, ОРТ заключалась в установлении контроля над этими организациями через Евобщестком и, посредством большевизации их состава, в постепенном их поглощении соответствующими государственными учреждениями — Собесом, Наркомздравом, Наркомпросом. В руководстве Евсекции были и сторонники немедленной ликвидации этих организаций. Оставаясь в Евобщесткоме в меньшинстве, еврейские общественные организации были не в силах противостоять его идеологизированной и безответственной по отношению к нуждающимся политике. Однако ОРТ, ОЗЕ и ЕКОПО, учитывая масштабы катастрофы, обрушившейся на евреев, по мере сил продолжали сотрудничать с государственными учреждениями и с Евобщесткомом, несмотря на регулярные ущемления их прав и нападки коммунистов. Только когда в начале января 1921 г. руководству общественных организаций стало известно о планах Евотдела Наркомнаца заменить составы их комитетов на угодных Наркомнацу лиц, ЕКОПО, ОРТ и ОЗЕ вышли из Евобщесткома. Двумя-тремя месяцами позже ЕКОПО перестал существовать, так и не поддавшись советизации.
