Родившийся 23 февраля, в день Советской армии, Святейший заканчивал свой год семидесятипятилетия среди военных. 17 декабря он посетил военный гарнизон Главного штаба Ракетных войск стратегического назначения в подмосковной Власихе, совершил молебен в гарнизонном храме Ильи Муромца, наградил орденами Русской Православной Церкви ряд генералов и офицеров. А 21 декабря Предстоятель побывал в штабе дальней авиации и тоже вручал награды.

Он хотел объединить всех честных и настоящих людей под покровом Святой Церкви. Предвидя скорое воссоединение с зарубежниками, несомненно мечтал и о грядущем когда-нибудь объединении всех Церквей Христовых! В конце декабря Святейший Патриарх ответил на вопросы болгарского еженедельника «Политика» и, в частности, говорил об этом:

— Разделение христианского мира всегда воспринималось Православной Церковью как болезненное явление, противоречащее самой сути учения Господа Иисуса Христа. Восстановление богозаповеданного христианского единства всегда было нашей важнейшей целью. Но достичь этой цели не так просто. С точки зрения православного вероучения, не может быть «равенства конфессий». На протяжении столетий многие христианские сообщества в той или иной мере отказывались от исповедания веры Единой Святой Соборной и Апостольской Церкви. И создавали свои общины и вероучения, не соответствующие апостольскому Христианству. Так что нужно говорить не о разнице в догматах отдельных деноминаций, а об отступлении от истины, допущенном некоторыми сообществами. Считаю, что провозгласить единство христиан без возвращения отпавших к вере святых апостолов и Древней Церкви невозможно... Речь идёт не о разнице во второстепенных «частностях», как нам иногда говорят, а об отступлении от исповедания веры Единой Святой Соборной и Апостольской Церкви, которое выражается и в вероучении различных деноминаций, и в их литургической практике, и даже во взглядах на христианскую нравственность, что наблюдается в последние десятилетия. Особенно это касается рукоположения открытых гомосексуалистов и благословения однополых браков. Полагаю, что отпавшие от Церкви не могут быть воссоединены с Единой Святой Соборной и Апостольской Церковью в том состоянии, в каком они сейчас находятся. Убеждён, что единственным путём к объединению является путь покаяния и обновления, который, как мы надеемся и о чём мы молимся, могут избрать неправославные христиане.

Одно из последних богослужений, которое Святейший провёл в 2004 году, состоялось в стенах московского Сретенского монастыря, руководимого замечательным подвижником архимандритом Тихоном (Шевкуновым).

— Это место находится под особым Покровом Богородицы, ибо более шестисот лет назад Владимирская икона Царицы Е1ебесной была встречена здесь как покровительница, как избавительница от нашествия иноплеменных, — говорил Предстоятель. — И ныне с благословения Божия, предстательством Пречистой Богородицы, молитвами священномученика Илариона — исповедника XX века, стойкого хранителя веры Христовой, — мы свидетельствуем о том, что здесь возрождается монашеская жизнь, что многие богомольцы получают в Сретенской обители указание пути ко спасению. Да благословит Господь и грядущие годы обители! Под руководством отца наместника братия обители да будет и впредь ревностно совершать свой монашеский подвиг, а православные верующие, которые приходят в Сретенский монастырь, — получать духовные силы для несения своего жизненного креста.

Конец 2004 года ознаменовался в мире страшнейшей катастрофой. Чудовищное землетрясение в Индийском океане стало причиной невиданного цунами, прокатившегося по странам Юго-Восточной Азии. Около четверти миллиона человек лишилось жизни, миллионы остались без крова. И начало 2005 года Святейший Патриарх Московский и всея Руси посвятил организации сбора средств для отправки несчастным. В своём обращении от 3 января он искренне горевал о случившемся, но не преминул напомнить человечеству, что во всём необходимо искать духовные причины. Отпадение от веры в Бога стало всемирным явлением.

— Эту трагедию особенно трудно пережить без духовного осмысления её: масштаб жертв повергает людей в ужас и вызывает острое чувство беззащитности. Вместе с тем современный человек склонен возлагать своё упование на технические достижения цивилизации, часто забывая о Боге и своей человеческой немощи перед натиском грозной стихии.

В течение месяца будет собрано более двух миллионов рублей.

6 января Святейший посетил в Кремле президента Путина, поблагодарил его за то, что впервые в нашей стране были объявлены десятидневные новогодне-рождественские каникулы. Праздничное богослужение Патриарх совершил в храме Христа Спасителя. В телеобращении 7 января он упомянул две трагедии 2004 года — Беслан и цунами, призвал помнить, что испытания посылаются нам, дабы «мы твёрдо стояли в правде Божией и следовали закону евангельской любви». В этих призывах он уподоблялся святителю Филарету, который всякий раз использовал случающиеся несчастья для проповеди стояния в вере.

9 января на детской Рождественской ёлке в Государственном Кремлёвском дворце Святейший вручал подарки. Ученики воскресной школы Покровского храма в Братцеве преподнесли ему написанные ими иконы, и он подарил одну из них детям Беслана. А те, в свою очередь, подарили ему щенка пуделя необычного персикового окраса.

То, что между Предстоятелем и президентом оставались добрые отношения, не мешало Святейшему критиковать власть за её неумные и неумелые действия. Введение новой системы социальных льгот вызвало новый всплеск обнищания, особенно среди социально обездоленных людей. По всей стране прокатились акции протеста, и Патриарх поддержал их в своём заявлении от 13 января. Он призвал власть действовать по золотому правилу евангельской нравственности: «Как хотите, чтобы с вами поступали люди, так поступайте и вы с ними» (Мф. 7, 12).

В Крещенский сочельник Патриарх совершил в храме Христа Спасителя чин Великого освящения воды. Ему сослужил Истринский архиепископ Арсений, человек, с каждым годом завоёвывавший всё большее доверие Алексия II. С ним ему особенно нравилось совершать богослужения, беседовать, видеть вблизи себя, давать особые поручения. Арсения он видел одним из своих будущих преемников на Патриаршем престоле. Поздравляя его в 2005 году с пятидесятилетним юбилеем, Святейший нашёл особо задушевные слова: «Ты начал помогать мне, будучи ещё студентом Московской духовной семинарии, продолжил в должности личного секретаря, затем — викария Санкт-Петербургской епархии, а после избрания нас на Московский Патриарший престол — в качестве нашего московского викария... 50-летний — золотой юбилей жизни — самый отрадный, ибо накоплен опыт жизни, и если Господь будет милостив, есть время этот духовный и жизненный опыт посвятить на служение Святой Церкви».

Одним из благих деяний Святейшего стало налаживание добрых отношений с Эстонией, которые на протяжении многих лет оставались крайне напряжёнными из-за вспыхнувшего эстонского национализма. На Крещение 2005 года по приглашению Патриарха Алексия II в Москву приехал президент Эстонии Арнольд Рюйтель, и в Патриарших палатах Кремля произошла трёхсторонняя встреча Предстоятеля Русской Церкви и двух президентов — российского и эстонского. Рюйтель стал лауреатом премии «За выдающуюся деятельность по укреплению единства православных народов», тем самым была отмечена его работа по улучшению положения Эстонской Православной Церкви Московского Патриархата. 21 января после встречи с Рюйтелем в резиденции Свято-Данилова монастыря Святейший дал телевизионное интервью на эстонском языке, показав, что нисколько не забыл его. Он, кстати, напомнил, что в эстонских СМИ многие годы Русскую Церковь именовали оккупационной.

— Ну какой же я оккупант, если родился в Эстонии и в этой стране прожил немалую часть своей жизни?