Мирмекий располагался на северном берегу современной Керченской бухты, как пишет Страбон (VII, 4, 5), в 20 стадиях от Пантикапея и отождествляется с развалинами древнего города, обнаруженного на скалистом мысу в 4 км от Пантикапея (Дюбрюкс П., 1858, с. 15; Бларамберг И.П., 1848, с. 13). Данные Страбона подкрепляются указаниями Клавдия Птолемея (III, IV, 3), упоминающего мыс Мирмекий, и Псевдо-Арриана (76, 50). Наиболее раннее упоминание о Мирмекии имеется в перипле Псевдо-Скилака (§ 68). Его упоминают также Помпоний Мела (II, 3), Плиний (IV, 87) и Стефан Византийский (SC, I, с. 263). Существует мнение, что своим наименованием город обязан древнегреческому слову муравей или риф (Гайдукевич В.Ф., 1949а, с. 166), но, согласно С.А. Жебелеву, название города могло восходить и к личному имени ойкиста (Жебелев С.А., 1953, с. 306, 307).

Город занимал площадь около 6 га и был вытянут вдоль берега. Его западная часть представляет собой возвышенность, заканчивающуюся скалой с площадкой в верхней части, к которой ведут вытесанные в камне ступени. Здесь в 1834 г. были обнаружены два склепа с общим дромосом, из которых были извлечены два мраморных саркофага — один из них украшен скульптурой. Захоронения в черте города дали основание предположить, что эти склепы принадлежали представителям царского дома Боспора (Максимова М.И. и Наливкина М.А., 1955, с. 306 сл., рис. 19). В 1820 г. П. Дюбрюкс совместно с И.А. Стемпковским сняли план городища. В первой четверти XIX в. план Мирмекия был снят И. Бларамбергом. Проводили здесь исследования также А.Е. Люценко и П.И. Гросс (Гайдукевич В.Ф., 1941а, с. 98–103). С 1934 по 1938 г. и с 1946 по 1966 г. (с перерывами) систематические и планомерные археологические исследования Мирмекия проводил В.Ф. Гайдукевич (Гайдукевич В.Ф., 1941а; 1952а; 1958б; 1959а; 1963б; 1965).

Обломки позднеархаической керамики и, в том числе, родосско-ионийских сосудов второй четверти-середины VI в. до н. э. в юго-западной части городища указывают на время основания города и его первоначальное местонахождение. Напластования и остатки стен жилых домов конца VI — начала V в. до н. э. были выявлены в центральной части городища (Гайдукевич В.Ф., 1959а, с. 27). Открыты две стены постройки конца VI в. до н. э., сложенные из небольших плоских камней желтоватого известняка и пристроенная к ней впритык стена, сооруженная в начале V в. до н. э., а также позднеархаическая яма глубиной 1,35 м, стенки которой выложены мелкими плоскими плитками. В яме найден обломок чернофигурного сосуда 530-х гг. до н. э. (Гайдукевич В.Ф., 1959а, с. 29–55).

В V в. до н. э. Мирмекий достиг наибольших размеров. Однако оборонительными стенами город был обнесен не ранее начала IV в. до н. э. Трасса оборонительной стены проходила от юго-западной части побережья, огибая город с севера, и выходила к морю в юго-восточной части города (табл. XXX). Возможно, что открытая Ф.И. Гроссом в 1885 г. стена террасы выполняла одновременно и функции южной оборонительной стены. Открыт отрезок северной стены шириной 2,20-2,50 м с башней. Стена двухпанцирная с бутом посредине, сложена на глине из крупных блоков известняка, отесанных с лицевой стороны. Башня по фасаду имеет длину 6,20 м, ширину 6 м (Гайдукевич В.Ф., 1952а, с. 139–145). Вдоль восточной границы города выявлены два строительных периода существования оборонительной стены. Ранняя стена (шириной 2,40 м) просуществовала IV — первую половину III в. до н. э. В середине III в. до н. э. на ее месте возвели другую, более мощную стену шириной 3,8 м (Пругло В.И., 1900, рис. 1, 3). В ряде мест (вдоль северной и восточной стен, в центральной части города) открыты остатки улиц, имевших ширину от 2,70 до 4,2 м и переулка (ширина 1,5 м). (Гайдукевич В.Ф., 1941а, с. 123 сл.; 1952а, с. 138 сл.; Пругло В.И., 1960). По материалам эллинистических слоев, наиболее целостно раскрытых на участке «И», можно прийти к выводу, что застройка города в это время велась хаотично. Наряду с рядовыми жилыми домами в городе были общественные здания и частные жилые дома с богатым архитектурным декором, о чем свидетельствуют находки фрагмента каннелированного барабана, рельефной маски силена, плиты с триглифами от антаблемента эллинистического дома, барабана дорической колонны, фрагментированной дорийской капители, а также две плиты с триглифным фризом и архитравом, вытесненные каждая из одного известнякового блока, и плита карниза с остатком розеток и с мутулами, являвшимися частями антаблемента дорийского здания с портиком высотой около 4 м конца IV — начала III вв. до н. э. (Гайдукевич В.Ф., 1941а, с. 108; 1952а; с. 151–154, рис. 31–33).

Одним из типичных домов Мирмекия I–II вв. является «дом винодела» на участке «Б», где жилой комплекс составляет единое целое с производственным зданием — винодельней. Дом состоит из трех помещений, расположенных в его северной части и большого мощеного двора со служебным помещением в его юго-восточной части (Гайдукевич В.Ф., 1952а, с. 137, 159, 163–166). С запада к жилому комплексу примыкает здание винодельни, состоящее из двух больших помещений — кладовой и помещения с давильными площадками и резервуарами. На одной из давильных площадок была каменная прямоугольная плита для отжима виноградного сока из мезги (Гайдукевич В.Ф., 1941а, с. 116, 117; 1958а, с. 416). Другой винодельческий комплекс открыт в центральной части городища. Семь помещений группируются вокруг большого мощеного двора. С северо-запада ко двору дома пристроено помещение винодельни, состоящей из одной давильной площадки и резервуара. К этому большому дому с востока примыкает другой, состоящий из трех помещений и Г-образного в плане двора. (Гайдукевич В.Ф., 1958в, с. 198, 199). Неподалеку от этого дома, к востоку открыт большой жилой и хозяйственный комплекс, состоящий из нескольких помещений, из которых раскопками раскрыто четыре. Одно из помещений занято винодельней II–I вв. до н. э.

На рубеже II–I вв. до н. э. в центральном районе Мирмекия отмечаются следы массового разрушения жилых построек. На рубеже нашей эры эти руины были разобраны, а вся территория подверглась засыпке и нивелировке, в результате которой над развалинами эллинистических домов образовалась насыпь мощностью до 2,50 м (Гайдукевич В.Ф., 1959а, с. 55, 71). В южной части раскопа было раскрыто 14 помещений первых веков нашей эры, примыкающих к одной стене, вытянутой вдоль улицы. Они являются остатками жилых комплексов, части которых, расположенные южнее, не раскапывались (табл. XXX).

Мирмекий был крупным центром боспорского виноделия. На городище открыто 10 винодельческих хозяйств. Наиболее ранняя мирмекийская винодельня (№ 5) начала III в. до н. э. состоит из одной давильной площадки и одной вместительной цистерны емкостью около 1800 л (Гайдукевич В.Ф., 1958а, с. 451, 452). Винодельня (M1), открытая в доме винодела, функционировала с конца III в. до н. э. до середины I в. до н. э. и была разрушена вместе с домом. Затем была перестроена и эксплуатировалась в I–II вв. н. э. Две эллинистические винодельни были открыты в восточной части городища, возле оборонительной стены. Одна из них (М6) III в. до н. э. состояла из двух давильных площадок и трех цистерн, общей емкостью 7830 л. Во II в. до н. э. винодельня подверглась ремонту, а в I в. до н. э. была засыпана. От другой винодельни (М7), II–I вв. до н. э., сохранились фрагменты давильной площадки и двух цистерн (Гайдукевич В.Ф., 1958а, с. 452, 457; Пругло В.И., 1960, рис. 4, 5). Ко II–I вв. до н. э. относится винодельня (М4) производственный комплекс которой находился в большом здании, состоявшем из двух помещений. В одном из них были сооружены три давильные площадки (средняя с круглым тарапаном диаметром 1,46 м) и две цистерны, вмещавшие 3900 л (Гайдукевич В.Ф., 1958а, с. 453–457). К первым векам нашей эры относятся две расположенные рядом одинаковые по площади винодельни М2 и М3 (Гайдукевич В.Ф., 1958а, с. 409, рис. 54). Они включали по три смежных давильных площадки и по три цистерны. Там же найден железный нож для срезания виноградных гроздьев (Гайдукевич В.Ф., 1952а, с. 185, рис. 91; 123, 7).