О судьбах киргизского народа в первые пять веков нашей эры, практически нет никаких сведений, есть лишь упоминание о Тянь—Шане — нынешней территории Киргизии, где существовал Сакский и Усуньский племенной союзы.

Между тем северный Китай и Центральная Азия были насыщены важными событиями. В промежутке между исчезновением хунну в IV веке и подъемом Тюркского каганата в VI веке был создан Великий Тюркский Каганат во главе с «ильханом» — правителем народов. В период наибольшего расширения (конец VI века) Каганат контролировал территорию Северо—Аосточного Китая, Монголию, Алтай, Центральную Азию и Кавказ. Однако после смерти Тобо–хана в 581 году произошло ослабление, а затем в 603 году Тюркский Каганат распался на Западно–тюркский каганат и Восточно–тюркский каганат.

Антитюркские силы Западно–тюркского каганата возглавило государство Кыргыз, в которую входили империя Тан и Тюргешский каганат. Во главе коалиции стоял ажо Барс–бег — историческая личность, которая по суждению известных историков олицетворяет образ Манаса Великодушного. Барс–бег пал в сражении с тюрками, преодолевшими зимой 710 года Саянский хребет и неожиданно напавшими на лагерь киргизов. Это событие достаточно подробно описал Лев Гумилёв в своём труде «Древние тюрки».

В середине VIII века киргизы становятся данниками уйгурских ханов. Однако после двадцатилетней войны в 840 году, киргизы сокрушают уйгуров и образуют государство — Киргизский каганат. С этого времени начинается широкая экспансия енисейских киргизов. Преследуя разбитых уйгуров, они проникают вглубь Восточного Туркестана и в Прииртышье — в пределы кимакского государства кочевников, располагавшегося на территории современного Казахстана и Южной Сибири.

Этот отрезок истории киргизов российский востоковед академик Василий Бартольд[4] в своём труде «Киргизы: Исторический очерк», называл «периодом киргизского великодержавия». К сожалению, сведенья об этом периоде весьма скудны.

Известно, что из страны киргизов вывозилось много мускуса и мехов. По описанию наружность у них грубая, отличаются воинственностью. Кочуют в повозках с лошадьми, баранами и коровами, занимаются охотой. Они почитают огонь и сжигают мёртвых. Живут в палатках и шатрах. По религии киргизы были шаманистами и, не смотря на торговые сношения с буддистами (тибетцами) и мусульманами, нет никаких известий о каком–либо успехе среди киргизов буддийской или мусульманской пропаганды.

Однако не прошло и ста лет после поражения уйгуров и начала киргизского великодержавия, как этому пришёл конец. В начале X века первенство в восточной части Средней Азии перешло к китаям, народу монгольского происхождения.

В 1207 году старший сын Чингиз хана — Джучи выступил против народов Южной Сибири. Киргизы, которые к тому времени были раздроблены, решили подчиниться Чингиз–хану без напрасного кровопролития. Все три киргизских владения: Еди — Орун (средний Енисей), Тува и Алтай были включены с состав империи Чингиз- хана.

В 1219 году Чинги–хан силою меча покорил Среднюю Азию. Перейдя Памир, монголы обрушились на города: Кашгар, Жаркенд, Хотан, Бухара, Коканд, Фергана, Хива, Мерв, Отрар, Термез и прекрасный Самарканд — один из самых развитых городов мусульманского мира. Затем очередь дошла до Афганистана, Ирана и Руси — находившейся под игом с 1237 по 1480 годы.

К тому времени, да и несколько позже, средневековый Восток дал миру выдающихся филосовов, ученых, поэтов. Ими были: Юсуф Баласугуни, Махмуд Кашгари, Аль Фараби, Ибн Сина, Фирдоуси, Бируни, Рудаки, Низами, Омар Хайям, Руми, Саади и другие.

Монгольская империя — крупнейшая за всю историю человечества, основанная в 1206 году Чингиз–ханом распалась на улусы в 1227 году после его смерти. Агония государства созданного ханом Батыем на этих обломках длилась до середины XV века. В неё входили: Большая орда — или Золотая орда, Ногайская орда, Астраханское ханство, Казанское ханство, Крымское ханство, Сибирское ханство.

Киргизы, между тем, оказались на Тянь—Шане и Памиро—Алае. Вопрос о том, когда и откуда предки киргизов пришли на занимаемые ныне киргизские земли, остаётся неясным и дискуссионным.

В 80 гг. XV века завершилась консолидация киргизской народности с образованием собственной государственности — Киргизского улуса или ханства. Этому предшествовало объединение всех племён в два «крыла» — традиционное объединение всех тюркских кочевников, начиная с гуннов. В правое крыло входили такие крупные племена, как сарыбагыш, бугу, саяк, солто, жедигер, тынымсеит, монголдор, багыш, баарын, черик, жору и другие проживающие в основном в Западном и Центральном Тянь—Шане. В левое крыло вошли племена: кушчу, сару, мундуз, жетиген, кытай, а так же южнокиргизские племена: адыгине, кыпчак, найман, тейит, кесек и другие.

Все племена, вошедшие в новую административно–военную систему стали именоваться общим этнонимом «кыргыз». Первым верховным правителем в 1508 году был объявлен Мухаммед—Кыргыз, активно способствовавший консолидации киргизских родов и племён. Он вошел в историю под легендарным именем Тагай—Бия и считается родоначальником киргизов.

В 1723 году, Цэван — Рабдан, правитель Колмакского (Джунгарского) государства, существовавшего между озером Балхаш, горами Тянь—Шаня и верховьями Иртыша со столицей в Кульдже, вторгся в Среднюю Азию и к казахам, захватил Семиречье и Ферганскую долину с Ташкентом, Ходжентом и Самаркандом.

Киргизы из Тянь—Шаня вынуждены были переселиться частью в Ферганскую долину, частью на Памиро—Алай и Кашгарию (Восточный Туркестан). Однако в 1755- 58 гг. под ударами цинского Китая Джунгарское ханство пало. Произошло обратное переселение киргизов из Ферганы и частью Кашгарии на Тянь—Шань с признанием себя китайскими подданными. На Памиро—Алае киргизы остались навсегда.

Подданство киргизов китайцам было номинальным и потому киргизы попали под власть усилившегося Кокандского ханства, просуществовавшего с 1709 по 1867 годы. Кокандский хан Ирдана переходит от союза с киргизскими феодалами к политике насильственного их подчинения. В 1762 году кокандцы захватили Ош, опустошили киргизские земли в окрестностях Узгена и распространил своё влияние на горные приферганские районы.

Тогда же, в 1770 году, первые подробные сведенья о киргизах сообщил в своей книге путешественник Филипп Ефремов, побывавший в Оше. Там он поднимался на Сулейман гору, а на Алае ознакомился с жизнью и бытом алайских киргизов.

В условиях экспансии Кокандским ханством, киргизы стали искать покровительства России. В 1785 году в Омск прибыло киргизское посольство. Однако русская дипломатия, связанная с Кокандом торговым договором, несмотря на просьбы киргизов о подданстве, проявила пассивность, что развязывало руки завоевательной политике Кокандского ханства. В 1821 Мадали–хан неожиданно захватил Кетмень — Тёбе, а затем в течение 1822 – 42 годах Чуйскую долину, Центральный Тянь—Шань и всю территорию, прилегающую к озеру Иссык—Куль. По ходу продвижения кокандских войск ими воздвигались укрепления и оставлялись гарнизоны: на Памиро—Алае — Таш—Коргон, Дараот—Коргон, Сопу—Коргон и Кызыл—Коргон; в Чуйской долине — Кара—Балта, Ак—Суу, Пишпек, Токмак; в Иссык–кульской котловине — Конур—Олён, Барскон, Котмалды, Каракол; на Тянь—Шане — Нарын, в верховьях реки Нарын — Джумгал и Куртка.

На оккупированной территории жили киргизы, узбеки, таджики, кипчаки и часть казахов, жестко эксплуатировавшиеся местными феодалами и ханской властью. В этот период стал усиленно распространяться ислам. Первое время киргизы платили кокандскому хану в основном три вида податей: тюндюк–зекет — по овце с юрты, алал–зекет — по одной голове с 40 голов скота и харадж — земельный налог. Кроме того, время от времени взимался военный налог по одной дилде — золотой монете или 3‑х баранов с юрты, а так же обязательный набор мужского населения в ханскую армию.