Австрийский главнокомандующий, так и не разобравшийся в ситуации, утром 22 апреля тоже решил перейти в наступление. Он рассчитывал и на поддержку группы Гиллера, судьба которой ему была неизвестна. Удерживая левый фланг на месте, Карл отдал приказ о переходе в наступление корпусов Коловрата, Лихтенштейна и Гогенцоллерна, пытаясь нанести удар французскому левому флангу. Успех был возможен, если бы намеченные передвижения действительно были начаты с утра. Однако необходимость предоставить хоть какой-то отдых только что возвратившемуся от Гемау корпусу Коловрата заставила австрийского главнокомандующего начать наступление только после полудня. Он опять проигрывал в темпе...

Бой завязался перестрелкой на участке корпуса Гогенцоллерна, а в 13 часов у Экмюля показались войска Наполеона, что послужило сигналом для перехода в наступление Лефевра и Даву. После непродолжительной артиллерийской подготовки они начали атаку на фронте Ро-зенберга, развернувшего свои войска между Сандингом и Унтер-Лейхлингом. Боевой порядок Розенберга составляли две линии батальонов, между которыми на высоте Гохберг была поставлена 60-орудийная батарея. Гористый район расположения двух левофланговых австрийских корпусов способствовал обороне. Перелески, покрывавшие высоты, повышающиеся по мере протяжения их к северу, давали возможность скрытого передвижения войск. Заняв командные высоты, австрийцы имели большие преимущества в использовании своей артиллерии. Левый их фланг упирался в болотистую долину реки Гросс-Лабер.

Выйдя на высоту Шенгофен и разобравшись в обстановке, Наполеон решил охватить левый фланг австрийцев, упорно отражавших атаки Даву и Лефевра.

Дивизия Вандама была направлена для атаки Экмюля, а дивизия Гюденя должна была перейти реку Гросс-Лабер у Рокинга. Для захвата Экмюльской рощи, откуда противник своим огнем задерживал продвижение Ванда-ма, была направлена дивизия Морана.

Мощная батарея австрийцев подавляла французскую артиллерию со стороны Гохберга, задерживая продвижение охватывающих дивизий Наполеона. И только тогда 10-тысячная французская конница, бесплодно топтавшаяся в болотистой долине реки у Ширлинга, была направлена императором для атаки батареи противника и рассеяла се, Розенберг, охваченный французами, начал отходить после упорной трехчасовой обороны, одновременно войска Даву приблизились к Регенсбургскому шоссе. Хотя конница Гогенцоллерна оказала Розенбергу поддержку со стороны Сандинга, он тем не менее не мог удержаться и продолжал отступать, преследуемый пехотой Даву.

Наконец последовал приказ эрцгерцога о переходе к обороне, причем оборонительная позиция намечалась к югу от реки Пфаттер. Однако энергичное преследование Наполеона заставило австрийцев отойти за линию Прюль—Ислинг—Бургвейтинг. Попытка австрийской конницы лихой атакой задержать французов у Эглофсгейма оказалась для нее роковой: прижатый превосходящими силами к берегам реки Пфаттер 2-тысячный кавалерийский отряд австрийцев был отчасти перебит, отчасти взят в плен.

К вечеру главные силы Наполеона достигли реки Пфаттер. Наступление темноты и запоздание Массена к полю сражения заставили Наполеона прекратить преследование и, в результате, австрийская армия, прижатая к излучине Дуная, избежала катастрофы. Между прочим в течение всего дня стратег Карл так и не сумел использовать войска Коловрата и Лихтенштейна для удара в тыл Даву, и на протяжении сражения эти два корпуса бездействовали.

Потеряв свои сообщения с рекой Инн и лишившись значительной части обоза, что привело к почти полному истощению запасов продовольствия и боеприпасов, эрцгерцог решил отойти в Богемию, присоединив к себе 1-й корпус Бельгарда. В ночь на 23 апреля началось отступление на левый берег Дуная. Отход не был закончен, когда, завершая маневр, к Регенсбургу вышел корпус Ланна. И здесь австрийский арьергард встал насмерть. Наполеон, руководивший штурмом города, в разгар боя был ранен в ногу. Императору сделали наскоро перевязку, и он сейчас же велел посадить себя на лошадь и строго воспретил говорить о своей ране, чтобы не смутить солдат. Регенсбург был взят, но главные силы австрийцев в полном порядке успели переправиться через Дунай, затем арьергард уничтожил за собой мост.

В дальнейшем оба противника двинулись по направлению к Вене: Наполеон по правому берегу, Карл — по левому.

В пятидневной Регенсбургской операции Наполеон остался победителем, проложив себе путь к Вене. Однако решающего успеха эта операция ему не принесла, второго Ульма не получилось. Австрийская армия понесла большие потери — около 45 000 человек и 100 орудий, тогда как французы — только 16 000. Тем не менее группировки Карла и Гиллера избежали полного разгрома. Основная масса австрийской армии сохранилась и вскоре вновь вступила в борьбу.

Конечно, «нанести неприятельской армии потери в размере одной трети ее состава и расколоть ее на две части — это являлось бы для всякого другого генерала завидным результатом. Но для Наполеона, который имел полную возможность уничтожить эту армию... такой результат был недостаточен. Видя, что его планы наталкиваются на препятствия, получая ложные донесения, Наполеон был вынужден каждый день принимать новые решения. Эрцгерцог поступал таким же образом. В этом соперничестве Наполеон, в конце концов, одержал верх. Это было неудивительно. За ним было значительное численное превосходство. Его войска имели совершенно исключительную подвижность и превосходили все другие в бою. Маршалы вкладывали все свои силы в выполнение приказаний императора, а у австрийских корпусных командиров недоставало подготовки и дисциплины для осуществления решительного наступления. И, что важнее всего, Наполеон быстро принимал решения, безразлично, удачные или нет, и приводил их в исполнение с быстротой, решительностью и силой. Эрцгерцог же выжидал выяснения обстановки, медлил и события предупреждали его. И лишь в значительной степени благодаря ошибкам Наполеона, который не только слишком поздно запер выход у Ландсхута, но и открыл новый у Регенсбурга, эрцгерцогу удалось спастись от гибели, хотя и со значительными потерями» (Шлиффен. Канны. М., 1938. С. 51).

13 мая 1809 года Наполеон вступил в Вену. Казалось, кампания шла к быстрому завершению. Однако заняв столицу, император не достиг мира. Все еще сильная армия эрцгерцога Карла, с присоединившейся к нему группой Гиллера, к 16 мая сосредоточилась напротив Вены. У Карла теперь было 105 000 солдат при 288 орудиях. Главные его силы располагались на левом берегу Дуная — Бизамбергских высотах с наблюдательными постами, разбросанными вдоль течения реки от Кремса до Пресбурга.

Карл не торопился с началом наступательных действий. Необходимо было организовать войска после неудачных сражений. Корпус Кинмайера влился в 1-й резервный корпус. Кавалерия была объединена под командованием Лихтенштейна. Батальоны пополнились за счет ландвера до полного состава. Проводились усиленные занятия в духе нового устава. Новым, непохожим на прежние войны было и боевое настроение, и воля к борьбе австрийской армии. Все сильнее проступало стремление австрийцев сохранить и отстоять свою национальную и государственную самостоятельность. Народы Австрийской империи не хотели жить под пятой завоевателя. Наполеону пришлось в этом убедиться вскоре после падения Вены. Хотя бургомистр и преподнес ему ключи от города, но это не было воспринято австрийцами как конец войны, никто не спешил с предложениями мира. Напротив, неудачи еще более ожесточили народ и армию, сознание опасности умножило их силы. Наполеон недооценивал совершившиеся изменения, он судил об австрийской армии по старинке. Но он не мог ждать, войну необходимо было заканчивать и побыстрее.