В 658 г. после 35 лет правления князь Само умер, и его держава распалась на несколько более мелких образований. В Среднем Подунавье постепенно стали формироваться княжества Моравское и Нитранское. Эти и другие славянские княжества, расположенные по периметру аварской Паннонии, были настолько жизнеспособны, что сумели устоять и во времена нового взлета аварского могущества во второй половине VII в. Вероятно, их правители признали главенство аваров и платили условленную дань. В этот период авары уже не применяли грубое насилие по отношению к славянам, скорее можно говорить о взаимном симбиозе, который проявился и в характере материальной культуры.

Карл Великий в 788 г. восстановил власть франков над Баварией и начал активно вмешиваться в дела на Среднем Подунавье. На восточной окраине Баварии находилось княжество Карантания и графство Траунгау. Поскольку и то, и другое граничили с аварами, Карл преобразовал их в пограничные марки и передал управление ими в руки своего зятя баварского префекта Герольда I. После успешного военного похода итальянского короля Пипина из Фриульской марки против аваров в Нижней Паннонии отец Пипина Карл Великий тоже решил напасть на них. В 791 г. он собрал сильное войско, перешел пограничную реку Энс и продвинулся вдоль берега Дуная вплоть до реки Рабы, не встретив при этом более или менее серьезного сопротивления аваров. На завоеванной территории между Энсом и Видинским лесом он образовал новую, Аварскую марку (впоследствии известную как Восточная марка).

Часть аваров, возглавляемых одним из аварских старейшин (тудунов), в 795 г. решила покориться Карлу Великому и по его приказу принять христианство. Однако среди аваров вспыхнула острая междоусобица, которая привела к убийству аварского правителя — кагана. Воспользовавшись этой ситуацией, фриульский маркграф Эрих в том же году направил против аваров войско, которому удалось захватить главную резиденцию — хринг — кагана в Паннонии. Франки завладели здесь несметными сокровищами, которые Эрих отослал Карлу Великому в Ахен.

После этого поражения часть аваров во главе с тудуном в начале 796 г. отправилась в Ахен, где они приняли христианство и признали суверенитет франков над ними. Другая же часть аваров избрала нового кагана и решила продолжать военные действия. Поэтому итальянский король Пипин опять вторгся в Паннонию и вытеснил аварское войско за реку Тису. Пипин опустошил и полностью разрушил главный хринг кагана. Затем он расположился лагерем в достоверно неустановленном месте на берегу Дуная, и здесь на церковном соборе с участием высших сановников состоялось совещание относительно урегулирования обстановки в Паннонии и христианизации аваров и славян. Миссионерская деятельность в Паннонии была поручена епископству в Зальцбурге, а в левобережье Подунавья — епископству в Пасове.

В начале IX в. ослаблением аваров воспользовались славянские князья и стали нападать на своих противников. Силами своих дружин они устраняли аварских представителей власти и захватывали их стойбища.

Особенно интенсивным был натиск славян в 805 г. Задунайские авары под предводительством кагана (капкана) Теодора, уже крещеного, с позволения императора Карла откочевали в Верхнюю Паннонию к озеру Нейзидлер. После смерти Теодора они избрали новым каганом Авраама (Абрагама), тоже принявшего крещение. Однако славяне продолжали наносить удары остаткам аваров. Чтобы положить конец распрям между ними, император Карл Великий в 811 г. был вынужден направить в Паннонию войсковую экспедицию.

Более чем двухвековое господство аваров над славянами Подунавья в результате завершилось скорым развалом их племенного союза. С другой стороны, оно обусловило тенденции к консолидации на территориальной основе. В условиях слабеющего аварского владычества стала складываться общественная элита левобережных словенов (нитранцев) Подунавья, представленная князем и его дружиной. Процесс политического объединения славян в юго-западной Словакии начался не позднее второй половины VIII в. В районе наибольшей плотности населенных пунктов, на стратегически удобном месте был построен княжеский град — замок — в Нитре. В его состав органически входило подградье, в котором было сосредоточено ремесленное производство. Нитранские князья в то время еще находились в подчинении у аваров и регулярно выплачивали им дань. Эта ситуация радикально изменилась в последнее десятилетие VIII в. Предшественники князя Прибины воспользовались упадком аварской мощи и силами княжеской дружины уничтожили их последние опорные пункты в юго-западной Словакии. Одновременно они начали осуществлять экспансию за счет небольших локальных центров на окрестных землях. Помимо самой юго-западной Словакии, власть нитранских князей начала распространяться на восток и юго-восток, где они практически не встречали сколько-нибудь серьезного сопротивления. Уязвимыми были только южная и западная границы. На юге Нитранское княжество доходило до самого Дуная, на западе его отделяли от Моравского княжества горы Малых и Белых Карпат. Власть правящего князя опиралась на систему укрепленных центров — градов, где были размещены княжеские дружинники. Грады стали не только военно-административными опорными пунктами, но и очагами ремесленного производства, торговли и религиозной жизни. Кроме Нитры, локальные центры подобного типа были обнаружены в Майцихове, Победиме, Вышном Кубине, в Спишских Томашовцах и Брекове.

В течение двадцатых годов IX в., не позже, произошла христианизация славян левобережного Подунавья. Приверженность к христианству ясно продемонстрировал единственный известный по имени правитель Нитранского княжества Прибина, когда незадолго до 828 г. взял в жены близкую родственницу траунгаусского графа Вильгельма I. В княжеском граде в Нитре по его повелению была построена церковь, которую в 828 г. освятил зальцбургский архиепископ Адалрам. Упоминание об этом событии является вообще первым письменным сообщением о строительстве христианского храма в славянской среде. Этот храм впоследствии стал резиденцией архипресвитера, который проводил христианизацию в Нитранском княжестве. Визит Адалрама в Нитру носил и дипломатический характер, потому что франки стремились обрести союзников против болгар, которые в предыдущем 827 г. захватили большую часть Задунавья. Очевидно, Прибина обещал поддержать франков или, по крайней мере, не вступать в союз с болгарами, что было достаточно для намеченной акции по восстановлению франкского господства в Паннонии. Летом 828 г. Людовик Немецкий отвоевал захваченную болгарами часть Задунавья и поручил управлять Восточной маркой Ратбоду (828—854).

Параллельно с распространением христианства в Нитранском княжестве проводилась христианизация и в соседнем Моравском княжестве. Известно, что в 831 г. пасовский епископ Регингар крестил всех мораван, т. е. князя, его семью и членов княжеской дружины. Освящение церкви в Нитре зальцбургским епископом Адалрамом в 828 г. и крещение мораван пасовским епископом Регингаром свидетельствуют о том, что Моравия в тот период входила в сферу миссионерской деятельности Пасова, а Нитранское княжество на тот момент оказалось в миссионерской сфере Зальцбурга. Принадлежность к двум разным церковно-административным округам в начале 30-х гг. IX в. является ясным доказательством того, что в те времена Нитранское княжество и Моравия представляли собой два различных и не зависимых друг от друга княжества.

Прибина правил в Нитранском княжестве приблизительно до 833 года, когда вследствие военного поражения был вынужден с частью своей дружины покинуть Нитру. Скорее всего им занялся маркграф Восточной марки Ратбод, который представил Прибину баварскому королю Людовику Немецкому. По инициативе короля Прибина был потом крещен в Трайсмауере. Вероятно, он ожидал помощи в деле возвращения ему Нитранского княжества. Не поладив с ним, Прибина направился к болгарам, а от них к славонскому князю Ратимиру. Именно в это время франки предприняли агрессию против Ратимира, и Прибина со своей дружиной укрылся у гранского (эстергомского) графа Салаха. В конце концов он снова помирил Прибину с Ратбодом.