Окончательное решение вопроса об объединении всех действовавших на Украине большевистских организаций откладывалось до всеукраинской партийной конференции, созвать которую было решено в Москве 20 июня 1918 г. Для подготовки конференции совещание избрало Оргбюро в составе А. С. Бубнова, Я. Б. Гамарника, В. П. Затонского, С. В. Косиора, Н. А. Скрыпника (секретарь) и др.
Сплочение партийных сил, выработка тактики большевиков в условиях подполья — эти и другие вопросы были в центре внимания совещания подпольных большевистских организаций Украины, состоявшегося 26 мая 1918 г. в киевском предместье Пуще-Водице. В его работе приняли участие около 70 человек, в основном делегаты съезда профсоюзов Украины, проходившего тогда в Киеве. Они представляли партийные организации Киева, Харькова, Екатеринослава, Одессы, Полтавы, Кременчуга, Чернигова, Каменского, Прилук, Богуслава, Ходоркова, а также Гомеля. Совещание констатировало нарастание повстанческого движения в городах и селах Украины, постепенную, неуклонную активизацию деятельности подпольных большевистских организаций.
В этих условиях, указывалось в решении совещания, задачей большевиков является налаживание тесных связей с трудящимися и развертывание среди них агитационной работы. Совещание избрало руководящий орган большевистского подполья на Украине — Временный всеукраинский комитет рабочей коммунистической партии — в составе Л. И. Картвелишвили, М. М. Майорова, М. В. Реута и др.
Расширение сети большевистского подполья. Обескровленные в тяжелых боях с интервентами и националистической контрреволюцией большевистские организации Украины постепенно восстанавливали свои силы, росли численно, укреплялись организационно. Если в мае 1918 г. число коммунистов на Украине не превышало тысячи человек, и даже в таких центрах, как Харьков, Киев, Одесса, оставалось по 40–70 большевиков, то вскоре положение изменилось.
Важную роль в создании большевистского подполья на Украине сыграло избранное на таганрогском совещании Оргбюро. С помощью ЦК РКП(б) оно сплачивало коммунистов, эвакуированных с Украины в Советскую Россию, и наиболее опытных направляло на оккупированную Украину. Всего в течение мая — июня Оргбюро направило на Украину со специальными заданиями более 200 человек. Оргбюро заботилось об обеспечении подполья партийной литературой, в частности газетами «Правда», «Беднота», «Красная Армия» и т. п. Десятками тысяч экземпляров в украинские города и села были посланы Манифест сессии ЦИК Советов Украины, состоявшейся в Таганроге, инструкция по организации подполья и партизанского движения, брошюры, воззвания Оргбюро.
Большое значение для создания сети подпольных организаций, налаживания их работы имело то обстоятельство, что и в условиях оккупации большевики Украины работали под руководством ЦК РКП(б), с которым поддерживали тесные связи. В мае 1918 г. в Центральный Комитет партии приезжали представители Киевской, Харьковской, Екатеринославской, Луганской большевистских организаций. Созданием большевистского подполья на оккупированной территории непосредственно занимался Я. М. Свердлов.
ЦК РКП(б) оказывал большую материальную помощь Оргбюро и подпольным организациям. В частности, по его указанию СНК РСФСР ассигновал для нужд Оргбюро 34 млн. руб. Десятки тысяч рублей ЦК передал Одесской, Екатеринославской, Крымской и другим партийным организациям.
Благодаря усилиям Центрального Комитета РКП(б) и Оргбюро Украина покрылась разветвленной сетью подпольных партийных организаций. Крепкое и активное подполье возникло в индустриальных центрах республики.
С первых же дней оккупации Харькова в нем начала действовать оставленная Харьковским комитетом группа коммунистов-подпольщиков во главе с Н. Н. Бесчетвертным (Николаевым). Ее деятельность была настолько успешной, что в начале мая стало возможным избрание подпольного горкома партии. В его состав вошли: Н. И. Бесчетвертный (Николаев) — секретарь, Н. М. Кабаненко, Г. Л. Сапожников, А. П. Хоперская и др. В городе были созданы районные партийные комитеты — Иваново-Холодногорский, Основянский, Петинский (Журавлевский), что способствовало организации партячеек на предприятиях. Через них горком партии налаживал работу среди трудящихся города и всей губернии, руководил их борьбой с оккупантами и гетманщиной.
В Екатеринославе для подпольной работы были оставлены 250 большевиков, заранее подобраны конспиративные квартиры, выделены материальные средства. В конце апреля состоялись выборы городского подпольного партийного комитета. В его состав вошли И. К. Амосов, Т. С. Быченко, Н. И. Варлен и др. К июню в городе действовало 18 подпольных групп и ячеек. Екатеринославский партийный комитет установил связи с подпольщиками ряда уездов и районов Донбасса и Криворожья. С 17 апреля в городе нелегально издавалась большевистская газета «Молот».
Разветвленная сеть подпольных организаций и групп большевистской партии была создана в Донбассе. Подполье действовало в Луганске, Юзовке, Дебальцево, Дружковке, Краматорске, Макеевке, Мариуполе, Горловке, Гришино, Славянске, Бахмуте, Алчевске, Лисичанске, Старобельске, Лозовой, Павловке, Боково-Антраците, Ровеньках. Нелегальные партийные организации возникали не только в городах, но и на отдельных предприятиях и в селах.
Большую помощь в организации подполья большевикам Донбасса оказывали прибывшие туда по заданию ЦК РКП(б) П. А. Евдокимов, И. И, Шварц и др. В частности, при активном участии П. А. Евдокимова в мае 1918 г. в Юзовке начал действовать подпольный большевистский комитет в составе И. И. Боярского, Ф. И. Зайцева, Г. С. Зимина, Д. Т. Корниенко (председатель), М. И. Петрова и др. Комитет создал нелегальные партийные ячейки в ряде цехов местного металлургического завода. К маю сильная подпольная организация (П. М. Бородин, П. В. Евсеев, И. Н. Лагода, А. С. Титов и др. — всего около 25 человек) имелась в Лисичанске. Организация проводила большую работу среди рабочих завода «Донсода» и шахтеров окрестных рудников.
Среди сельских большевистских подпольных организаций одной из наиболее активных в Донбассе была организация в с. Беловодск на Луганщине. В ней работали Н. Ф. Белик, А. И. Дехтярев, П. Л. Гайворонский, Ф. П. Кузоятов, Г. Л. Ткаченко и др. Беловодские большевики помогли организовать подпольные партийные ячейки в селах Литвиновка, Евсуг, Новолимаревка.
Всего на Екатеринославщине и в Донецком бассейне, по неполным данным, на июнь 1918 г. насчитывалось более 80 подпольных большевистских организаций, в том числе 30 в сельской местности.
В Киеве большевистское подполье начало действовать буквально с первых дней оккупации. В середине марта состоялось городское собрание, на котором присутствовало около 60 подпольщиков. Спустя месяц был создан временный Киевский комитет партии во главе с Л. И. Картвелишвили. Летом городская партийная организация объединяла более 650 коммунистов, в городе действовало шесть районных подпольных райкомов партии. Состоявшаяся в конце июня большевистская конференция избрала общегородской партийный комитет в составе П. М. Дегтяренко, А. К. Ластовского, М. В. Реута и др. На Киевщине в это же время также действовали Белоцерковская, Богуславская, Каневская, Малинская, Радомышльская, Таращанская, Уманская, Ходорковская, Черкасская, Чигиринская партийные организации. В июне 1918 г. для руководства партийной и боевой работой было создано губернское бюро.
Центром большевистского подполья на юге Украины была Одесса. Уже 31 марта там состоялась конференция большевиков, избравшая временный городской партийный комитет в составе А. В. Трофимова, С. Лушера, И. О. Резинкина. Возобновили свою деятельность в городе пять районных комитетов партии, многие ячейки на предприятиях. В мае по заданию ЦК РКП(б) в Одессу прибыли В. Бухарцева (Лиза), Н. В. Голубенко (Петр), П. И. Онищенко (Павел), С. Янковская (Ольга). Сообща с местными большевиками они многое сделали для создания сети большевистского подполья не только в Одессе, но и в соседних городах. Большевики Одессы установили связи с подпольщиками Николаева, Херсона, Елисаветграда, Балты, Ананьева, Тирасполя и других городов юга. Много внимания одесские большевики уделяли налаживанию агитационной работы среди трудящихся с помощью печатного слова. Уже в первые месяцы оккупации им удалось издать несколько номеров газеты «Голос пролетария», напечатать 200 тыс. экземпляров «Манифеста ЦИК Советов Украины» от 19 апреля 1918 г., ряд листовок, в том числе и для солдат оккупационных войск.