На боевом патрулировании в Атлантике оставались три подводные лодки: U31 и U35 флотилии «Зальцведель» и U53 флотилии «Вегенер». Первой — 30 сентября — вернулась на базу лодка U53. За время патрулирования Эрнст-Гюнтер Хайнике потопил два судна общим тоннажем 14.000 т, доведя счёт поражённых целей подводными лодками флотилии «Вегенер» до восьми. 2 октября на базу вернулась подводная лодка U31, поразившая две цели, а на счету подводной лодки U35, вернувшейся на базу последней, оказалось четыре потопленных судна. Всего девять подводных лодок флотилии «Зальцведель» потопили двадцать три судна и одно захватили в качестве приза.

Результаты первого патрулирования двадцати одной подводной лодки в Атлантике приведены ниже:

¹ С учётом судна, захваченного в качестве приза.

² С учётом двух судов, захваченных в качестве приза.

3 сентября в Северном море находились семнадцать подводных лодок «каноэ» и одна океанская подводная лодка VII серии — U36. После капитуляции Польши в Северное море были направлены ещё шесть лодок «каноэ», базировавшихся до того в портах Балтики. Таким образом, в первый месяц войны из тридцати находившихся в строю подводных лодок «каноэ» двадцать три действовали в Северном море.

В первой половине сентября четыре лодки «каноэ» поставили тридцать две донные мины с магнитными взрывателями на путях наиболее оживлённого торгового судоходства. Два минных заграждения, установленные у Дувра и Хартпула, успеха не принесли. Зато на минах, поставленных лодкой U31 под командованием Карла Даублебски фон Эйххайна у Ордфорднесса, подорвались три судна общим тоннажем 15.967 т, а на минах, поставленных лодкой U15 под командованием Хайнца Бухгольца у мыса Фламборо-Хед, подорвались два судна общим тоннажем 4274 т. Все эти суда затонули.

Остальные подводные лодки находились на боевом патрулировании. Две лодки «каноэ» U9 и U19 патрулировали у северо-восточного побережья Шотландии, лодка U14 дежурила у входа в залив Скапа-Флоу, а лодка U20 находилась в Норвежском море у Нарвика за Северным полярным кругом. Другие лодки патрулировали в проливах Каттегат и Скагеррак.

Максимальная продолжительность патрулирования подводной лодки «каноэ» (определявшаяся запасами топлива) составляла восемнадцать дней. Некоторые лодки «каноэ» отправлялись на боевые позиции прямо из Вильгельмсхафена, другие сначала шли в Киль Кильским каналом. Часть лодок «каноэ» базировалась в Киле, откуда они шли в Северное море проливами Скагеррак и Каттегат. Каждое новое патрулирование требовало предварительного ремонта, переоборудования и переукомплектования длительностью не менее недели — в случае если подводная лодка не нуждалась в более серьёзном ремонте. В сентябре 1939 года лишь несколько лодок «каноэ» дважды находились на патрулировании.

Северное море и в годы войны было районом оживлённого торгового судоходства. Морские просторы бороздили не только суда под английским флагом, но и под флагами многих нейтральных стран: Норвегии, Дании, Швеции, Финляндии, Эстонии, Латвии, Литвы и ряда других. Многие суда перевозили не только оружие, но и топливо, сырьё, продовольствие. Вместе с тем всё ещё действовали призовые законы. Тихоходные малые подводные лодки «каноэ» не были приспособлены для соблюдения процедур, предусмотренных призовым правом. На их долю оставалось атаковать военные корабли, подводные лодки и суда, эскортировавшиеся силами охранения.

Найти подходящую для атаки цель было непросто. В сентябре подводные лодки «каноэ» не потопили ни одного военного корабля, хотя лодка U21 под командованием Фрица Фрауенхайма и лодка U24 под командованием Удо Беренса и пытались дать бой у северо-восточного побережья Шотландии английским эсминцам, а лодка U14 под командованием Хорста Вельнера и лодка U22 под командованием Вернера Винтера пробовали расправиться с неприятельскими подводными лодками.

До 22 сентября «каноэ» ограничились уничтожением лишь одного торгового судна: лодка U7 под командованием Вернера Хайделя потопила английское грузовое судно «Эйкенсайд» тоннажем 2700 т, совершавшее одиночное плавание. Ещё одну цель — английское каботажное судно «Труро» вместимостью 1000 т — поразил Вильгельм Фролих, командир подводной лодки VII серии U36.

Тем временем поток запрещённых грузов, перевозимых по Северному морю, с каждым днём возрастал. 23 сентября в Данциге Редера принял Гитлер. Редер настаивал на снятии хотя бы ряда ограничений, касавшихся проведения боевых операций против торгового судоходства. В то время Гитлер, убедившись, что Англия и Франция не собираются прекращать войну, уже вынашивал планы завоевания Франции, рассчитывая, что после её разгрома англичане сами запросят мира.

Уже на следующий день после встречи Редера с Гитлером Дёниц получил директиву морского штаба, касавшуюся военных действий против торгового судоходства. Согласно директиве, подводные лодки получали право вести военные действия против французских судов и устанавливать минные заграждения во французских прибрежных водах. Кроме того, разрешалось захватывать или топить любое судно союзников, подавшее в эфир сигнал бедствия SSS, после предоставления экипажу и пассажирам удовлетворительных средств спасения или, по крайней мере, после попытки оказать помощь такого рода. И наконец, подводные лодки получали право топить, руководствуясь призовыми законами, любые суда с менее чем ста двадцатью пассажирами на борту[83].

Разрешение топить французские суда открыло перед немецким подводным флотом хорошие перспективы. Появилась возможность атаковать конвои союзников ночью из надводного положения, а количество вероятных целей увеличилось почти на 500 торговых судов общим тоннажем около 2,7 млн брт. Разрешение топить любые суда, подавшие в эфир сигнал SSS, устраняло длительную процедуру досмотра и уменьшало риск внезапного нападения.

Получив, в свою очередь, приказ Дёница, подводники активизировали свои действия. Подводная лодка U7 под командованием Хайделя потопила два норвежских грузовых судна, а подводная лодка U4 под командованием Харро фон Клот-Хайденфельдта — три судна: одно норвежское и два финских. Подводная лодка U16 (командир лодки — Ханнес Вайнгартнер) пустило на дно шведское судно, а лодка U3 (командир — Йоахим Шепке) — одно датское и одно шведское. Фролих, командир подводной лодки U36 VII серии, одно шведское судно пустил на дно, а второе захватил в качестве приза и привёл на базу после месячного патрулирования. За одну неделю в Северном море немецкие подводные лодки потопили или захватили в качестве приза десять торговых судов общим тоннажем около 13.000 т[84].

Активизация немецких подводных лодок в Северном море не прошла незамеченной. Осло, Стокгольм, Копенгаген и Хельсинки выступили с резкими заявлениями, осуждавшими «пиратские» действия немецких подводников. Гитлеру пришлось пойти на уступки. 30 сентября он запретил вести военные действия против торгового судоходства нейтральных стран.