Несмотря на эти впечатляющие успехи, этого все равно было недостаточно для того, чтобы противостоять огромной мощи противников Японии. Между 1941 и 1945 гг США производили самолетов больше, чем Германия и Япония вместе взятые.

Когда 18 апреля 1942 г шестнадцать бомбардировщиков В-25, стартовавших с авианосца "Хорнет" во главе с подполковником Дулиттлом, нанесли первый удар по метрополии, это мало отразилось на японской авиапромышленности. После этого первого налета наступил перерыв до 15 июня 1944 г, когда В-29 с баз в Китае совершили свой исторический налет на сталелитейный завод в Явате. Но основные японские промышленные центры вокруг Токио, Нагойи и Осаки находились вне радиуса действия "китайских" В-29 и оставались в покое еще четыре месяца.

24 ноября 1944 г начались налеты на индустриальные центры Японии В-29 с Марианских островов. Авиационные и авиамоторные заводы японцев оказались главной целью 20-й американской воздушной армии. С этого момента ущерб для японской промышленности стал очевиден. Несмотря на то, что большинство заводов, подвергшихся налетам, практически прекращали выпуск продукции, некоторым удалось избежать тяжелых повреждений и неимоверными усилиями сохранить работоспособность. Тем не менее, рабочий цикл был во многом разорван, и производство скатилось ниже среднего уровня.

По американским послевоенным оценкам потери в двигателестроении с декабря 1944 г по июль 1945 г составили 43 процента от возможного производства, если бы не налеты и последовавшее затем расе ред оточе н ие производства.

Потери в самолетостроении оценивались в 18 процентов.

К сокращению выпуска авиационной продукции приводили также налеты на основные населенные пункты. По мимо сокращения поставок продовольствия все больше рабочих отвлекались на сельхозработы, что вело к большим потерям рабочего времени в промышленности, а непосредственные налеты заставляли население перемещаться в сельскую местность. По мере усиления частоты и эффективности налетов рабочие при первых же сигналах тревоги останавливали станки. Налеты на жилые кварталы разрушили дома многих рабочих, нарушили семейную жизнь и оторвали людей от места работы. Все эти факторы только в авиационной промышленности за весну 1945 г привели к потере производительности труда на 20-25 процентов. Это осложнялось призывом рабочих в армию и во флот, что заставляло использовать на производстве женщин, учащихся высших школ и солдат.

Флот союзников также внес свою лепту в падение производства японской авиапромышленности. К середине 1944 г блокада и потери среди транспортных судов привели к критической ситуации, в первую очередь, в двигателестроении. Недостаток кобальта, никеля, хрома, молибдена -всех материалов необходимых для производства высококачественных сталей, применяемых в двигателестроении - вызвали серьезные трудности у производителей. Попытка использовать заменители не только замедлила производство, но и увеличила количество отказов техники и, следовательно, небоевые потери. К октябрю 1944 г поставок двигателей уже едва хватало для установки на новые самолеты. Самолеты, ожидающие поставок двигателей, забивали производственные помещения, а на летных полях они простаивали в ожидании поставок запчастей.

К лету 1944 г запасы алюминиевого листа сократились вдвое, но, так как налеты и рассредоточение производства привели с сокращению выпуска самолетов, удалось избежать полного истощения запасов. Если бы все планы производства выполнялись, то запасы алюминия истощились бы еще до конца войны. Тем не менее, к концу войны делались активные попытки применить в самолетостроении недефицитные материалы. Японские инженеры все чаще использовали в своих конструкциях дерево и сталь, планируя полностью перейти на них в конце 1945 г - в начале 1946 г.

В течение войны приоритеты в производстве самолетов менялись: основной упор все больше делался на выпуск истребителей. С началом налетов союзников на Японию производство истребителей стало еще более приоритетным. Эту тенденцию можно проследить по доле истребителей в общем выпуске самолетов, которая возросла с 21% в 1941 до 33% в 1942 г, 43% в 1943 г, 49% в 1944 г и почти 50% в 1945 г. Однако возрастающий выпуск истребителей не снизил потребности в двигателях, так как большинство японских бомбардировщиков были одномоторными.

Несмотря на отдельные попытки производителей надежно укрыть свои производства, правительство не разрешало переводить их в подземные или полуукрытые убежища без гарантий, что не пострадает объем выпуска продукции. Хотя многие компании пошли на эти условия, реально рассредоточение производства не происходило вплоть до паники после начала массированных налетов американских бомбардировщиков в ноябре-декабре 1944 г.