В ноябре того же года в составе Министерства иностранных дел было учреждено Бюро островов Тихого океана (Нанъёкёку). После начала тихоокеанской войны и быстрого увеличения контролируемых территорий, в правительстве Тодзё весной 1942 года появилась идея создания специального министерства, предназначенного для координации связей между странами и народами в пределах «великой сферы сопроцветания». Новое министерство, получившее название «Дай Тоа сё» — Министерство Великой Восточной Азии, было образовано 1 ноября 1942 года.

Вершиной функционирования «сферы сопроцветания» была Конференция Великой Восточной Азии (Дай Тоа кайги), состоявшаяся в ноябре 1943 года в Токио. На нее были приглашены главы пяти марионеточных правительств: руководитель Реорганизованного национального правительства Республики Китай, премьер-министр Маньчжоу-Го, принц Таиланда, президент Республики Филиппины, основанной Японией за три недели до начала конференции, и лидер Бирмы, получившей «независимость» с помощью японцев в августе 1943 года.

Большими территориями управлять чрезвычайно трудно, поэтому японцы, как и немцы в Европе, в частности в России, делали в военное время основной упор на помощь местных националистов. В Азии это были противники европейского колониализма. В захваченных японцами странах, как отмечалось, были организованы «движения» и «армии», направленные против белых колонизаторов в поддержку нового оккупационного режима. На первых порах это отчасти удалось. Но «сопроцветание» получилось односторонним — только в пользу Японии. На место старого хозяина пришел новый со своими интересами. Один колониальный гнет сменил другой, еще более жестокий. Азиатский колониализм оказался страшнее европейского. На Филиппинских островах за время их оккупации Японией и военного правления японцев, по японским данным, был убит один миллион филиппинцев.

Больше всех от японской агрессии пострадал Китай. По японским сведениям, за восемь лет войны военные потери Китая составили свыше трех миллионов человек, не считая «неисчислимого» числа гражданских лиц. Для японцев такая обтекаемая формулировка была удобна, но для китайцев, корейцев и других жителей Юго-Восточной Азии и островов Тихого океана численность погибших имеет весьма конкретные цифры. Сначала за словом «неисчислимое» стояло 10 миллионов убитых китайцев. В странах, которые Япония успела объединить под своей «крышей» по принципу «хакко итиу», статистика ранее насчитывала около 20 миллионов погибших до конца войны, включая военнопленных и мирное население. Но время идет, появляются новые свидетельства. Сейчас численность своих убитых китайцы определяют в 30 или даже в 35 миллионов человек, как сообщалось в середине 2005 года в газете «Жэньминь жибао». Однако сколько людей было убито во время войны во всей Азии в совокупности и в каждой отдельно взятой стране, до сих пор сказать трудно. При этом уничтожение японской военщиной огромного количества невинных людей на оккупированных территориях сопровождалось невиданными зверствами, что было особо отмечено во время работы Международного военного трибунала над военными преступниками в январе 1946 года в Токио. Поэтому злодеяния захватчиков и многомиллионные людские потери до сих пор часто заставляют азиатское население, в первую очередь китайцев и корейцев, относиться к японцам негативно.

В связи с установлением в Азии и на островах Тихого океана нового жестокого порядка «сопроцветания», принесшего коренному населению угнетение и гибель, очень скоро в захваченных Японией странах появились движения против японского господства.

В Сингапуре, перед его падением, английские колониальные власти успели организовать из китайских коммунистов, выпущенных ими из тюрем, добровольные подпольные организации по борьбе с японцами. В Таиланде, в начале 1942 года, в то время, когда его правительством была объявлена война США и Британии, под руководством регента короля Таиланда начало действовать антияпонское Свободное тайское движение (Дзию тай ундо). На Филиппинах активную борьбу против японских оккупантов и продажного марионеточного правительства, состоявшего из олигархии, ранее занимавшейся бизнесом с Японией, развернула Хукбалахап — Тагальская народная антияпонская армия (Фукубарахаппу). Тагальская армия филиппинских партизан была организована 29 марта 1942 года Филиппинской коммунистической партией. В Индии индийские националисты осудили японскую агрессию в Китае и очень быстро поняли, что Япония хочет заменить в стране английское владычество на свое. Тогда Индийская национальная армия учредила свое собственное, независимое от японцев, командование и отказалась принимать участие в подавлении восстаний против японцев на оккупированных императорской армией территориях. Не дождалась обещанной японцами свободы Индонезия. Независимость страны была провозглашена Сукарно 17 августа 1945 года без посторонней помощи. После этого национальные силы Индонезии начали борьбу за освобождение с голландскими колонизаторами, которые считали, что индонезийцы не смогут самостоятельно развиваться еще лет 100–200. Колониальная война против индонезийского народа длилась до 1949 года и унесла жизни около 5 тысяч голландцев и примерно 100 тысяч индонезийцев. Жалкое зрелище представляло собой карманное Реорганизованное национальное правительство Китая (Нанкин сэйфу), не имевшего возможности существовать без Японии и пытавшееся править под покровительством японцев в занятых ими провинциях. Националистическая армия Чан Кай-ши, поддерживаемая Америкой, и коммунистическая армия Мао Цзэ-дуна, не обращая внимания на это правительство, продолжали вести борьбу с японцами. Не прекращалось движение за независимость в Корее, после более двух тысяч лет культурной самостоятельности вдруг ставшей японской колонией.

В этих условиях кратковременный период блестящих военных побед сменился длительной черной полосой неудач. Расчеты и надежды японцев на то, что воля к сопротивлению американцев и их союзников будет сломлена, а народы Азии поддержат новых оккупантов, не оправдались. Соединенные Штаты, имевшие могучую, с огромными неиспользованными возможностями экономику, нетронутую на Американском континенте мировой войной, с военным потенциалом, во много раз превосходившим японский, сумели за несколько месяцев противостояния выправить положение. К маю 1942 года США и их союзники разработали план совместных действий и организовали оборону, перебросив из Атлантики и других районов авианосные силы, боевые корабли и подводные лодки. Для удержания больших территорий и дальнейшего продвижения вперед японцам требовались техника и все новые дивизии, которых уже стало не хватать. Наступательная инициатива исчерпала себя, и Япония вынуждена была перейти к стратегической обороне.

Первым предупреждением японцам 18 апреля 1942 года стали бомбовые удары по Токио и Иокогаме бомбардировщиками подполковника Д.Г. Дулиттла (Джимми) (1896–1993), поднявшимися с авианосца «Хорнет». Япония в лице гражданского населения наконец-то поняла, что идет война и что она может оказаться совсем рядом. Об этом гражданам страны возвестили все сирены столицы и напомнили взрывы бомб и пожары.

Перелом в войне начался 7–8 мая 1942 года. США в ходе морского сражения к Коралловом море одержали первую победу в серии военных кампаний на Тихом океане. Попытка японцев овладеть юго-востоком острова Новая Гвинея с городом Порт-Морсби с помощью крупного десанта, под прикрытием авианосцев, крейсеров, эсминцев и подводных лодок, вышедших из Рабаула, и тем самым начать осуществление плана по прикрытию коммуникаций между Америкой и Австралией, потерпела неудачу. Хотя американцы и понесли большие потери, японцы получили первый отпор в тихоокеанской войне и непосредственная угроза вторжения, нависшая над Австралией, миновала. Японское соединение и результате атаки американской авианосной авиации потеряла 2 авианосца и эсминец. Японцы отступили. Это было началом конца.