Аудитор Счётной палаты Михаил Бесхмельницын заявил, что скандал мог быть поднят по заказу участников передела рынка в Юго-Восточной Азии. Он отметил, что озвученная в марте 2010 года Степашиным в отчёте о работе Счётной палаты за год сумма ущерба составила 3,5 млрд рублей. Навальный утверждал, что по этому факту не было возбуждено никаких уголовных дел, что противоречит заявлению Степашина от 24 марта 2010 года, что уголовное дело было возбуждено.

Владимир Милов оспорил гриф «для служебного пользования», напомнив, что строительство ВСТО велось на кредиты государственных банков и что большинство акций компании — государственные, а значит общество имеет право на ознакомление с данными документами.

14 февраля 2011 года арбитражный суд Москвы обязал «Транснефть» выдать запрашиваемые акционерами документы (протоколы совета директоров), что, по заявлению Алексея Навального, является большой победой и даёт возможность «почитать, что они там скрывают». 21 апреля 2011 года девятый арбитражный апелляционный суд оставил в силе это решение.

В некотором смысле, именно история борьбы с коррупцией в «Транснефти» получила самое интересное продолжение. Через неделю после сообщения Навального о хищениях в Транснефти к некоторым клиентам Алексея и тем, с кем он когда-то имел денежные отношения, стали приходить представители органов без какой-либо конкретной цели[40]. Данные действия имели своей целью возобновление дела годовой давности против Алексея Навального (которое в дальнейшем переросло в «дело Кировлеса»), 3 декабря 2010 года оно было передано из Главного управления МВД по Приволжскому федеральному округу в местное управление СКП. По версии следствия, будучи советником губернатора Кировской области, Навальный «путем обмана и злоупотребления доверием» принудил эксдиректора КОГУП «Кировлес» (учредитель — департамент лесного хозяйства Кировской обл.) Вячеслава Опалева заключить невыгодный договор на поставку древесины, который принес предприятию убыток в 1,3 млн руб.

Но об этом подробнее в другой главе. А пока стоит отметить, что заказные статьи на эту тему в государственных СМИ были размещены в аккурат к общему собранию акционеров ВТБ, в разгар расследования Алексея по «делу о буровых установках».

Первое место в личном хит-параде ненависти Навального занимает компания «Транснефть» — «самые адские циничные наглые жулики и воры». «Это в чистом виде ОПГ, 100 % акций которой принадлежит государству», — говорит он. Второе — банк ВТБ, «кормушка для жуликов без серьезного банковского бизнеса под прикрытием государства». Третье — «Газпром».

Среди побед Алексея — возбуждение в 2009 году уголовного дела против менеджеров «Межрегионгаза» по факту нанесения ущерба компании при продаже газа посредникам и открылись детали убыточной покупки буровых установок «ВТБ-лизинг», в результате чего в отставку был вынужден уйти директор банка. Наделало шуму решение Арбитражного суда, по которому «Роснефть», 0,00000326 % акций которой (около $2 тыс. на момент покупки) владеет Навальный, обязана предоставить ему протоколы заседаний совета директоров.

Победы были редки и случайны, поражений было больше. Сам Навальный отмечал бесперспективность инвест-активизма, связанный с отсутствием независимости правоохранительной системы. Но он не опускал руки и упорно продолжал задавать на собраниях акционеров неудобные вопросы руководству компаний.

«С первых исков я понял, что там коррупция, корни которой на самом верху, непробиваемая стена, а непробиваемая стена — это вызов. Ее интересно пробить, а если не получится пробить, то я считаю полезным по ней хотя бы постучать. До сих пор стучу. Теперь я вижу, что она трухлявая, просто нужно побольше человек собрать — чтобы стучали», — рассказывает он.

Почему ему неймется, думали многие? Семья, своя юридическая фирма, имя и карьера, и вдруг — «потыкать острой палкой» в большой и близкий государству бизнес?

«Имя и карьера во многом выросли из того, что я начал долбить в стену», — отвечает он.

В декабре 2009 года Навальный вместе с российской версией журнала «Forbes» организовал проект по защите прав миноритарных акционеров — Центр защиты акционеров. Благодаря этой деятельности, в том же месяце газета "Ведомости" назвала Навального «частным лицом года». Тогда же он был признан «человеком года» биржевым обозрением «Stock In Focus».

После того как в 2011 году недоброжелатели Навального взломали его почту и опубликовали якобы принадлежащую ему переписку, встал вопрос, насколько бескорыстной была борьба Навального против жуликов и воров. Из его переписки с политологом Станиславом Белковским следует, что в январе 2010 г. Белковский за $50 000 заказал Навальному кампанию против UC Rusal Олега Дерипаски — компания как раз проводила IPO на Гонконгской бирже. Навальный в течение нескольких дней опубликовал на актуальную тему (почему не надо покупать акции UC Rusal) несколько постов у себя в Живом журнале, статью в «Ведомостях» и на Slon.ru.

Однако и Навальный, и Белковский опровергли эту информацию, заявив, что именно эта часть их переписки — фальшивка. Но на вопрос, получал ли Навальный деньги от Белковского, неожиданно дают утвердительный ответ: получал. Но не за кампанию против Дерипаски, а на создание движения «Народ».

«В период с 2006 по 2008 год я лично помогал Навальному деньгами, — вспоминает Белковский. — Я находился в поиске людей, которые могли бы прийти на смену путинскому поколению политиков. Поэтому я помогал без всякой прагматической причины. Я помогал многим. Дать немного денег для национал-демократического проекта и движения «Народ» — вот и вся помощь».

«Белковского считают много чьим агентом, но мне он давал деньги только на «Народ», — настаивает Навальный.

В декабре 2010 года Навальный запустил новый антикоррупционный интернет-проект-сайт «РосПил», содержавший информацию о сомнительных госзакупках.

Сам «РосПил» заявляет, что целью проекта является не отмена заказов, а поиск ограничивающих конкуренцию нарушений в документации к заказам.

Проект работает по следующей схеме. Пользователи сайта, участники проекта, выявляют предполагаемые коррупционные закупочные конкурсы (как правило, с помощью официального портала госзакупок). Профессиональные эксперты оценивают конкурсы с точки зрения возможной коррумпированности. Юристы проекта на основе проведённых экспертиз пишут жалобы в контролирующие органы (прежде всего, в Федеральную антимонопольную службу) с целью отмены коррупционных закупок. Эксперты и участники проекта, занимающиеся поиском коррупционных закупок, являются добровольцами. Юристы проекта являются официальными сотрудниками «РосПила», то есть за свою работу получают зарплату из средств проекта. Для финансирования проекта организован сбор частных пожертвований, перечисляемых через платёжную систему «Яндекс. Деньги».

«РосПил» не зарегистрирован как юридическое лицо, так как, по мнению Навального, по сравнению с выбранным способом организации и финансирования, «способ с созданием юридического лица, какого-то некоммерческого фонда или НКО, гораздо более формализован и чреват проверками, придирками и бесконечными комиссиями»[41].

Уже в самом начале работы сайт, сравнивавшийся по скандальности с WikiLeaks, содержал информацию о подозрительных госконтрактах на сумму более 155 миллионов рублей.

За полгода существования проекта рассмотрена 41 госзакупка. По состоянию на август 2013 года, было подано 178 жалоб в ФАС, 129 из которых были признаны обоснованными.

По состоянию на апрель 2011 года, «РосПил» заявил об обнаружении мошеннических тендеров, сумма начальных цен контрактов по которым составляет 1,6 млрд рублей. Сумма остановленных сомнительных или коррупционных закупок оценивалась авторами сайта в 337 миллионов рублей[42].