В 1707 г. положение императора и его союзников в войне за австрийское наследство улучшилось. В 1708 г. военный совет в Вене сумел выделить главнокомандующему имперской армии в королевстве Венгрия генералу Зигберту Хейстеру несколько новых полков для подавления сопротивления куруцев. 3 августа 1708 г. произошло сражение при Тренчине, в котором Хейстер и Янош Палфи разбили численно превосходившую куруцскую армию, причем несколько командиров повстанцев вместе со своими отрядами перешли на сторону императора. В течение трех месяцев куруцы были вытеснены из западной и средней Словакии. Они лишились экономически важного региона горнопромышленных городов, в котором была сосредоточена значительная часть оружейной промышленности и который до последнего времени отчислял им немалую долю от добычи редких металлов. Однако эпидемия чумы, распространившаяся в сентябре 1707 г. по всей территории Словакии, отсрочила военную операцию имперских сил по окончательному подавлению восстания. На отсрочку операции повлияли также дипломатические контакты повстанцев с русским царем Петром I, который в 1709 г., после победы над шведским королем Карлом XII под Полтавой, вновь господствовал в Польше. Без того трудные переговоры осложнялись еще больше международной активностью Ракоци и Берчени. Тем не менее мирный договор был заключен 29 апреля 1711 г. в военном лагере близ Сатмара. Благодаря усилиям Яноша Палфи — главы делегации со стороны Габсбургов, — договор заложил основы продолжительного мира и дал повстанцам больше, чем те могли ожидать, принимая во внимание положение, в котором они находились: всеобщую амнистию, гарантии автономных прав Венгрии и Трансильвании, ограниченную, но зато четко зафиксированную в законах свободу вероисповедания.

Сатмарский мир завершил собой столетие потрясений и антигабсбургских сословных восстаний. Венгерские сословия отказались от права вооруженного сопротивления, Вена взамен признала их привилегии и права. Мир вывел страну из состояния перманентного кризиса в отношениях между двором и сословиями и обеспечил длительный период внутренней стабильности. Мирный договор, подписанный в Сатмаре, стал победой габсбургского дворянства. Но последствия 8 лет куруцской войны означали катастрофу для словацкой территории, которая понесла особо тяжелые материальные и людские потери. По существующим оценкам, Словакия лишилась 80 тыс. жизней, т. е. около одной десятой всего населения.

Под воздействием продвижения османов в глубь Балкан и далее в сердце Венгерского королевства межэтнические отношения во всей стране, но в особенности в Словакии изменились коренным образом. За вторжением турок в Сербию и восточные части Хорватии в 1520 и 1521 гг. последовал массовый исход населения Хорватии, продолжавшийся два десятилетия. Хорватские беженцы оседали в незаселенных районах вдоль австрийской границы западной Венгрии, западной Словакии и Моравии. Гражданская война между Фердинандом Габсбургом и Яном Запольским, с одной стороны, и османское вторжение, с другой, вызвали перемещения других этнических групп. Уже в ходе войны за венгерскую корону в 1527—1538 гг. произошли «этнические чистки», прежде всего немецкого населения в королевских городах. В1535 г. по приказу Запольского большинство горожан должно было покинуть Кошице. Однако еще более массовые миграции населения вызвало вторжение османов в центральные области страны. Вдобавок к хорватам в горных северных районах убежище искали венгры и сербы.

Во второй половине XVI в. под давлением венгерской иммиграции словацко-венгерская этническая граница сместилась на север. Основной поток венгров направлялся в хорошо укрепленный в военном отношении город Кошице и далее в долину р. Ториса в комитате Шариш. Во многих случаях венгерское дворянство организовывало перевод своих венгероязычных крепостных из южных земель в чисто словацкие области. Семейство Цобор переселило венгерских беженцев с юга на свои земли вдоль моравской границы. Город Нитра, население которого изначально было словацким, в 1532 г. был мадьяризован Балинтом Тереком, который разместил здесь своих крепостных с Балатона, где им угрожали турки. Венгерские крестьяне перебирались в словацкие земли также по собственной инициативе. Они искали спасения от османов за стенами антитурецких крепостных сооружений и селились вдоль течения Вага, близ Глоговца и вокруг Трнавы. После того как Среднее Подунавье в 80-е годы XVII в. было освобождено от османов, начался обратный процесс миграции из относительно перенаселенных комитатов в северной Словакии на юг. Однако этот процесс получил заметное развитие лишь в позднейший период.

В течение XVI в. этническая картина, в особенности в севернословацких землях стала еще более пестрой после того как туда начали прибывать многочисленные группы анабаптистов из Швейцарии, Германии и Тироля. Изгнанные из Австрии и Моравии в 1545 г., они начали селиться в Словакии, несмотря на протесты Фердинанда I. Вторая волна анабаптистов — около 5 тыс. человек — прибыла в западную Словакию по следам поражения чешского восстания в 1621 г. После того как Фердинанд II в 1627 и 1628 гг. издал декрет об обращении в католичество и — соответственно — изгнании некатоликов из Чехии, в Словакию пришла вторая волна эмигрантов — представителей некатолических конфессий, в особенности общины чешских и моравских братьев (Unitas Fratrum). Большинство землевладельцев в приграничных областях исповедовали лютеранство и с радостью принимали пасторов и мирян. Приток религиозных иммигрантов, говоривших по-чешски, на языке, очень близком словацкому, в конце 20-х годов XVII в. вполне логично принес экономические выгоды для западно- и северо-западных словацких земель, обезлюдевших после набегов османов и антигабсбургских восстаний. Беженцы существенно укрепили протестантов в Словакии и умножили ряды словацкой интеллигенции, которая в начале XVII в. была все еще крайне малочисленна.

В XVI—XVII вв. продолжалась начавшаяся ранее валашская колонизация. Одна часть валахов прибыла в словацкие земли с юго-востока.

Вторая, более многочисленная группа переселенцев вышла из горных районов восточных Карпат, где они проживали вперемешку с русинами. Этнически смешанные румынско-русинские элементы компактно расселились в горных районах, в особенности в комитате Орава, на высокогорных склонах комитата Липтов и на севере комитата Гемер, отчасти, впрочем, и в других районах. Как и беженцы из Чехии и Моравии, валахи смешались с местным населением.

В XVII в. в словацкие земли мигрировали также евреи из других габсбургских владений. Уже в средние века евреи составляли значительную часть населения в некоторых королевских городах. В сельской местности и в городах, находившихся под юрисдикцией землевладельцев, они начали появляться во все большем количестве только во второй половине XVII в., когда волны еврейской эмиграции начали прибывать в западную Словакию, в особенности из Моравии и Вены после венского погрома в 1679 г. В последней трети XVII в. еврейские купцы и банкиры сконцентрировали в своих руках немалые капиталы, и их деньги в некоторой степени влияли на политическое развитие региона. Леопольд I использовал займы от еврейского семейства Оппенгейм (Оппенхайм), чтобы финансировать свои армии. С другой стороны, еврейский финансист Эфраим субсидировал Имре Тёкёли.

Словаки были составной частью полиэтничного королевства Венгрия, и даже его законы признавали их как особую этническую группу. В упомянутом выше «Трипартитуме» Иштвана Вербёци, составленном в 1514 г., автор разделял венгерский народ на две группы — тех, кто исповедовал истинную религию, и тех, кто оставался верен греческой схизме. В первую группу, помимо мадьяр, саксов (саксонцев), немцев и чехов, он включил словаков (к схизматикам было причислено население южных и восточных областей страны — румыны, сербы и русины). Словаки, мадьяры и немцы, а также румыны, русины и сербы недворянского происхождения несомненно признавались этническими группами, но венгерская нация (natio Hungarica) состояла только из дворян — носителей политических прав. Термин «венгерский» означал не членство в венгерской этнической группе, но группе привилегированных людей. Этнические различия не имели значения внутри политической нации. Каждый, кто был рожден членом дворянского сословия, получал статус ее члена. Словацкие, хорватские, русинские, румынские и немецкие дворяне отождествляли себя с нацией точно так же, как и венгерские дворяне. Вне зависимости от национальности, как венгерские, так и невенгерские дворяне последовательно и упорно сражались за права своего сословия.