Русские форсированным маршем двинулись по левому берегу реки к Брюнну через Вену, наперерез им бросились войска Мюрата. Когда авангардные части французов настигли русскую армию, то Мюрат, дабы задержать Кутузова до подхода главных сил, решил обмануть русского полководца, как он удачно обманул французов. Мюрат предложил Кутузову заключить перемирие, русский генерал решил использовать время, для того чтобы вывести свои силы из-под удара, и согласился. Во французский лагерь были посланы представители, которые подписали акт о перемирии. Оставалось только ратифицировать его обоим полководцам. В этот момент Кутузов, прикрываясь заслоном в 6000 человек под командованием Багратиона, форсировал отход армии. Наполеон, узнав о действиях своего незадачливого дипломата, пришел в ярость и приказал Мюрату немедленно атаковать Кутузова, но было уже поздно. Армия русских ушла, а прикрывавший ее отход отряд Багратиона провел блестящий бой под Шенграбеном с многократно превосходящими силами противника и, выполнив свою задачу, присоединился к главным силам у Погорлицы. Действия Багратиона позволили русским оторваться от неприятеля на два перехода. 10 ноября в районе Ольмюца войска Кутузова соединились с корпусом Буксгевдена, а затем пополнились за счет прибывшей гвардии и 15-тысячного австрийского отряда.

Таким образом, умело спланированный и блестяще организованный 400-километровый маневр Кутузова позволил ему сохранить свои войска и создал выгодные условия для действия союзников.

Теперь у Кутузова было 86 000 солдат. Кроме того, ожидался подход русского корпуса генерала Эссена 1-го числа, а к середине декабря могла быть подтянута 40-тысячная армия Беннигсена и 150-тысячная австрийская армия эрцгерцога Карла и Иоанна из Италии. Войска союзников располагались на сильной позиции у города Ольшаны, обстановка начинала изменяться в благоприятную для них сторону. Пруссия была близка к решению вступить в коалицию. Поэтому прибывший в штаб армии император Александр I, также как и австрийский император Франц, отнюдь не считал дело проигранным. Напротив, частые победы, которые были одержаны союзниками, например успех русских при Шенграбене, подняли настроение в штабе союзных войск.

Важное значение для хода всей кампании имели события, развернувшиеся далеко от театра военных действий в Европе. 21 октября 1805 года у мыса Трафальгар английский флот под командованием Нельсона в ожесточенном морском сражении уничтожил объединенный франко-испанский флот. Нельсон погиб в этой битве, но одержанная им победа имела огромное значение для всей последующей, растянувшейся на многие годы войны. В морской пучине под Трафальгаром были не просто похоронены французские корабли, была уничтожена французская идея вторжения в Англию. Отныне и на ближайшие годы Англия стала неуязвима для Франции; пролив, отделявший Британские острова от континента, стал непреодолим.

Сражение было расценено как крупнейшее событие военной кампании; победа Нельсона заслонила поражение Макка, Трафальгар затмил Ульм. По мнению европейских газет тех дней, после Трафальгара военное счастье перешло к союзникам.

Наполеон отчетливо понимал, что поражение французского флота уронило в глазах всего мира императорское знамя с орлами. Все достигнутые преимущества — Ульм, вступление в Вену — были уничтожены в один день. Ему снова нужна была победа, не обыкновенная, не рядовая, а оглушительная победа, которая заставила бы признать его военную мощь, его превосходство над силами неприятеля. Его замысел заключался в том, чтобы заманить в западню русско-австрийскую армию и навязать ей генеральное сражение до того, как подойдут дополнительные силы австрийцев и русских. Кутузов своим тонким чутьем разгадал замысел Наполеона.

Русский генерал предложил царю продолжить отход к Карпатам для соединения с Беннингсеном и Эссеном. Кроме того, это привело бы к еще большему растягиванию французских коммуникаций, к еще большему обессиливанию Наполеона, тем более, что он не имел возможности в ближайшее время получить подкрепление. Однако Кутузов уже ничего не решал в главной квартире, присутствие Александра I лишало генерала реальной власти главнокомандующего. В это время в императорской штаб-квартире преобладали придворные генералы, толкавшие царя на «решительные действия». Они сравнивали Александра с Петром I и прочили ему триумф победителя. Генерал-квартирмейстер австрийской армии Вейротер также был сторонником «решительных действий», хотя отличался полным непониманием стратегии и тактики французской армии.

Вынужденный разбросать свои войска с целью обеспечения тыла и оккупации захваченных территорий, Наполеон к 20 ноября остановился в районе крепости Брюнн в 70 милях от Вены. У него было только 53 000 человек. Ближайшие силы, корпуса Даву и Бернадота, находились в 2—3 переходах от Брюнна; после соединения с ними Наполеон мог иметь 75 000 солдат. Отдав приказ Даву и Бернадоту идти к нему, французский полководец повел дипломатическую игру, всеми силами демонстрируя нерешительность перед лицом союзников.

Обстановка для него и вправду начала складываться неблагоприятно. Армия французов, утомленная тяжелыми переходами, находилась далеко от Франции, во враждебной стране. К тому же Наполеон знал, что к нему в ставку едет граф Гаугвиц с ультиматумом от Пруссии, требования которой были заранее неприемлемы для императора. Пруссия могла в любой момент вступить в войну и выдвинуть у Наполеона в тылу 180-тысячную армию. Поэтому для него было крайне важно, чтобы союзники не начали вновь отступать и не затянули бы войну. Он желал сражения и делал все, чтобы оно состоялось, но свои намерения мастерски маскировал.

Заняв оборонительное положение к востоку от Брюнна, Наполеон послал к находившимся в Ольмюце русскому и австрийскому монархам своего представителя с предложением начать мирные переговоры. Александр отказался от прямых переговоров, но направил в штаб Наполеона своего генерал-адъютанта князя П.П. Долгорукова. Наполеон принял князя и беседовал с ним намеренно осмотрительно, скромно, миролюбиво. Превосходный актер, он играл роль человека, озабоченного возрастающими трудностями и ищущего путь к миру. Он был сдержан с князем и делал вид, что не замечает его развязности. Позже Наполеон отмечал: «Этот молодой хвастунишка разговаривал со мной как с русским боярином, ссылаемым в Сибирь». Наполеон снес этот высокомерный тон и эту заносчивость.

Разговор закончился ничем, но Долгоруков, вернувшись в ставку, доложил царю, что больше всего Наполеон боится сражения, он ищет мира и не рассчитывает на свои войска. Раз Наполеон боится — надо его атаковать. Александр, усмотрев в мирных предложениях французского императора признак его слабости, и под влиянием окружавших его советников стал настаивать на немедленном наступлении.

Вопреки желанию Кутузова, который был фактически отстранен от руководства войсками, на военном совете был принят уже заранее одобренный Александром и Францем план действий, составленный Вейротером. Последний исходил из нелепого предположения, что Наполеон будет пассивен, займет оборону, предоставит полную инициативу союзникам и, таким образом, беспрепятственно даст себя разбить. В который раз знатоки кордонной стратегии собирались наступать на те же самые грабли. План Вейротера состоял в том, чтобы фланговым маршем отрезать Наполеона от Вены, где по предположению союзного штаба проходила главная коммуникация французов, разбить его у Брюнна и отбросить к Богемским горам.

Всем единомышленникам Александра в главной квартире казалось, что дела идут блестяще. Один из свидетелей событий писал: «Слабая рекогносцировка, произведенная Мюратом и прекращенная после первых выстрелов, усиление авангардов и построение укреплений по дорогам, ведущим к Брюнну, наконец, предложение Наполеона вступить в личные переговоры с императором Александром, для чего он, противу своего обыкновения, сам выезжал на аванпост, навстречу русскому парламентеру, — все это уверяло союзников, что горделивый покоритель Ульма и Вены находится на краю гибели, что занимает их только пустою демонстрацией для прикрытия своего отступления и что им надлежало скорее воспользоваться его отчаянным положением для нанесения ему решительного удара».