Хотя наилучшим средством защиты торговых судов были переходы в составе конвоев, многим приходилось следовать по маршрутам, куда нельзя было выделить эскортные корабли. Транспортам приходилось следовать в одиночку. Для их защиты флот в начале 1942 начал устанавливать на транспортах орудия и размещать военные команды из матросов ВМФ. Это привело к значительным трениям между моряками торгового и военного флотов, которые получали совершенно разные деньги, совершая плавание на одном и том же судне. Матросы флота получали 50$ в месяц. Торговые моряки получали 100$ за 44-часовую рабочую неделю. За каждый час переработки платилось по 85 центов. Они также получали военную премию 100$ в Атлантике, а также различные суммы около 100$ за посещение районов военных действий. 15 марта 1943 эта премия к возмущению национального профсоюза моряков была сведена к выплате 125$ каждому человеку за воздушный налет, имевший место в период пребывания судна в порту, вне зависимости от того, было оно повреждено, или нет. Хотя за время пребывания на берегу торговые моряки платы не получали, в течение войны они могли не опасаться безработицы. Однако, в отличии от военных моряков, их семьи не получали пенсий, а сами они не имели выходного пособия. Конечно, торговый флот можно было включить в состав военно-морского или превратить во вспомогательную службу, как произошло с военными строителями. Этого не случилось по 2 причинам. Прежде всего, этому противился национальный профсоюз моряков, возглавляемый упрямым Джо Карреном. Кроме того, требовалось очень много моряков. Команды военного времени чуть не вдвое превышали штаты мирного. Поэтому торговые суда получали неплохих моряков, которые не подходили военно-морскому флоту по своим физическим кондициям.

По мере хода войны, военные команды и экипажи судов, встречая общею опасность, научились действовать совместно. Есть несколько примеров, когда вооруженные суда отгоняли или даже топили подводные лодки.

К июню 1942 авиация армии и флота Соединенных Штатов начали справляться с подводной угрозой. Однако они еще не могли рассчитывать полностью ее устранить. Особенно острой была нехватка эскортных кораблей. Эскортные миноносцы еще не начали поступать на вооружение. Не были организованы поисково-ударные группы с эскортными авианосцами. С другой стороны, адмирал Дениц еще не истощил свой репертуар, и конвоям предстояли тяжелые дни. Адмирал, который сменил Редера на посту главнокомандующего германского флота в январе 1943, в последующие 2 месяца сумел добиться самых крупных успехов.

Прекрасным примером трансатлантического конвоя, пересекшего океан в июне 1942, является история конвоя ONS-102, который направлялся из Лондодерри в Галифакс. Методы борьбы с подводными лодками в то время еще почти не получили развития, и вот чем это обернулось. Конвой состоял из 63 судов, построенных в 11 колонн. Их прикрывали 9 военных кораблей: эсминец «Лири», 3 корабля Береговой Охраны США, 1 канадский эсминец, 4 канадских корвета. Командовал силами прикрытия капитан 2 ранга П.Р. Хейнеман, находившийся на корабле Береговой Охраны «Кэмпбелл». Скорость конвоя составляла 8 узлов. 16 июня в 7.25 радиопеленгатор засек 2 лодки. 2 корабля охранения были отправлены, чтобы отогнать противника. Оба провели безуспешные атаки глубинными бомбами, но конвой провел спокойную ночь. На следующую ночь 2 субмарины сумели проползти сквозь кольцо охранения, и в 1.25 они торпедировали судно. Через несколько минут «Кэмпбелл», патрулировавший в 2,5 милях впереди конвоя, заметил в 500 ярдах от себя подводную лодку. Подводная лодка погрузилась и была безуспешно атакована глубинными бомбами. Адмирал Брейнард отправил из Ардженшии на помощь Хейнеману 4 канадских корвета. Один из них, «Агассиз», 20 июня в 22.30 заметил в миле впереди себя подводную лодку. «Агассиз» атаковал ее глубинными бомбами, одна из которых взорвалась с таким грохотом, что на нескольких транспортах решили, что их судно торпедировано, и пустили сигнальные ракеты. В их свете стала видна вторая субмарина, находившаяся в середине строя. Ближайшие торговые суда, имевшие орудия и военные команды, обстреляли ее и вынудили погрузиться. Корабли сопровождения метались вокруг конвоя, бессмысленно тратя глубинные бомбы. Радар отказал, и субмарина скрылась. Конвою ONS-102 посчастливилось прорваться, потеряв всего 1 судно.

Капитан 2 ранга Хейнеман, один из лучших командиров групп сопровождения, краснолицый, просоленный морской волк, привел 7 различных типов ошибок, которые помешали ему прикончить вражеские лодки. Самой важной было отсутствие единой доктрины борьбы с ними. Кораблям сопровождения требовались определенные правила охоты за погрузившейся подводной лодкой, чтобы как можно лучше использовать средства обнаружения и оружие. Хорошим началом послужил бюллетень, выпущенный 9 июля 1942 главнокомандующим, который стал итогом работы Бостонского центра и приданных ему ученых. В нем достаточно простым языком, который могли понять даже офицеры флота, описывались германские лодки и их возможности. В этом же бюллетене описывались основные правила и методы действия кораблей сопровождения конвоя и патрульных кораблей: принципы использования гидролокаторов, радаров, пеленгаторов, методы корабельных, авиационных о совместных атак.

Оглядываясь назад, можно сказать, что самым важным вкладом в борьбу с растущей подводной угрозой стали: увеличение числа эскортных кораблей, создание системы анализа результатов боев и системы обучения, огромный боевой опыт. Конвои все спокойнее проходили своими маршрутами, но корабли сопровождения никак не могли доиться серьезных успехов в уничтожении субмарин. В первые 6 месяцев 1942 флоты союзников потопили только 21 подводную лодку противника, в том числе 7 итальянских. Из этого числа американцы потопили только 5 единиц. Но за этот же период Германия построила 123 новые подводные лодки. К июню в среднем 60 лодок ежедневно патрулировали в Атлантике.

Этот период противолодочной борьбы завершился суровым предупреждением, сделанным генералом Маршаллом в письме адмиралу Кингу от 19 июня 1942:

Ответ адмирала Кинга и флота мы еще опишем позднее. А теперь мы должны вернуться на Тихий океан, где ход войны уже повернулся после великой битвы при Мидуэе.

«Ситуация на Тихом океане крайне тяжелая», — писал президент Рузвельт Уинстону Черчиллю 9 марта 1942. Первые 4 месяца 1942 были самым тяжелым периодом войны для союзников, причем на всех фронтах. Казалось, что вступление Америки в войну лишь увеличит число жертв, которые войска Оси разорвут в клочья. На Восточном фронте после зимнего затишья германские армии возобновили победоносное наступление на Кавказ. Сокрушительные удары германских подводных лодок и итальянские боевые пловцы в гавани Александрии превратили британский Средиземноморский флот в эскадру крейсеров и эсминцев. На просторах Атлантики и в Карибском море подводные лодки топили наши торговые суда гораздо быстрее, чем мы их строили. На Среднем Востоке Роммель успешно выполнял приказ Гитлера задавить англичан. На Дальнем Востоке японцы готовились вышвырнуть американцев, англичан и голландцев из их последних крепостей. Но потом для союзников мелькнул луч света в Коралловом море и зажглась заря над Мидуэем. Россия успешно отстояла Москву и Сталинград, Окинлек выиграл первую битву у Эль Аламейна, и к войскам свободы вернулась надежда.