Казалось бы, дело шло к тому, что в апреле 2001 г. Ханссен с почётом отправится на заслуженный отдых, то есть выйдет в отставку. Однако, к сожалению, этим его надеждам не суждено было сбыться. В конце 2000 г. двое российских разведчиков, работавших под дипломатическим прикрытием, стали невозвращенцами: в октябре — 1-й секретарь постоянного представительства России при ООН Сергей Третьяков, а в декабре — 1-й секретарь посольства РФ в Канаде Евгений Топоров. Судя по всему, один из них, а может и оба сразу, выдали Ханссена американцам.

В конце октября 2000 г. за Ханссеном было установлено скрытое круглосуточное наблюдение. 12 января 2001 г. его перевели в штаб-квартиру ФБР в управление информационных ресурсов на специально созданную для него должность. А 18 февраля он был арестован в момент закладки в тайник очередной порции документов.

21 февраля Ханссен предстал перед окружным судом расположенного вблизи Вашингтона города Александрии (Вирджиния), где по традиции рассматриваются все дела о шпионаже. Ему было предъявлено обвинение в разглашении государственной тайны. Однако Ханссен категорически отказался признать свою вину. Следующее судебное заседание состоялось 5 марта. И вновь Ханссен не признал свою вину.

Разоблачение Ханссена нанесло тяжёлый удар по репутации ФБР. Именно оно, скорее всего, послужило причиной досрочного ухода в отставку директора Бюро Луиса Фри (хотя, справедливости ради, надо отметить, что слухи о желании Фри выйти в отставку циркулировали задолго до этого). 26 марта началась массовая проверка сотрудников ФБР на детекторе лжи. Всего этой процедуре было подвергнуто около 500 человек — в основном, старший руководящий состав, а также сотрудники, имеющие доступ к секретным файлам и базам данных.

31 мая Ханссен вновь предстал перед окружным федеральным судом в Александрии. В ходе судебного заседания был официально зачитан список обвинений, включавший в себя 21 пункт. По 14 из них Ханссену грозила смертная казнь. Однако он вновь не признал себя виновным. В решением судьи процесс по делу Ханссена был перенесён на 29 октября 2001 г.

Тем временем между адвокатами Ханссена и представителями обвинения шли интенсивные переговоры о заключении судебной сделки: признание себя виновным и сотрудничество со следствием в обмен на сохранение жизни. В таком повороте событий был заинтересован не только обвиняемый, но и руководство американских спецслужб. Так, 20 мая директор ЦРУ Джордж Тенет заявил, что выступает против вынесения Ханссену смертного приговора и даже обратился с такой просьбой к генеральному прокурору. Подобный «гуманизм» имел две причины. Во-первых, это заинтересованность в том, чтобы Ханссен дал развёрнутые показания о своём сотрудничестве с советской разведкой. Во-вторых, желание избежать долгого и изнурительного судебного процесса, в ходе которого неизбежно возникли бы проблемы с сохранением секретности материалов дела.

15 июня 2001 г. было объявлено, что Министерство юстиции США отказалось от требования вынести Ханссену смертный приговор. После этого между адвокатами и представителями обвинения была достигнута договорённость: на специальном судебном заседании, состоявшемся 6 июля, Ханссен признал себя виновным по 15 из 21 пункта обвинения и подробно рассказал суду о своей разведывательной деятельности. В обмен на это признание прокуроры не стали требовать для него смертной казни. Более того, согласно договорённости между обвинением и адвокатами Ханссена, его семья сможет получать полагающуюся ему пенсию в размере 6000 долларов в месяц.

10 мая 2002 г. Ханссен была приговорён к пожизненному заключению.

Агентство национальной безопасности является ведущей американской спецслужбой в области радиоэлектронной разведки и контрразведки.

АНБ можно по праву назвать наиболее секретной из всех организаций, входящих в Разведывательное сообщество США. Устав АНБ до сих пор засекречен. Лишь в 1984 г. были преданы огласке некоторые его положения, из которых явствует, что агентство освобождается от всех ограничений на ведение разведки связи. На протяжении многих лет сотрудники АНБ не имели права разглашать место своей службы — в ответ на вопросы о том, где они работают, они должны были отвечать: «на федеральное правительство» или «в Министерстве обороны». Даже сегодня бывшим сотрудникам АНБ запрещено писать мемуары или делиться воспоминаниями о своей работе. Количество вышедших в США книг, посвящённых АНБ, можно в буквальном смысле пересчитать по пальцам. Предание гласности официальных сведений об агентстве (бюджет, численность персонала, структура) запрещено законом.

Размещённый в Интернете официальный сайт АНБ в известной степени напоминает советскую телевизионную программу «Время» периода застоя: если там едва ли не половину эфирного времени занимал показ комбайнов и колхозных коров, то здесь примерно такой же процент информации посвящён рассказам о том, как сотрудники АНБ помогают защищать окружающую среду родного штата Мэриленд (где находится штаб-квартира АНБ), платят налоги, сдают донорскую кровь и т. п.

Как уже сказано, АНБ занимается радиоэлектронной разведкой, то есть прослушиванием радиоэфира, телефонных линий, компьютерных и модемных систем, излучений факсовых аппаратов, сигналов, испускаемых радарами и установками наведения ракет, и т. д.

Кроме того, на АНБ возложены обязанности по обработке собранной информации, передаче полученных данных заинтересованным ведомствам для нужд внешней разведки и контрразведки, оказанию разведывательной поддержки операциям американских вооружённых сил, а также проведению научных изысканий и внедрению разработок в области электронной разведки. Вторая группа решаемых АНБ задач связана с выполнением контрразведывательных функций — это обеспечение безопасности линий связи, ведение внешней шифропереписки, разработка кодов и шифров для передачи секретной информации и специального оборудования связи.

По своему статусу АНБ является «особым агентством в составе Министерства обороны». Возглавляющий его директор должен быть военнослужащим, ранее работавшим в разведке и имеющим звание трёхзвёздного генерала (то есть генерал-лейтенанта) или вице-адмирала. Он подчиняется министру обороны и представляет АНБ в Разведывательном сообществе США. Кроме того, директор АНБ одновременно возглавляет созданную в 1972 г. Центральную службу безопасности (Central Security Service), занимающуюся шифрованием информации, передаваемой по американским каналам связи, и дешифровкой иностранных кодов. В настоящее время пост директора АНБ занимает генерал Кейт Александер (Keith Alexander), вступивший в должность 1 августа 2005 г.

Первый заместитель директора АНБ первоначально именовался Vice Director, этот пост также должен был занимать военнослужащий. Однако в августе 1956 г. эта должность была переименована в Deputy Director, и с тех пор её занимают штатские лица. С августа 2006 г. первым заместителем директора АНБ является Джон Инглис (John Inglis).

Кроме того, в высшее руководство АНБ входят замдиректора по операциям, замдиректора по техническим вопросам и замдиректора по безопасности информационных систем. Они также обязательно должны быть гражданскими специалистами.

Штаб-квартира АНБ расположена в Форт-Миде, штат Мэриленд.