Первыми кавалерами ордена Ушакова стали весной 1944 года 14 офицеров Северного флота, удостоившиеся ордена Ушакова 2-й степени. Среди них – Герой Советского Союза подводник капитан 1-го ранга И. А. Колышкин, Герой Советского Союза летчик В. В. Пирогов, летчики морской авиации Е. В. Петренко и Д. В. Осыка.

На Черноморском флоте первое награждение орденами Ушакова и Нахимова состоялось 16 мая 1944 года в честь освобождения Крыма и Севастополя.

Орденом Ушакова 1-й степени были отмечены командир бригады подводных лодок Черноморского флота контр-адмирал П. И. Болтунов и командующий ВВС Черноморского флота генерал-лейтенант авиации В. В. Ермаченков за выдающиеся заслуги, умелое и мужественное руководство кораблями, авиацией и артиллерией флота.

Военачальником, удостоенным ордена Нахимова 1-й степени № 1, стал заместитель командующего Черноморским флотом и начальник береговой обороны генерал-майор П. А. Моргунов. Бывший рабочий завода «Динамо», П. А. Моргунов в 1917 году вступил в Красную гвардию, брал у юнкеров Кремль, а с 1918 года служил в Красной армии. Долгие годы П. А. Моргунов строил укрепления в Севастополе, а во время войны, эвакуируясь из города, взрывал их. В 1944 году он отбивал их у врага и снова строил.

За умелое руководство войсками при обороне Крыма и последующим освобождении его от врага П. И. Моргунов первым удостоился ордена Нахимова 1-й степени.

Первым кавалером ордена Ушакова 1-й степени на Балтике стал адмирал В. Ф. Трибуц. Окончив в 1917 году фельдшерскую школу, будущий адмирал пришел на флот, воевал под Нарвой в Первом Северном летучем морском отряде под командованием легендарного П. Е. Дыбенко. Затем В. Ф. Трибуц сражался на кораблях Волжской военной флотилии, совершив героический рейд от верховьев Волги до Астрахани. В 1939 году его назначили командующим Балтийским флотом. За героическую оборону Ленинграда, освобождение Таллинна и блистательно проведенную операцию в Моонзундском архипелаге В. Ф. Трибуц был удостоен ордена Ушакова 1-й степени.

Летом 1944 года на Балтике получили орден Ушакова 2-й степени катерники-торпедоносцы Герой Советского Союза капитан III ранга С. А. Осипов, офицеры В. П. Гуманенко, Б. П. Ущев и И. С. Иванов.

На Тихоокеанском флоте флотоводческими орденами первыми были награждены контр-адмирал И. Г. Святов, офицеры В. А. Кринов и А. В. Фадеев.

Всего за время Великой Отечественной войны ордена Ушакова 1-й степени удостоились 45 человек, 2-й степени – 182 человека. Ордена Нахимова 1-й степени были удостоены 75 человек, 2-й степени – 458 человек.

За заслуги в боевых действиях на морских театрах орденом Ушакова 1-й степени было награждено 10 частей, соединений и кораблей, а орденом Ушакова 2-й степени – 5.

Из воинских соединений первыми орден Ушакова 1-й степени получили Краснознаменная бригада подводных лодок Северного флота и 9-я штурмовая Ропшинская Краснознаменная авиационная дивизия.

В ВМФ Советского Союза была воинская часть, на знамени которой орден Ушакова соседствовал с орденом Нахимова. Это минно-торпедный авиационный Таллиннский Краснознаменный полк.

Орденом Ушакова 1-й степени была награждена и 1-я бригада траления Черноморского флота. Ее боевая деятельность началась во время обороны Севастополя, когда моряки сорвали все попытки гитлеровцев заблокировать и уничтожить наши корабли. Корабли 1-й бригады обезвредили тысячи вражеских мин, расчистили рейды и фарватеры многих портов Черного и Азовского морей.

Орденом Ушакова 1-й степени в ноябре 1944 года была награждена и Краснознаменная бригада подводных лодок Северного флота. Она совершила более 400 боевых выходов в море и потопила сотни вражеских кораблей. В этой бригаде служили пять Героев Советского Союза и около двух тысяч матросов, старшин и офицеров-подводников, награжденных орденами и медалями СССР.

Такую же награду получила Днепровская военная флотилия, отличившаяся в боях при взятии Берлина. Моряки перебрасывали через реку Шпрее войска и технику, буксировали понтоны с танками. 13 моряков этой флотилии за бои в Берлине удостоились звания Героя Советского Союза.

Ордена Нахимова удостоивались офицеры и адмиралы ВМФ за обеспечение активных действий нашего флота, нанесение врагу значительного урона и сохранение при этом своих сил. В статуте ордена были учтены особенности боевой тактики адмирала П. С. Нахимова, которому были присущи активность в действиях, стремление нанести врагу значительный урон и сохранить свои основные силы. Это было подтверждено в морском сражении при Синопе и во время героической обороны Севастополя в середине XIX века.

Первым ордена Нахимова 2-й степени был удостоен летчик-штурмовик Северного флота младший лейтенант Н. И. Васин за неоднократно проявленные зимой 1944 года мужество и находчивость.

Орденом Нахимова 1-й степени было награждено 10 частей, соединений и кораблей, а орденом Нахимова 2-й степени – 5.

Орденов Ушакова и Нахимова были удостоены адмиралы и генералы Советского ВМФ Н. Е. Басистый, Л. А. Владимирский, Л. М. Галлер, А. Г. Головко, С. Г. Горшков, И. Д. Елисеев, В. В. Ермаченков, И. С. Исаков, Н. Г. Кузнецов, Г. И. Левченко, Ф. С. Октябрьский, Ю. Ф. Ралль, М. И. Самохин, В. Ф. Трибуц, Г. X. Холостяков и другие. Некоторые из них были награждены флотоводческими орденами дважды.

Медалью Ушакова награждался рядовой, старшинский и сержантский состав ВМФ за личное мужество и отвагу на морских театрах военных действий.

Медалью Нахимова, кроме того, награждались и лица, «не состоявшие в рядах Военно-морского флота, которые в борьбе с врагами Советского государства на морских театрах своими умелыми, инициативными и смелыми действиями, сопряженными с риском для жизни, способствовали успешному выполнению боевых задач кораблей, частей Военно-морского флота и их подразделений».

Главстаршина Г. М. Давиденко, пришедший на Балтийский флот еще в 1936 году по комсомольской путевке, стал одним из первых моряков, получивших медали Ушакова и Нахимова. Во время обороны острова Ханко его катер 11 раз высаживал десант на финские острова. В 1942–1944 годах он успешно выполнил 121 боевое задание по тралению мин, дозору и конвоированию кораблей. Впоследствии Г. М. Давиденко удостоился звания Героя Советского Союза.

Медали Ушакова и Нахимова получили подводники главстаршина Ф. Кудрявцев, старшина 2-й статьи И. Фадеев, краснофлотец Л. Федотов и другие.

Всего за годы Великой Отечественной войны более 14 тысяч человек были награждены медалью Ушакова и почти 13 тысяч – медалью Нахимова.

«Бывая на флотах, – писал адмирал Н. Г. Кузнецов, – мне довелось видеть, с какой гордостью носили моряки свои награды. Не раз слышал, что награждение медалями Ушакова или Нахимова офицеров – знак высшего отличия, свидетельствующий об их личном мужестве и участии в боях вместе с рядовым составом. Особенно ценили медали морские пехотинцы и артиллеристы береговой обороны: награждение медалями Ушакова и Нахимова свидетельствовало о их причастности к Военно-морскому флоту, чем моряки очень гордились независимо от того, где им приходилось воевать – на суше или на море».