Пока же мы не можем точно сказать, с согласия ли Султан-Ахмед-хана или самовольно часть его подвластных участвовала в стычках с русскими войсками в Закавказье. Известно, однако, что поводом для столкновений войск с джаро-белоканским обществом, на помощь которому и пришли Сурхай-хан Казикумухский и Алисканди (Гоцатлинский), был отказ джарцев выдать беглых грузинских царевичей, в отместку за что якобы П. Д. Цицианов и решил дать им урок. Смысл же экспедиции заключался в том, чтобы «взять Белоканы и окончательно разрушить «разбойничье гнездо», постоянно державшее в страхе все Закавказье». Можно только предположить, что помощь аварцам все же была оказана с одобрения Султан-Ахмед-хана, поскольку Алисканди Гоцатлинский был ближайший советник Аварского ханского дома, а джарцы — постоянными союзниками аварских ханов.
Отношения Аварского ханства с Россией стали налаживаться только после смерти П. Д. Цицианова, когда на его место был назначен граф Иван Васильевич Гудович. Его назначение на пост главнокомандующего на Кавказе совпало с восстанием против русских в Карабахе. Владелец Карабаха Ибрагим-хан был женат на сестре Умма-хана Аварского Бахтике, приходившейся тетей Аварскому Султан-Ахмед-хану и его жене, ханше Баху-бике. Ибрагим-хан, не рассчитывая на собственные силы, пригласил к себе персов, обещая сдать им Шушу и выдать русский гарнизон, стоявший в крепости под командой майора Лисаневича. О переговорах Ибрагим-хана с персами узнали вовремя, и Лисаневич приказал его арестовать. Но в произошедшей при аресте стычке Ибрагим-хан и его любимая дочь были убиты. Это убийство взволновало умы во всем крае. Даже разгром двадцатитысячного персидского войска при Хваршинском ущелье генералом Небольсиным на Аскоране не предотвратил выступление Шекинского хана Селима, который не хотел оставаться в подданстве России после того, как его друг и родственник Ибрагим Карабагский был убит Лисановичем. Убийство родственника, видимо, послужило поводом, если не причиной, поддержки Шекинского хана и Султан-Ахмед-ханом, который во главе аварской конницы и джарцев атаковал русских в Джарском ущелье. Вынужденный отойти из Джаро-Белокан к себе в горы, Султан-Ахмед-хан вступил в переговоры с прибывшим к этому времени на Кавказ И. В. Гудовичем.
И. В. Гудович по прибытии на место несколько изменил жесткую, а порой и грубую политику П. Д. Цицианова на лояльное, более дружественное отношение.
Уже 21 декабря 1806 г. И. В. Гудович сообщает министру иностранных дел А. Я. Будбергу о том, что Султан-Ахмед-хан вступил в переговоры о выдаче ему тетки (вдовы Ибрагим-хана Бахтики) с ее детьми, находящейся в Карабагском владении, и ходатайствует перед Александром I о возобновлении жалованья, которое он получал.
Александр I, одобрив политику И. В. Гудовича по отношению к дагестанским владетелям, повелел жалованье Султан-Ахмед-хану выдавать, «буде усмотрено будет действительно усердие и покорность его к России».
В начале 1807 г. Султан-Ахмед-хан вновь публично присягнул и дал письменное обязательство о пребывании его в нерушимой верности государю российскому и в залог его выдал в аманаты двух почетнейших старшин и родственника (Хересело-бека), который, судя по тому, что вдова Ибрагим-хана Карабагского приходится и ему тетей, являлся двоюродным братом Аварскому хану.
Текст обязательства носил иной, чем прежде, характер. Хан Аварский обязывался удерживать своих подданных от «хищни-честв, грабежей…, не только воздерживать, но и отвращать от подобных деяний соседей…беглых российских подданных отсылать к русскому начальству».
Относительно возвращения в Хунзах из Карабаха вдовы Бахтики и ее детей И. В. Гудович, проявляя большой такт, отвечает: «…я охотно готов удовлетворить желанию вашему и отпустить ее к вам. Однако же, не зная, можно ли по обычаям вашим отпускать и детей ее, я писал о сем Мехти-Кули-хану Карабагскому, требуя, чтобы он, если это не противно обыкновениям их, отпустил ее к вам с детьми, в каком случае нужно будет… выслать на границу своих людей. Буде же бы она пожелала сама добровольно остаться с детьми в Шуше, то я истребую от Мехти-Кули-хана о назначении ей удела для содержания ее».
Здесь уместно отметить, что в свое время Умма-хан Аварский выдал свою сестру Бахтику за Ибрагим-хана против ее воли. Это был политический брак, которым Умма-хан стремился укрепить свои позиции в Закавказье. Бахтике, видно, и после смерти мужа не суждено было вернуться на родину, ибо сведения о ней и о ее детях в последующей истории Хунзаха отсутствуют.
Период с 1807 г., вплоть до назначения наместником Кавказа А. П. Ермолова, можно отнести ко времени относительно мирных отношений дагестанских владетелей с российской администрацией на Кавказе. Не отличается в этом плане и Аварское ханство.
В апреле 1807 г. министр иностранных дел А. Я. Будберг извещает И. В. Гудовича о награждении высокими чинами владетелей Дагестана, в том числе Султан-Ахмед-хану Аварскому присваивался чин генерал-майора. В грамоте Александра I Аварскому хану от 16 марта 1807 г. отмечалось, что «усердие и верность ваша к всероссийскому императорскому престолу обратили на себя наше всемилостивейшее внимание, во уважение чего и в знак особенного к вам нашего…благоволения признали мы за благо пожаловать вас в чин российского генерал-майора».
Сменивший И. В. Гудовича на посту главнокомандующего на Кавказе А. П. Тормасов, а затем и Н. Ф. Ртищев также не сменили курс по отношению к местным владетелям. Многочисленные архивные материалы свидетельствуют, что Султан-Ахмед-хаи Аварский и Ханский двор в целом придерживались прорусской ориентации. Султан-Ахмед-хан лично принимал активное участие в приведении в подданство России различных обществ, за что неоднократно получал благодарности и подарки от российских властей на Кавказе.
Гюлистанский мирный договор между Россией и Ираном, который признал «принадлежащими в собственность России ханства Карабагское и Гянжинское…Шекинское, Ширванское, Дербентское, Кубинское, Бакинское и Талышское…весь Дагестан и Грузию», в первые три-четыре года не изменил внутреннюю жизнь дагестанских обществ. Зато ситуация изменилась с появлением А. П. Ермолова на Кавказе. Его твердая линия на практическое включение территории в административную систему империи сразу натолкнулась на решительный протест ряда владетелей Дагестана. Среди них активную роль стали играть два брата: Султан-Ахмед-хан Аварский и Гасан-хан Мехтулинский.
А. П. Ермолов, прошедший суровую школу войн против персидской армии Ага-Мохаммед-хана, вторгшейся в Закавказье в 1796 г., а затем многочисленных сражений против Наполеона, будучи крупным военачальником, не оказался знатоком кавказской политики. Суровая военная жизнь наложила отпечаток на весь его стиль административной деятельности. Привыкший наводить жесткий порядок на покоренных территориях в Европе в период походов против Наполеона, А. П. Ермолов продолжал и на Кавказе линию жестких карательно-ограничительных мер. Отказ от политики поиска компромисса и стремление к скорейшему покорению края привели к единовременному выступлению против А. П. Ермолова почти всех владетелей Дагестана, за исключением шамхала Тарковского. Гасан-хан Мехтулинский, Султан-Ахмед-хан Аварский, Ших-Али-хан Дербентский (свергнутый с престола), кадий Акушинский во главе своих отрядов весной 1818 г. вступили в сражение с русскими войсками около с. Башлы, жители которого восстали, выйдя из повиновения уцмию Каракайтагскому. Взбунтовался против шамхала Тарковского и Карабудахкент.
В Дагестане возникло стремление сформировать обширный союз народов, чтобы соединенными силами действовать против русских. К союзу примкнули внутренние ханства Аварское и Казикумухское, вольное Акушинское общество и владения, примыкающие к морю: Мехтула, Кара-Кайтаг и Табасаран. В то же время дагестанцы старались привлечь к союзу на севере шамхальство Тарковское, а на юге Кюринское владение, отторгнутое Россией от Казикумуха.
Интересным является и тот факт, что активное участие в организации антирусской борьбы принял знаменитый в горах своей ученостью Саид-Эфенди (Араканский), который на следующих этапах Кавказской войны не только отмежевался от нее, но и стал проводником пророссийской политики. Главной причиной всех волнений в Дагестане А. П. Ермолов считал Аварского хана.
