Наши потери во время сражения, длившегося около часа, составили несколько человек ранеными. У мятежников было 22 человека убито и 40 человек ранено, причём большинство смертельно. Всех пленных отправили в монастырь. Мы собрали их амуницию и полковые повозки. Всё это было отправлено в штаб-квартиру. Затем я послал офицера в Москву с донесением о сражении. Всё следующее утро мы собирали трофеи, разбросанные в лагере и в поле.

Июня 19. Был отдан приказ, чтобы мятежники выдали зачинщиков и руководителей бунта. Большинство стрельцов было подвергнуто допросам с целью выявить руководителей мятежа. В 1-м стрелецком полку была проведена перекличка: виновных отводили в одну сторону, невиновных — в другую. После обеда той же процедуре был подвергнут другой полк.

Июня 20-21. Продолжались допросы стрельцов с применением пыток, чтобы выявить истинные их намерения.

Июня 22. 24 человека признались в своих страшных преступлениях, которые они намеревались сотворить по прибытии в Москву: перебить часть бояр и добиться введения новых правил службы и повышения жалованья. Они были приговорены к смертной казни через обезглавливание. Все приговорённые исповедались и приготовились к смерти.

Июля 23. Утром состоялась казнь, а четвёртый полк подвергнут перекличке.

Июня 24. Я написал письмо Его Величеству с отчётом о случившемся.

Июня 25. Весь этот день и дальнейшие мы занимались следствием с утра до вечера. Многие стрельцы были подвергнуты пыткам, часть из них созналась...

Июня 28. Несколько стрельцов, признавших свою вину, были повешены.

Июня 29. Отметили день рождения Его Величества, много пили за его здоровье и стреляли из пушек. Большая группа стрельцов была направлена под сильной охраной в различные монастыри.

Июня 30. Многие стрельцы из полка полковника Хандертмарка были подвергнуты пыткам, но ни один из них не признал себя виновным. Им сообщили, что они подвергнутся жеребьёвке и десятая часть людей, та, на которую падёт жребий, будет казнена. Около 200 стрельцов подвергнуты наказанию кнутом.

Июля 1. Утром доставлены те 45 стрельцов из полка Хандертмарка, на которых пал жребий. Им сообщили, что если они назовут имена зачинщиков, то их освободят. После некоторого колебания они сообщили несколько имён. Затем зачинщики сознались под пытками в своих преступлениях.

Июля 2. Около 70 человек сразу было повешено, по пять и по три на одной виселице. Гораздо большое количество подвергнуто заключению.

Июля 3. Последовал указ о роспуске войска... Три полка были отправлены тотчас же. Генералиссимус и я с Бутырским полком остались там ещё на ночь.

Июля 4. Утром четыре стрельца, приговорённые в воскресенье к смерти, были обезглавлены. Большинство приговорённых, за редким исключением, относились к смерти равнодушно. Без всяких слов, лишь перекрестившись, они спокойно ложились под топор палача. Всего было казнено 130 человек, около 70 убиты в сражении или умерли от ран, 1845 отправлены в тюрьмы и монастыри. 25 осталось в заключении в (Воскресенском) монастыре...

Июля 19. Меня вызвали в Преображенское. Там зачитали благодарственное письмо Его Величества, в котором он высоко оценил мою службу. Затем оно было зачитано солдатам. За верную службу им обещано каждому по рублю, не считая царского угощения. Для нас был устроен роскошный пир...»

Бой под стенами Воскресенского монастыря, длившийся около часа, стал едва ли не самой большой заслугой служилого генерала-шотландца перед домом Романовых. Он бесстрашно пытался уговорить стрельцов покориться государевой воле:

— Повторяю вам царское слово: вернитесь на литовский рубеж и выдайте зачинщиков. Тогда будет вам прощение...

Однако его слова и твёрдость лишь ещё больше разъярили бунтовщиков. Многие из них были готовы на всё, зная по прежним делам, что пощады им не будет. Стрельцы стали выстраиваться в полки, готовясь к атаке на царских слуг перейти Истру.

После неудач переговоров генерал Гордон действовал решительно. Он наголову разбил нестройные стрелецкие толпы артиллерией. Причём первый залп был дан поверх голов. Его противник не знал ни порядка, ни воинского строя. И не имел далее малых пушчонок для ответного огненного боя. Не помогла московским стрельцам и древняя молитва русских ратников:

«Даруй, Господи, одоление на агарян и филистимлян, иноверных языцев...»

Гордон в истории государства Российского стал тем военачальником, который не позволил взбунтовавшимся стрелецким полкам «добыть Москву грудью». Стал тем человеком, который сокрушил последнюю надежду заточенной в Новодевичьем монастыре царевны Софьи Алексеевны возвратиться с помощью стрельцов на Московское царство.

После подавления вооружённой рукой стрелецкого бунта и проведения «розыска» с многочисленными казнями (были казнены выявленные зачинщики и каждый десятый пленённый), генерал Патрик Гордон занемог «от трудов» и отправился в своё подмосковное имение, дарованное ему государем за Второй Азовский поход. Там он занимался хозяйством вплоть до получения известия о возвращении царя из-за границы 25 августа 1698 года.

Своих мужиков-крепостных шотландский дворянин, а ныне богатый московский помещик поучал словами, сказанными довольно сносно по-русски:

   — Работайте в поле не как вздумается каждому. Теперь трудитесь как в Голландии, где земля не лучше вашей. Порядок должен быть всюду и во всём. И Бога не забывайте, мужики. Батоги для вас должны быть последним словом в науке трудиться на моей земле.

Мужики, стоявшие вокруг своего нового хозяина-барина с потупившимися в землю взорами, в голос молвили:

   — Спасибо тебе на добром слове, господин ты наш. Век Бога будем молить за твоё здравие, наш милостивый государь.

   — То-то. Работайте без прежней лени и Бога с царём не забывайте...

Пётр I при отъезде из Европы в Россию соблюдал инкогнито. Он спешил, опасаясь за державную власть, которую кто-то, а скорее всего сестрица Софья Алексеевна из рода ненавистных Милославских, пытался руками мятежных стрельцов вырвать у него из рук.

Из-за этого неожиданное прибытие царя в Первопрестольную обошлось без пышных и официальных встреч. Инкогнито государь соблюдал и вечером того дня, когда он прибыл в свою столицу. Уже в одном этом для боярства и стольного люда было что-то зловещее, предгрозовое.

Всё же весть о том, что царь-государь находится в пути в свой стольный град, дошла до Москвы. В тот день, когда в кремлёвском Успенском соборе шла обедня, князь-кесарь неожиданно для всех взошёл на амвон и, повернувшись к боярам, посохом звякнул о мраморные плиты:

   — Великий государь Пётр Алексеевич изволит быть на пути из цесарской столицы града Вены в Москву. Помолимся за его здравие...

Иоганн Георг Корб записал в «Дневнике путешествия в Московию», что царь не пожелал остановиться в Кремлёвском дворце, а, «посетив с необычайной в другое время для его величества любезностью несколько домов, которые он отличал перед прочими неоднократными знаками своей милости, он удалился в Преображенское и предался там отдохновению и сну среди своих солдат».

Один из этих домов, отличённых знаками внимания, был дом Гордона, куда государь заезжал спросить о генерале и не застал его. Известие об этом неожиданном визите было тотчас же сообщено Патрику Гордону в его рязанскую деревню Красную Слободу полковником Левистоном. И шотландец немедленно поспешил в Москву.

Он торопился увидеть царя, страшно истосковавшись по монарху-покровителю. Кучера барской тележки на «железном ходу» генерал подгонял немилостиво, пообещав тому или полтинник серебром на белое вино или батогов в хозяйском коровнике:

   — Гони! Что есть мочи гони! Прохожие сами отпрянут, а кто замешкается — не твоя вина, кучер. Гони, не жалей лошадей. Государь меня ждёт в Преображенском...

Патрик Гордон ещё не знал, что в его деревеньку из Москвы спешил не только гонец от полковника Левистона. Сам царь, узнав, что служилого иноземца нет на Москве, послал за ним «на Рязань» гонца из сержантов-преображенцев.