В 1965 г. резко обострились отношения между правящими кругами Малайи и Сингапуром. Причины, которые привели к этому обострению, были многообразны и существовали фактически с момента создания Федерации, охватывая сложный комплекс экономических, национальных и политических проблем. Главными спорными вопросами в экономике стали географическое размещение промышленности, проблема общего рынка, распределение доходов Сингапура. Еще более острыми стали политические противоречия, к которым присоединялась национальная проблема. Партия народного действия, выдвинувшая программу «демократического социализма» и «малайзийской Малайзии», стала естественным соперником консервативной Союзной партии.

С весны 1965 г. малайско-сингапурские противоречия вступили в решающую стадию. В этих условиях Абдул Рахман и его правительство пошли на крайние меры. 7 августа руководители Малайзии и Сингапура подписали соглашение о выходе Сингапура из Федерации.

После выхода Сингапура из Федерации те проблемы внутриполитического развития, которые стояли перед страной, отнюдь не оказались решенными или их острота — смягченной, как надеялись малайзийские руководители. Именно в эти годы обострились этно-национальные противоречия. Компромисс между китайской буржуазией и малайской феодально-бюрократически-буржуазной элитой, нашедший свое выражение в конституции 1957 г. (и в повторившей ее конституции 1963 г.) и заключавшийся в предоставлении китайцам возможности беспрепятственного занятия бизнесом в обмен на юридическое закрепление особых прав малайцев в землепользовании, государственной службе и т. д., во второй половине 1960-х годов перестал удовлетворять обе национальные общины.

Хотя правительству Союзной партии удалось достичь определенных успехов в развитии экономики, общая социально-экономическая структура Малайзии не изменилась, равно как сохранились острые проблемы занятости населения, нехватки земли, бедности крестьянских и городских низов, диспаритета в области экономики между национальными общинами.

В обстановке обострения классово-социальных и этнических противоречий в Западной Малайзии появились новые оппозиционные партии, в частности Партия демократического действия (ПДД). Ее идеологией стала теория «демократического социализма», близкая идеологии социал-демократии Западной Европы. ПДД получила поддержку части пролетариата, мелком буржуазии и интеллигенции китайского происхождения. Другая новая партия — Геракан ракьят Малайсиа (Движение народа Малайзии) — была создана бывшими лидерами (умеренными) Рабочей партии и видными представителями малайзийской интеллигенции.

В ходе предвыборной кампании 1969 г. ОМНО сосредоточила огонь критики не против левой оппозиции, представлявшей в массе немалайское население, а против ПМИП, в которой она видела своего основного конкурента в борьбе за влияние на малайское крестьянство. Союзная партия шла к выборам, уверенная в сокрушительной победе над силами оппозиции. Тем сильнее было разочарование и растерянность правящей коалиции, когда были подсчитаны результаты голосования 10 мая 1969 г. в федеральный парламент и в парламенты штатов в Западной Малайзии.

Хотя Союзная партия получила 66 мест из 104 и сохранила большинство в парламенте, за нее было подано менее половины голосов (49,1 %), и число ее депутатов уменьшилось по сравнению не только с 1964 г. (89), но даже с 1959 г. (74). Оппозиционные партии получили 38 мест в федеральном парламенте.

Выборы продемонстрировали глубокое недовольство, существовавшее в стране. Несмотря на то что оппозиционные партии не могли предложить ясной программы межнациональной консолидации и разрешения экономических проблем, их критика существующего положения привлекла к ним массу населения.

13 мая 1969 г. в Куала-Лумпуре начались межнациональные столкновения, поводом к началу которых была организация сторонниками ПДД и Геракана демонстрации по поводу успеха на выборах. Националистически настроенная малайская молодежь напала на демонстрантов, а затем столкновения охватили весь город. В течение считаных дней волна кровавых стычек, насилия, поджогов, убийств охватила всю Малайю. Столкновения продолжались до конца июля, порядок в стране удалось восстановить лишь после массового использования полиции и воинских частей. По заниженным данным, было убито около 200 человек (видимо, 500–600), ранено 440, арестовано более 9 тыс. и отдано под суд около 5,5 тыс. человек. Основную массу убитых и раненых составили китайцы.

14 мая в Малайе было объявлено чрезвычайное положение, 15 мая был создан Национальный оперативный совет во главе с заместителем премьера и министром обороны Абдул Разаком. Деятельность политических партий была запрещена, выборы в Сараваке и Сабахе отложены.

31 августа 1970 г. верховный правитель Абдул Халим Муазам-шах в традиционной речи по поводу Дня независимости провозгласил государственную доктрину рукунегара (основы государства), ставшую идеологической основой Федерации. В ее основу были положены пять принципов: 1) вера в Аллаха и веротерпимость (хотя ислам признавался государственной религией); 2) преданность монарху и стране; 3) уважение конституции; 4) соблюдение законов; 5) правильное поведение и соблюдение моральных норм. В Рукунегара говорилось, что самая неотложная задача — создание единой государственной общности людей, живущих на земле Малайзии, создание единой малайзийской нации, которая объединит всех жителей страны независимо от национальности и вероисповедания.

В сентябре 1970 г. ушел в отставку Абдул Рахман, премьер-министром стал Абдул Разак, его соратник и правая рука, считавшийся в правительственных кругах человеком, настроенным более «промалайски», чем старый лидер ОМНО.

В феврале 1971 г. парламент принял закон о поправках к конституции, согласно которому запрещалось (включая членов парламента и законодательных советов штатов) обсуждать вопросы, относящиеся к гражданству и особым правам малайцев и аборигенов Восточной Малайзии.

Стремясь ослабить межнациональную и внутриполитическую напряженность и смягчить социальные противоречия, правительство Абдул Разака (а после его смерти в январе 1976 г. — Хуссейна Онна) предприняло ряд мероприятий во внутриполитической, экономической и внешнеполитической областях.

Вскоре после прихода к власти Абдул Разак выдвинул идею сотрудничества всех легальных политических партий страны в рамках Национального фронта. Большинство лидеров оппозиционных партий, как вследствие личных интересов, так и понимая бесперспективность борьбы с Альянсом без обострения межнациональных противоречий, одобрительно отнеслось к этой идее. В августе 1974 г. состоялись парламентские выборы, на которых Национальный фронт получил 136 мест из 154. Оппозиция не смогла добиться успеха на выборах.

Было сформировано правительство, куда вошли не только члены Союзной партии, но и лидеры бывших оппозиционных партий.

Политические мероприятия были дополнены социально-экономическими. В основу их была положена провозглашенная в июле 1969 г. «Новая экономическая политика», призванная, по мысли ее авторов, достичь две главные цели: ликвидировать бедность в стране и устранить неравенство между национальными общинами.

Претерпела определенные изменения и внешняя политика Малайзии. Хотя страна сохраняла тесные связи с Западом, в ее внешней политике усилились тенденции развития дружественных отношений со всеми странами, включая социалистические, и поддержки процесса международной разрядки. Активно действовала Малайзия в региональной организации АСЕАН, чему способствовало прекращение малайзийско-индонезийского, а затем и малайзийско-филиппинского конфликтов. В апреле 1967 г. Малайзия установила дипломатические отношения с СССР, затем в конце 1960-х и в 1970-х годах они были установлены с европейскими социалистическими странами и Вьетнамом. В 1975 г. Малайзия обменялась посольствами с КНР.

В сентябре октябре 1972 г. премьер-министр Абдул Разак посетил СССР, где были подписаны соглашения об экономическом, техническом, культурном и научном сотрудничестве между двумя странами. Советский Союз стал одним из главных покупателей малайзийского каучука. В сентябре 1979 г. Советский Союз посетил премьер-министр Малайзии Хуссейн Онн. В подписанном в Москве совместном советско-малайзийском коммюнике стороны «подтвердили намерение и дальше идти по пути укрепления добрых отношений и расширения взаимовыгодного сотрудничества в экономической, научно-технической и других областях на благо народов обеих стран».