В последующие годы Джоффре I и его сын Чезаре III добились невиданных уступок от папства — была распущено папская армия, которую заменили солдаты Италии, король получил право взимать налоги и таможенные сборы в пределах Папской области, итальянская лира получила право хождения в Риме наряду со Скудо. Наконец, в 1640 году Чезаре III перенес свою резиденцию из Павии в Рим. Формально, король всего лишь принял приглашение папы временно поселиться в городе, фактически же туда переехал весь государственный аппарат королевства. Так, мирным путем, завершилось объединение Италии под властью Борджиа.

Однако перед присоединением Рима Борджиа пришлось силой завоевывать последний значимый итальянский город — Венецию, находившуюся доселе во власти Габсбургов. Воспользовавшись тем, что в 1636–1638 году император вынужден был вести войну на три фронта — северном, западном и восточном, Джоффре I развязал конфликт в области Венето. К этому времени сама Венеция утратила свой некогда блестящий статус — главным портом империи Габсбургов стали Зара и Рагуза, а бывшая столица независимой республики лишилась своих укреплений и морской базы в Кьодже.

В результате, Венецианская война началась очень успешно для Борджиа — саму Венецию взяли практически без боя, а далее итальянские войска, разжигая недовольство католического населения властью протестантов, продвинулись до самого Фиуме, или Флаума, как его называли немцы.

Однако на этом победы закончились — Иоанн II разбил итальянцев и вернул потерянные было земли в Тироле. Впрочем, потеря контроля над Венецией была для Габсбургов не столь существенной, поэтому кайзер не стал развивать первоначальный успех, целиком сосредоточившись на других театрах военных действий.

В 1632 и 1634 годах Англия поддержала роялистские выступления во Франции, чтобы ликвидировать угрозу распространения революции на другие государства Европы, однако все эти попытки обернулись крахом и утратой Англией Бретонского герцогства.

Иностранная интервенция против Франции началась весной 1636 года, когда Конвент принял «Акт о конфискации имущества врагов республики». Под конфискацию попали владения испанских королей к северу от Пиренеев, что немедленно привело к испано-французской войне, боевые действия которой развернулись в водах Средиземного моря и Атлантического океана, а также в Аквитании и Лангедоке. Параллельно Священная Римская империя вторглась во Франш-Конте.

Однако диктатор Франции — генерал Арман Ришелье — сумел организовать оборону страны. В армию республики были призваны тысячи новых рекрутов, благодаря чему на суше французы получили численный перевес над врагами — к 1638 году интервенты были изгнаны практически из всех регионов государства. На море положение было не столь удачным, т. к. испанский флот превосходил французский. Тем не менее, адмирал Авраам Дюкен сумел разбить врага в сражении у острова Ре, чем решил исход испано-французского противостояния в пользу Франции.

К 1638 году боевые действия Тридцатилетней войны в целом завершились — сражения продолжались лишь в колониях, где Испания столкнулась с Японией. Общая утомленность боевыми действиями и фактический распад антигабсбургской коалиции вынудил стороны сесть за стол переговоров. Однако они растянулись почти на 2 года, прежде чем наконец был заключен Голландский мир.

Переговоры между участниками конфликта начались в Голландии — в Амстердаме проходили переговоры между немцами, датчанами и шведами, в Гааге — между англичанами и немцами, а в Утрехте — между немцами, французами, испанцами и итальянцами.

Переговорный процесс продолжался два года, по итогам которого были заключены Амстердамский договор 15 мая и Утрехтский договор 24 октября 1640 года. Договоры содержали два важнейших раздела — о правовых положениях, и о территориальных изменения.

Голландский мир привнес в европейское право идеи веротерпимости и суверенитета. Согласно его условиям:

Все три ветви западного христианства — католицизм, евангелизм и реформатство — получили равные права на всей территории Европы.

Люди получили право свободно исповедовать свою религию, независимо от религии государства, в котором они проживали.

Вводилось понятие суверенитета, согласно которому государства самостоятельно и независимо ни от кого определяли свою внешнюю политику. Это положение позволило монархиям Европы вести переговоры с Французской республикой, т. к. теперь дипломатия признавалась прерогативой государства, а не короля или императора.

Территориальные аспекты регулировались датско-шведским, датско-германским, англо-германским, англо-французским, испано-французским и германо-итальянским договорами. Согласно их условиям:

Признавалась аннексия Габсбургами территорий Клеве, Бранденбурга, Майнца, Померании, Гольштейна и Мекленбурга;

Территории Эльзаса и Лотарингии признавались за Священной Римской империей;

Признавалась передача Венето от Германии к Италии;

Признавалась новая испано-французская граница, по которой за Испанией оставались Байонна и Беарн, но Франция удерживала Лимож, Тюренн, Фуа и др. бывшие испанские сеньории;

Швеция получала от Дании область Сконе и Норвегию;

Англия отказывалась от претензий на Бретань и Португалию;

Все колониальные потери Португалии признавались за их новыми владельцами.

Кроме того, раздел о территориальных изменениях содержал ряд пунктов, касательно новых дипломатических отношений в Европе:

Признавалось установление республики во Франции;

Признавалось единое Итальянское королевство в его новых границах;

Единственным сюзереном на территории Священной Римской империи признавался император — отныне внешнеполитические связи немецких князей не могли считаться законными без ведома кайзера.

Целый ряд соглашений вне Голландского мира закрепил новые границы в Европе — Россия и Германия подписали новое Люблинское соглашение, окончательно установившее границу двух империй, германо-румынское Мохаачское соглашение определило границу в Трансильвании, были подписаны соглашения между императором и курфюрстом Саксонии, по которым последний значительно увеличил свои владения. Кроме того, Португалия и Испания подписали отдельный договор об отказе от взаимных претензий и признании послевоенных границ.

Тридцатилетняя война стала поворотным моментом в европейской истории, заложив основы Голландской системы международных отношений, в основе которой лежит признание суверенитета государства на собственной территории. Данный принцип действует и по сей день.

В ходе Тридцатилетней войны завершилось объединение Италии, а также складывание централизованного государства в Германии. В 1641 году император Иоанн II специальным постановлением уравнял название «Германская империя» с принятым ранее «Священная Римская империя». Фактическое упразднение коллегии курфюрстов, выразившееся в том, что у них отобрали право избирать императора, означало, что новая Германия будет наследственной монархией, пусть пока что значительно ограниченной Рейхстагом.

Тридцатилетняя война также стала последней в истории Европы религиозной войной, однако и она на завершающем своем этапе утратила всякое религиозное содержание, превратившись в борьбу за гегемонию на континенте. По ее итогам гегемония Франции и Англии, продолжавшаяся всю 2-ю половину XVI века, ушла в прошлое — на море гегемоном стала Испания, а на суше Германия.

Тридцатилетняя война вплоть до XX века оставалась самым кровопролитным конфликтом в истории Европы. Общие потери по разным оценкам колебались от 5 до 8 миллионов человек. Многие регионы потерявшей от 20 до 45 % своего населения Германской империи были опустошены и долгое время оставались безлюдными. Распределение потерь было неравномерным. Особенно сильно пострадали регионы, где проходили или останавливались армии — Рейнланд, Бранденбург, Силезия, Богемия и др., где убыль населения значительно превышала 50 %, а местами и 70 %.

Передвижение огромного числа солдат привело к вспышкам эпидемий, выкосившим большее число людей, чем действующие армии. Наиболее распространенными болезнями, сопровождавшими боевые действия, были сыпной тиф, бубонная чума, цинга и дизентерия.