Его смерть нанесла тяжелый удар сунским лоялистам, но Чжан Шицзе сумел вновь сплотить их, хоть и в последний раз. Он возвел на трон сводного брата покойного императора Ши — Бина — и, вместе с Лy Сюфу, стал править от имени малолетнего императора. К тому времени беглецы обосновались на юго-восточной оконечности Китая. Они поселились на острове Наочжоу у берега полуострова Лэйчжоу. Им было ясно, что здесь они смогут лишь на время укрыться от монголов. Встал вопрос о том, что делать дальше. Чэнь Ичжун предложил отправить императора в Чампу (южные области Вьетнама). Так как многие народы Чампы происходили от китайцев и так как они также опасались монгольского нашествия, вероятно, они с радостью примут юного императора. Кроме того, возможно, им будет льстить мысль о том, что они спасут правителя великой империи. Чэнь отправился в Чампу, чтобы выяснить, согласны ли ее правители дать приют сунскому императору. Пока Чэнь был в отъезде, над сунским двором в Наочжоу нависла опасность. Монгольские войска заняли Лэйчжоу, перекрыв путь в Чампу. Лоялисты вновь вышли в море и нашли временное убежище на острове Яйшань, недалеко от Гуанчжоу, уже захваченного монголами.

Монголы подготовились к нападению на окруженную сунскую армию. В начале 1279 г. монгольские войска собрались на юге под Яйшанем. Сознавая превосходство монголов в огневой мощи, Чжан Шицзе попытался избежать окружения, но 19 марта лишь 16 судам удалось прорвать блокаду. В ходе морской битвы с монгольским флотом получил повреждения и императорский корабль. Сообщается, что Лу Сюфу, увидев, что корабль идет ко дну, взял императора на руки и прыгнул вместе с ним за борт на верную смерть. Последний сунский император утонул, и династия Сун наконец прекратила свое существование.

Большинство сунских лоялистов сдались или покончили с собой, однако небольшая их часть поклялась продолжить борьбу. Чжан Шицзе, самый выдающийся представитель непокорных, задумал разыскать потомков сунской императорской семьи в Чампе или Аннаме, чтобы возвести кого-либо из них на императорский престол. С этими мыслями он отправился в Юго-Восточную Азию. Однако, должно быть, он выехал в несчастливый час, так как его корабль в июне 1279 г. попал в бурю, и Чжан Шицзе погиб. Чэнь Ичжун к тому времени уже находился в Чампе, но не мог вернуться после известия о гибели последнего императора. Он остался в Чампе, подготовив почву для прибытия прочих беглецов. В 1283 г., когда монголы вторглись в Чампу, он бежал в Сиам, где и прожил до самой смерти. Вэнь Тяньсян, попав в плен к монголам, отказался служить новым хозяевам и в конце концов был предан казни.

К 1279 г. Хубилай уничтожил остатки династии Сун. Однако теперь перед ним встала, возможно, еще более сложная задача, так как ему нужно было завоевать расположение местного населения. Чтобы привлечь туземцев на свою сторону, он должен был развеять образ завоевателя-«варвара», которого не интересует ничего, кроме ресурсов Южного Китая. Хубилаю следовало создать правительство, которое служило бы монголам, но вместе с тем не слишком угнетало бы местных жителей. Преемственность во внутренней и кадровой политике также облегчила бы переход к установлению монгольского владычества. Почти одновременно с падением Сун Хубилай начал прилагать усилия, чтобы не допустить жестокого обращения с простым народом. В сентябре 1278 г. он приказал Соду и Пу Шоугэну обходиться со своими новыми подданными с должным уважением и отдал военным чиновникам указание не препятствовать простолюдинам заниматься торговлей и земледелием.

Он предупредил, что их собственность должна считаться неприкосновенной. Хубилай издавал сходные распоряжения относительно земель, ранее контролировавшихся Южной Сун, и в начале своего правления. Этот курс принес несомненные успехи. В летописях почти не зафиксированы случаи крупных мятежей и восстаний, а многие талантливые южане перешли на монгольскую службу. Некоторые чиновники и ученые отказались сотрудничать с завоевателями и отошли от дел, но лишь немногие продолжали хранить в душе верность свергнутой династии. Удивительно, с какой легкостью Хубилаю удалось установить монгольскую власть над страной с самым многочисленным в мире населением. Ни одна другая область, завоеванная монголами, не могла сравниться с Южным Китаем по численности населения и богатству. Монголы сумели взять управление в свои руки именно благодаря проводившейся Хубилаем политике. Это замечательный успех, который не следует недооценивать. Задним числом мы знаем, что монголы властвовали над Китаем менее столетия. И все же это не умаляет достижений Хубилая. С точки зрения его современников, как монголов, так и не-монголов, он блестяще управлял Южным Китаем.

Безуспешные попытки покорить Корею предпринимали еще предшественники Хубилая. Чингис-хан в 1218 г. и Угэдэй в 1231-1233 гг. снаряжали туда походы, и хотя им удалось подчинить своей власти обширные области полуострова, в 1233 г. король Кореи укрылся на острове Канхвадо у восточного берега. Клан Чхой, главы которого управляли страной именем короля, оставался непримиримым врагом монголов и не допускал мысли о капитуляции. На какое-то время внимание монголов было отвлечено от Кореи спорами о престолонаследии и другими военными предприятиями, и карательная экспедиция против непокорных корейцев состоялась только при Мункэ. В 1253 г. Мункэ приказал некоему Чжалаэрдаю выступить в поход на корейский королевский двор. Монгольские армии вторгались в Корею в 1253 и 1258 гг.

В обоих случаях корейцы были разбиты на материке, а местное население, уже пострадавшее от ужасной засухи, было доведено до бедственного положения. Те, кто переходил на сторону монголов или изъявлял им покорность, получали возможность вести нормальную жизнь, а ремесленники, подобно своим собратьям в других монгольских владениях, пользовались особыми условиями и часто нанимались завоевателями на службу.

Монгольские войска, сознавая недостаток опыта в морской войне, не пытались захватить остров Канхвадо. Следует признать, что это было мудрое решение, учитывая позднейшие неудачи в Японии и на острове Ява. К счастью для монголов, в это время вспыхнуло возмущение против деспотичного правления клана Чхой. В 1258 г. вследствие военного переворота был лишен власти Чхой Ый, глава клана, а новый правитель стремился наладить отношения с монголами. Наследник престола Чхон отправился в Китай, чтобы изъявить покорность монголам и предложить себя в заложники. Первым монгольским князем, которого Чхон встретил в Китае, был Хубилай. Так как Мункэ находился в Сычуани и готовил вторжение в империю Сун, Хубилай остался главным лицом в Восточном Китае. Он тут же без раздумий принял корейского принца в свою свиту и обошелся с ним весьма благосклонно.

Через несколько месяцев отошли в мир иной и Мункэ, и корейский правитель. Хубилай, при поддержке своих китайских советников, решил сделать ставку на наследника престола. Он отпустил молодого принца, наказав ему вернуться на родину и отстаивать свои права на корону. Новому королю дозволялось сохранить часть властных полномочий, но вместе с ним в делах правления должен был участвовать постоянный представитель монгольского двора. Хубилай рассчитывал на верность и «добродетель» (в конфуцианском смысле слова) будущего корейского государя. В конце 1259 г. принц в сопровождении монгольских войск прибыл в Корею и взошел на престол, приняв имя Вонджон. Он вскоре доказал свою преданность и «добродетель», отправив наследника заложником ко двору Хубилая. Хубилай, в свою очередь, наделил корейского принца нефритовым поясом и прочими подарками. На протяжении последующего десятилетия отношения между корейским королем и монгольским ханом неизменно улучшались. Корейский правитель время от времени отправлял ко двору Хубилая посольства с данью, а Хубилай отвечал щедрыми дарами и предоставлял корейским купцам всевозможные льготы. Во времена экономического спада Хубилай прибегал за помощью корейцев, поставлявших империи хлеб и мясо. Он также постоянно напоминал своим пограничным войскам о запрете грабить корейские земли и устраивать прочие бесчинства. Точно так же его чжурчжэньские подданные в Маньчжурии получили указания воздерживаться от набегов на Корею. Вследствие этого между Вонджоном и Хубилаем поддерживались дружеские отношения, так что, например, в 1266 г. монгольский император послал приболевшему корейскому королю лекарства.