Наряду со старейшим монастырем под Зобором в XI—XII вв. возникали и новые бенедиктинские монастыри. Геза I еще в бытность свою удельным князем основал около 1075 г. монастырь в Гронском Святом Бенядике. Около 1130 г. светский магнат Ламперт из рода Гунтов основал в Бзовике бенедиктинское аббатство. Небольшие монастыри появились и в Клиже, Луданицах и в Красной-над-Горнадом. Это были так называемые монастыри-усыпальницы знатных фамилий. Во второй половине XII в. возникли монастыри премонстрантов в Лелеше и Ясове.

Раннесредневековых сакральных памятников в неперестроенном виде сохранилось очень мало. К дороманскому периоду относят старейшее сохранившееся до наших дней здание с настенной росписью внутри в Костоланах близ Трибеча. Небольшие романские так называемые частновладельческие территориально-общинные церкви стоят с тех времен в Дражовцах, Клиже и в Поминовце близ Илавы.

Самые древние памятники литературы раннего средневековья представлены легендами о житии святых. Из венгерских памятников, персонажи которых жили в юго-западной Словакии, старейшим является легенда о Свораде-Андрее и Бенедикте. Эти святые-отшельники подвизались на Зоборе и на Скалке близ Тренчина. Легенду записал когда-то в 60-х или в начале 70-х гг. XI в. печский епископ Маурус, родом предположительно из окрестностей Нитры. Оба святых после восстановления нитранского епископства в начале XII в. объявлены его сопатронами (наряду со св. Эммераном). Это самые древние словацкие святые, культ которых наиболее достоверно относится к области юго-западной Словакии. В раннем средневековье церковь имела первостепенное значение. Церковные институты, помимо собственно религиозной миссии, играли очень важную роль в распространении культуры, образованности и в социальном попечительстве. Древнейшие библиотеки, где хранились бесценные кодексы, находились при наиболее значительных церковных институтах. В Нитре до наших дней сохранилось евангелие, которое было написано на рубеже XI—XII вв. вероятнее всего в скриптории гронско-бенядикского монастыря. При Нитранском капитуле уже в Х1-начале XII вв. действовала школа. Есть упоминания о том, что в Нитре в середине XII в. существовало лечебное заведение, которое выполняло функции больницы и богадельни. В Нитре как самом древнем и самом значительном городе эпохи раннего средневековья доказано и существование большой еврейской общины.

В течение XIII в. произошли значительные экономические и общественно-политические изменения, в ходе которых раннее средневековье превратилось в развитое средневековье. Новым элементом в Венгрии стали привилегированные средневековые города, которые способствовали подъему ремесленного производства и развитию товарно-денежных отношений. После опустошительного татарского нашествия было построено очень много каменных замков (градов), а этнический облик Словакии стал пестрым.

Преемник короля Белы III Имре (1196—1204) все годы своего правления был вынужден бороться со своим младшим братом Андреем. В итоге, потеряв терпение, он в конце 1203 г. заточил его в темницу в Эстергоме. Однако в начале 1204 г. сторонники Андрея во главе с Гунт-Познанами освободили его и стали его ближайшими доверенными лицами. После смерти Имре он короткое время был наместником, а в 1205 г. его короновали венгерским королем. Первые два десятилетия своего правления Андрей II (1205—1235) посвятил организации военных походов на Галич. Но все они закончились без ощутимых результатов и невероятно обременили королевскую казну. По зрелом размышлении Андрей II нашел выход из положения в том, что начал раздавать крупным землевладельцам большие имения, королевские замки, а в отдельных случаях и целые комитаты. Для того, чтобы получить необходимую денежную наличность, он постепенно отдавал регальные права на откуп еврейским и сарацинским банкирам. Вследствие неосмотрительной политики пожалований короля Андрея II прежде преобладающее королевское землевладение стало распадаться, а мощь земельных магнатов расти. Это вызывало тревогу королевских сервиентов, а также церкви. Королевские сервиенты и замковые иобагионы чувствовали грозящую им от политики короля опасность и добивались подтверждения своих прежних привилегий. В стране назревало всеобщее недовольство, которое достигло кульминации в 1222 г. Король Андрей II был вынужден издать Золотую буллу, где он впервые в письменной форме взял на себя обязательство уважать привилегии королевских сервиентов и замковых иобагионов. Король обещал созывать в день святого короля Стефана (20 августа) в Секешфехерваре собрание, куда мог придти любой сервиент и подать королю или палатину свою жалобу. Король не мог без суда заключить в тюрьму сервиента или отнять у него имущество. Сервиенты освобождались от обязанности платить королевскую дань (colecta) и денарии свободных. Король упорядочил и гарантировал наследственные права сервиентов и иобагионов. Он уточнил обязанности и судебное правомочие жупанов, которому сервиенты не подлежали. В случае вражеского нападения на страну сервиенты были обязаны вступить в войско короля на собственный счет. Участие сервиентов в походах за пределы Венгрии было добровольным, и расходы брал на себя король. Если сановник, занимающий какую-либо должность на королевской службе, погибнет в бою, его должность наследует его сын или брат. Король дал обязательство на будущее не жаловать в наследственную собственность ни целые комитаты, ни королевские звания. Он гарантировал старинные права замковых иобагионов и госпитов, переселяющихся из других стран. Король обязался чеканить качественную монету, а евреев и измаильтян отстранить от ведения дел, связанных с монетным двором, торговлей солью и сбором налогов. Король обещал не донускать совмещения придворных и жупанских должностей в руках влиятельных личностей. В случае нарушения им установлений Золотой буллы епископы и знать имели право на сопротивление.

Впоследствии король и его сыновья подтвердили действие ее установлений, но Андрей II свои обязательства не соблюдал и обещаний не держал. В оппозиции к королю оказался даже его сын Бела IV, стремившийся воспрепятствовать щедрым пожалованиям королевских земель. Но свои намерения он мог в полной мере реализовать только после восшествия на престол в 1235 г.

Король Бела IV (1235—1270) старался остановить процесс распада обширных королевских земельных владений. Он распорядился провести тщательную ревизию всех пожалований обоих своих предшественников, что вызвало недовольство со стороны земельных магнатов. В стремлении найти опору против могущественных баронов король стал оказывать всяческое содействие формированию привилегированных средневековых городов (Трнава, Банска Штявнида, Крупина, Зволен, Стары Теков). Однако этот многообещающий процесс был остановлен опустошительным татарским нашествием.

Татары (или монголы) после своего объединения двинулись в военный поход на запад. В битве на реке Калке в 1223 г. они сокрушили русских князей вместе с их союзниками половцами. Татары продолжили свои завоевания и начали угрожать Венгрии. Формальным предлогом для их нападения послужило то обстоятельство, что король Бела IV поселил в восточной части страны печенегов, бежавших от татар. 11 апреля 1241 г. произошла битва между венгерским войском и татарами под предводительством хана Батыя. Из-за тактической ошибки венгерское войско оказалось в плотном кольце окружения на небольшом участке и было полностью уничтожено. Из окружения удалось вырваться только королю Беле IV с малочисленной дружиной. Преследуемый татарами, король бежал через Гемер в Нитру, где взял с собой в подкрепление часть здешнего замкового гарнизона. Из Нитры он последовал через Братиславу в Вену, но из-за недружественной позиции Фридриха Бабенберга не мог там оставаться, направился в Загреб и в итоге укрылся в Далмации. В конце апреля в Словакию ворвалась и вторая колонна татарского войска, которая до этого сокрушительным ураганом прошла Малую Польшу и Силезию и через Грозенковский перевал проникла в Поважье. После этого территория юго-западной Словакии подверглась многомесячному опустошению. Татары прошли вплоть до Банской Штявницы и Зволена. В январе 1242 г. они перешли по льду Дунай, захватили Эстергом и затем соединились с войсками, действовавшими в центральной части Венгрии. Атакам татар смогли противостоять только укрепленные города и замки. В начале февраля 1242 г. на территории Словакии еще сопротивлялись Нитра, Братислава, Комарно, Филяково и Абовский Новоград. Татарские орды опустошили и селения в Восточнословацкой низменности и по всей вероятности проникли и в Спиш. Сравнительно в меньшей степени были разорены горные районы Словакии, где у деревенского люда было больше возможностей укрыться.