И вот весной 1361 года злобная банда Хоквуда, рукотворная чума, покинула Пон-Сен-Эспри под благородным покровительством Церкви и неумолимо двинулась в сторону Италии, оставляя за собой след из смертей и разрушений.

Слухи о походе Белой компании на Милан были настолько тревожными, что вызвали волнения по всей Италии еще до того, как это событие произошло. Стремясь создать линию обороны перед ожидаемым вторжением, Бернабо Висконти и его армия поспешно отступили после столкновений с кардиналом Альборносом в Болонье. После ухода миланцев венгры нанятые для защиты интересов Церкви в Болонье, внезапно оказались без работы, но вскоре исправили это, объединившись в еще одну вольную компанию, которая затем самостоятельно отправилась на поиски легкой добычи на юг. Весть о наличии этой грозной боевой силы, готовой продать свои услуги тому, кто больше заплатит, вскоре дошла до Людовика Дураццо, все еще страдавшего от поражения, нанесенного ему Людовиком Тарентским. Он пригласил Ханнекена фон Баумгартена, одного из лидеров Венгерской компании, на тайную встречу в замке Дураццо в Фоджии, и сделка была заключена. К марту 1361 года 2.500 человек из Венгерской компании находились в Абруцци, готовые оказать помощь в мятеже против неаполитанской короны.

За последние семь лет, это был третий мятеж, поднятый Людовиком Дураццо. Позднее Никколо Аччаюоли напишет об этом периоде, что Иоанне и Людовику Тарентскому "приходилось постоянно питаться зелеными плодами… Их так донимали смутные обстоятельства и постоянно меняющиеся и дорогостоящие события, явные или тайные, вызванные внутренними или внешними причинами, что как только одна буря стихала, ее тут же сменяла другая"[227]. Ситуация была настолько опасной, что Людовик Тарентский, в чьем ведении находились военные вопросы, издал эдикт, призывающий всех вассалов сражаться на стороне короны. И король, и королева чувствовали настоятельную необходимость как можно скорее вступить с врагом в сражение, чтобы свести к минимуму потери среди мирного населения, которое, несомненно, будет объектом грабежа и мародерства до тех пор, пока Венгерская компания остается в пределах королевства. "Чтобы наше намерение стало известно всем, — сообщал Людовик Тарентский в эдикте, опубликованном по всему королевству, — мы торжественно обещаем верой и словом короля, засвидетельствованным  великим сенешалем Никколо Аччаюоли, сделать все возможное, чтобы это сражение состоялась; поскольку мы предпочитаем отдать свою жизнь за наших подданных, а не ждать от врага разорения, которое потом трудно будет восстановить"[228].

И снова великий сенешаль, спешно отозванный из Болоньи, возглавил оборону королевства. 25 мая 1361 года ему удалось, заплатив значительную сумму серебром, переманить Венгерскую компанию со службы Людовику Дураццо на службу Иоанне и Людовику Тарентскому. Хотя бандиты, к ужасу своих нанимателей, оказались очень ненадежными союзниками, поскольку несколько раз за несколько месяцев меняли сторону между Людовиком Дураццо и Людовиком Тарентским, Никколо, используя дипломатические каналы для связи с венгерским двором, в конце концов добился того, что наемники вновь отправились воевать против Милана. В декабре 1361 года Венгерская компания окончательно покинула королевство и двинулась на север. Людовик Дураццо, лишенный большей части своих войск и преследуемый отрядом рыцарей во главе с сыном Никколо, графом Мельфи, попытался укрыться в святилище Михаила Архангела в Монте-Гаргано, почитаемом месте паломничества, но местное население против него ополчилось. Вынужденный ночью бежать, он был по дороге схвачен и доставлен к королевскому двору Неаполя. 6 февраля 1362 года, признав свое поражение, Людовик Дураццо покорился королю и королеве. Затем последний оставшийся в живых принц из некогда могущественного дома Дураццо был, по воле короны, препровожден в королевскую тюрьму Кастель-дель-Ово.

Заключение Людовика Дураццо в тюрьму ознаменовало конец ожесточенной борьбы за власть между соперничающими группировками внутри семьи Иоанны. Безжалостный план Екатерины Валуа по возведению одного из своих сыновей на Неаполитанский трон, запущенный при ее жизни и реализованный после ее смерти ее протеже Никколо Аччаюоли, казалось, наконец-то окончательно восторжествовал над амбициями ее соперницы Агнессы Перигорской. Людовик Тарентский был женат на королеве, а его брат — на ее младшей сестре, и наследование трона, благоприятствующее дому Таранто, а не дому Дураццо, казалось, было обеспечено.

Но судьба способна расстроить даже самые очевидные результаты. Через два месяца после заключения Людовика Дураццо в тюрьму, к ужасу всего населения, в Неаполитанское королевство неожиданно вернулась чума, и на этот раз ее жертвой стал король. 24 мая 1362 года в возрасте тридцати пяти лет Людовик Тарентский, заразившись смертельной болезнью, принял последнее причастие из рук священника и умер.

Хотя жестокое поведение Людовика Тарентского и его посягательства на прерогативы жены привели к тому, что королева не стала оплакивать его кончину (в июне королева написала Иннокентию VI, официально известив его о смерти "такого мужа"[229]), но Иоанна к тому времени была достаточно опытна, чтобы предвидеть, что после обнародования известия о кончине короля у ее правительства возникнут проблемы. "Наше положение… [возможно] недостаточно защищено от порочных намерений", — заметила она Папе в том же письме[230]. Два брата Людовика, Роберт и Филипп, несомненно, захотят поучаствовать в управлении королевством и сохранить положение и власть, которых они добились при жизни своего брата; существовала даже вероятность того, что Филипп, теперь уже законно женатый на Марии, попытается совершить переворот, чтобы заменить Иоанну ее сестрой и короновать себя королем. Чтобы выиграть время для подготовки к отпору посягательствам на ее власть, королева держала смерть мужа в тайне, пока принимала меры по установлению полного контроля над двором. Поскольку чума была очень заразной, она приказала тайно, под покровом ночи, вывезти тело Людовика из Кастель-Нуово и временно поместить его в близлежащей церкви Сан-Пьетро, чтобы самой не заразиться. Позже по королю Неаполя устроили государственную панихиду в церкви Сан-Доменико-Маджоре, а затем похоронили рядом с его матерью в монастыре близ Авеллино.

Быстро протекавшая болезнь и скорая кончина мужа способствовала замыслам королевы. Людовик скончался так быстро, что ни у кого за пределами дворца не было причин заподозрить неладное. В течение десяти дней Иоанне тихо отсиживалась в Кастель-Нуово, пока обдумывала свои действия. Людовик Тарентский не оставил завещания, заявив, по словам Маттео Виллани, "что у него нет ничего, что он мог бы завещать лично, и что все принадлежит королеве Иоанне"[231], что свидетельствует о том, что в конце концов король признал более высокое положение и законность правления своей жены. Однако, возможно, сожалея о своем суровом обращении с кузеном, он, находясь на смертном одре, попросил освободить Людовика Дураццо из тюрьмы. Иоанна выполнила эту просьбу и освободила Людовика Дураццо, тем самым заручившись благодарностью кузена. Получив нового союзника против грозных братьев своего мужа, она созвала Большой Совет, и 5 июня в присутствии архиепископа Неаполитанского и самых знатных баронов и прелатов королевства объявила о смерти короля и публично вступила на трон как единоличная правительница королевства, что она, очевидно, намеревалась закрепить навсегда.