После падения Белграда в турецкой армии начался хаос. Армия императора двумя колоннами быстро продвигалась через Западную Сербию и Моравскую долину к югу, и вскоре были взяты города Чачак, Ужице, Ниш, Скопле. Численность ее значительно выросла, благодаря тому, что по мере продвижении на юг к ней присоединялись сербы. После вступления в войну Венеции в 1684 г. начали меняться границы в приморских областях. Тогдашний сербский патриарх Арсений III Чарноевич открыто сотрудничал и встречался с командованием габбсбургских и венецианских войск. Однако после занятия Косово и Северной Македонии в армии началась чума, а далее последовало нападение французов на земли Габсбургов в Германии и турецкое контрнаступление, что в короткое время изменило ситуацию.

После поражения под Качаником (3 января 1690 г.) началось отступление императорской армии на север, предварившее бегство местного населения, опасавшегося мести турок. На протяжении недель и месяцев длинная вереница людей двигалась к Белграду, все время разрастаясь за счет притока новых беженцев. Пытаясь остановить столь неблагоприятное развитие событий, император в июне 1690 г., выступая как венгерский король, обратился к балканским христианам с манифестом, призывая их не покидать своих домов, взяться за оружие и присоединиться к армии. Он обещал сохранение всех старых привилегий, прежде всего права избрания воеводы, освобождение от податей и прочих повинностей, кроме действовавших до турецкого завоевания. Это касалось освобожденной Сербии, которую в тот момент турки вновь покоряли, а население готовилось ее покинуть.

Решение было очевидным, и в июне 1690 г. собрание виднейших сербских лидеров во главе с патриархом направило из Белграда владыку Исайю Джаковича в Вену просить церковной автономии и юрисдикции патриарха, аналогичной той, что утвердилась при турках. В августе, когда началась переправа сербов через Саву, император даровал первую из тех привилегий, которые в следующем столетии окажут значительное влияние на положение сербского народа в монархии Габсбургов. Сербам гарантировались свобода вероисповедания, применение старого календаря, свободное избрание архиепископа, управлявшего церковью и рукополагавшего епископов и священников. Очевидными были отличия от тех требований, которые в начале века выдвигал воевода Грдан. Светская часть сербского общества в тот момент никак о себе не заявляла, хотя миряне активно участвовали в войне и переселениях. Этому, разумеется, способствовало отсутствие правящего слоя, подобного тому, который существовал в областях с племенной организацией общества, а также стремление габбсбургских властей предотвратить возможное появление конкурентов в управлении сербами.

Об этом красноречиво говорит эпизод с самозваным деспотом Джордже II Бранковичем, провозгласившим себя потомком средневековой династии. Серб из Трансильвании, служивший в качестве дипломата и царедворца при трансильванском и валахском дворах, а позднее и при габбсбургском дворе, добился высоких титулов барона и графа (он даже утверждал, что был миропомазан патриархом при принятии титула деспота). В военных действиях он не участвовал, но требовал дарования ему титула деспота и назначения помощником командующего императорской армией. Венский двор использовал его, а летом 1689 г. изолировал, заключив в тюрьму, что, однако, не помешало ему, находясь в заключении, оказывать влияние на сербских вождей.

Перед взятием турками Белграда в октябре 1690 г. последние сербы переправились через Саву и постепенно продвигались к северу. Часть их осталась в Среме, Бачке, Баранье, прочие поселились дальше, близ Буды и Сентандреи. Патриарх Арсений III утверждал, что вместе с ним переселилось 30 тысяч человек (в другой раз он называл цифру 40 тысяч). Эта цифра, конечно, завышена, однако установить реальное число переселенцев не представляется возможным. Расселение беженцев сопровождалось трениями в местным населением и властями, особенно в городах.

Поэтому император в декабре 1690 г., через Венгерскую придворную канцелярию, издал «защитный патент», подтверждая данные ранее обещания и предписывая нижестоящим органам власти исполнять их. Дарованные права и свободы касались всех сербов. В 1691 г. на соборе в Буде остро встал вопрос о светском лидере, причем сербские старейшины хотели видеть на этом месте находившегося в заключении деспота Джордже Бранковича. Его провозгласили деспотом, но двор не согласился с этим и предложил половинчатое решение, назначив «подвоеводу», — им стал офицер императорской армии Йован Монастерлия, который сначала был принят с недоверием. Поскольку война с турками еще не закончилась, командование шло навстречу сербам. Насколько это было необходимо, показали сражения под Сланкаменом в 1691 г. и Сентой в 1697 г.

Сербские «привилегии», о которых говорилось все больше, в сущности, подразумевали гарантии естественного права человека на беспрепятственное исповедание своей религии. Обещанные свободы и права распространялись не на ограниченную территорию, а были связаны с принадлежностью к вере и национальности. Персональность права, которая широко применялась в Средние века, было нелегко согласовать с претензиями современного государства на единое законодательство внутри своих границ.

Поскольку «привилегии» давались в разных условиях — до заключения мира в 1699 г. и позднее, в период подчинения Империи Габсбургов части Сербии (1718–1739), — они касались различных групп населения. «Привилегии» изначально представляли собой предмет споров, поначалу политических — в отношениях между венгерскими сословными органами и императором, венским двором и сербскими митрополитом и собором, а впоследствии и историографических.

Значительная часть сербского народа была навсегда освобождена от османской власти в результате подписания Карловацкого мирного договора 1699 г., который положил конец Венской войне, длившейся пятнадцать лет. Участники Великого переселения 1690 г. присоединились к потомкам тех, кто прибыл на Паннонскую равнину за 150–200 лет до него. Оказавшись на землях, с которых был изгнан османский правящий слой, и ощутив на себе первые позитивные перемены, те и другие возлагали значительно большие надежды на будущее, которое оставалось во многом неясным.

Прежде всего не было согласия относительно статуса и внутреннего устройства освобожденных территорий. Отчетливо проявлялось стремление сохранившихся венгерских сословных институтов, чья юрисдикция к 1687 г. распространялась на незначительную часть существовавшего некогда государства, к восстановлению королевства во всех его аспектах — административном, институциональном, правовом. И в первую очередь речь шла о правах знати, которой необходимо было вернуть утраченные земельные владения. В качестве первого шага в этом направлении следовало воссоздать жупании с их дворянской автономией — то есть сословными собраниями и судами, — а также сами дворянские имения. Однако планы реставрации наталкивались на многочисленные препятствия. Во-первых, изменились общие условия, и сил для реализации всех этих мер не хватало, а во-вторых, совсем в ином направлении действовал венский двор, поскольку его абсолютистская политика имела целью превращение неоднородной и разрозненной монархии в единое государство. Поэтому в Вене и стремились к принятию таких решений, которые одновременно могли бы обеспечить достаточные для завершения борьбы с турками силы, гарантировать приоритет центральной власти и делали бы возможным бесперебойный приток средств из новоприсоединенных областей, включая людские ресурсы, для охраны границ и ведения будущих войн. С разной степенью интенсивности, открыто или подспудно, противостояние этих двух тенденций растянется на десятилетия и, соответственно, будет на протяжении продолжительного времени оказывать влияние на положение сербов.