Как заметил один из чиновников генерал-губернатора Восточной Сибири: «Тревожная тень прощания с нашими колониями витает над Русской Америкой».

О вооруженных столкновениях в 50-х годах XIX века на Аляске и близких от нее островах сообщал Петр Тихменев: «…в 1851 году племя куюканцов, т. е. жителей р. Куюка, напали на нулатовскую одиночку (русское поселение), убили управляющего ею служителя компании Дерябина и смертельно ранили находившегося там в то время лейтенанта английской службы Бернарда и одного алеута, и затем выжгли и разграбили туземное население Нулато. Причиною такого нападения было, как оказалось впоследствии, покровительство, оказываемое русскими нулатовцам, находившимся во вражде с куюканцами».

Тихменев писал, что подобное происшествие произошло в 1855 году: «Дикари, из так называемого разбойничьего жила, разграбили находящуюся к югу от Михайловского редута, в трех верстах от устья реки Нычыглик, Андреевскую одиночку и убили состоящих при ней двух служителей компании, бывших в то время в бане.

Третий служитель, остававшийся в одиночке, успел убежать, но, изнемогая от голода и холода, также сделался бы, конечно, жертвою разбойников, если бы один из встретившихся ему туземцев не принял его к себе и потом не доставил в редут».

Управляющий Михайловским редутом Андриянов тут же приступил к розыску напавших на русское поселение. Вскоре их отыскали, взяли в плен и вернули награбленное имущество.

В том же 1855 году случился вооруженный конфликт русских с колошами острова Ситха. Туземцы пытались украсть дрова, принадлежащие Российско-американской компании. При этом они ранили копьем часового. Правитель колонии капитан 1-го ранга Степан Васильевич Воеводский потребовал выдать виновных. Но колоши не послушались и не сложили оружие.

Воеводский приказал сделать из пушек предупредительные выстрелы вдоль залива. Но это не угомонило туземцев.

Согласно описанию Тихменева, «вооруженная толпа дикарей бросилась к крепостной ограде и начала рубить полисад, а один из них выстрелил в находившегося на батарее компанейского служителя и ранил его смертельно.

Тогда уже был открыт против них пушечный и ружейный огонь, но и тут колоши не остановились. Некоторые из них старались пробраться в порт, но к счастью безуспешно; другие заняли деревянную церковь, построенную для богослужения на туземном языке, и начали стрелять из окон».

Перестрелка длилась около двух часов. Понеся большие потери, колоши наконец сдались. Во время этого столкновения двое русских погибло, девятнадцать — ранено. Убито и ранено было около шестидесяти колошей.

Последний правитель Русской Америки князь Дмитрий Максутов не раз повторял: «Какие бы ни были трудности в наших колониях, а флот компании надобно держать в порядке и наготове».

В 50–60-х годах XIX века флотилия Русской Америки значительно пополнилась судами нового поколения. Были уже среди них и винтовые, и колесные пароходы. Корабли строились в Русской Америке и покупались у иностранцев.

Так, с новоархангельской верфи сошли бот «Камчадал» и шхуна «Клинкит». Там же осуществлялся ремонт многих судов Русской Америки.

По заказу Российско-американской компании в Нью-Йорке был построен винтовой пароход «Император Александр II», а в Нью-Кестле — «Великий князь Константин».

Колесные пароходы: «Император Николай I» в 60 сил — корпус изготовлен в Ново-Архангельске из местного кипариса, а машина выписана из США; «Баранов» в 30 сил — построен в 1860 году там же и из того же дерева, а машина сделана в Америке.

Во флотилию Русской Америки входили парусники: корабль «Император Николай» — построен по заказу Компании в Нью-Йорке; корабль «Камчатка» — построен в Гамбурге; корабль «Цесаревич» — построен в Любеке; корабль «Царица» — построенный в Портсмуте; корабль «Князь Меншиков» — построенный в штате Массачусетс; корабль «Нахимов» — построенный в штате Мерилэнд; бриг «Шелехов» — построенный в Гамбурге; бриг «Великий князь Константин» — построенный в Бостоне; шхуна «Аян» — построенная в Аяне; шхуна для китового промысла, построенная в Або.

Названные кораблестроительные верфи в середине XIX века считались лучшими и дорогостоящими. Но Российско-американская компания на свой флот денег не жалела. Затраты на качественные корабли стоили того.

Однако суровый, трудно предсказуемый Тихий океан брал свою дань. И самые совершенные для того времени суда погибали во время штормов. Расследования кораблекрушений показали, что нередко не только грозная стихия, но и ошибки экипажей приводили к катастрофам.

В пятидесятых годах, в разгар Крымской войны, по селениям Русской Америки поползли слухи, что в гибели некоторых судов виноваты англичане. Их военные и китобойные корабли якобы совершали нападения на суда Российско-американской компании, топили их, а экипажи или брали в плен, или убивали.

Но серьезных доказательств подобным слухам не было.

По каждому крушению русского судна составлялся подробный рапорт для Российско-американской компании и для Адмиралтейства. Вот как описана гибель корабля «Кадьяк». В 1860 году на этом судне доставляли из северных русских колоний в Сан-Франциско лёд. Груз был принят на острове Лесном. «Кадьяк» наткнулся на подводные камни, едва выйдя из гавани. В носовой части корабля образовался большой пролом. Вода ворвалась в трюм, и судно стало быстро погружаться носом.

Капитан «Кадьяка» шкипер Архимандритов приказал спустить гребные шлюпки, чтобы экипаж мог вернуться на остров Лесной. Как отмечалось в документах: «Сам же Архимандритов оставил судно последним, когда вода уже наполнила трюм, но держался однако-же вблизи его на шлюпке, изыскивая все средства спасти что только было возможно.

Несмотря на старания отбуксировать корабль в гавань, — предпринятые как командиром, так и кадьякской конторой, выславшей… все состоявшие в ее распоряжении баркасы и байдары, — большое волнение и свежий ветер воспрепятствовали привести это в исполнение. На третий день корабль потонул в расстоянии 100 сажень (морская сажень — 1,83 м) от острова Елового, на глубине, при полной воде, более 10 сажень».

В 50-х годах XIX столетия в северных водах Тихого океана потерпело крушение более 30 русских кораблей.

Случалось, что суда Русской Америки пропадали бесследно. И тогда среди колонистов возникали всевозможные версии причин гибели кораблей.

В 50-х — начале 60-х годов XIX века морские офицеры постоянно напоминали руководству Российско-американской компании о необходимости иметь современный, хорошо оснащенный флот. Без такого флота Русская Америка прекратит свое существование, — заявляли они. Конечно, дирекция Компании соглашалась с этим, но содержать флот, полностью удовлетворяющий нужды колонии в Северной Америке, не могла. Не хватало финансов.

Зарубежные политики были уверены, что после поражения в Крымской войне корабли Российского военного флота еще много лет не появятся в Атлантическом и Тихом океанах.

Но эти ожидания не оправдались. В 1863 году император Александр II принял решение оказать поддержку Северным Штатам в войне с рабовладельческим Югом и охладить агрессивный пыл Англии и Франции по отношению к России. Для этого были снаряжены две эскадры.

Одна, под командованием контр-адмирала Василия Попова, отправилась в Тихий океан, другая, под командованием контр-адмирала С. С. Лисовского, — в Атлантику. В Тихоокеанскую эскадру вошли корветы «Богатырь», «Боярин», «Калевала», «Новик», «Рында», клиперы «Абрек», «Гайдамак».

Русские эскадры почти одновременно (сентябрь 1863 г.) прибыли к месту назначения. Одна — в Нью-Йорк, другая — в Сан-Франциско. Наши корабли крейсировали у атлантических и тихоокеанских берегов Соединенных Штатов Америки до лета 1864 года.