В период «холодной войны» в составе морской разведки было образовано ещё несколько новых структурных подразделений. Поначалу они существовали отдельно одна от другой и подчинялись непосредственно Управлению морской разведки. Так, в 1960 г. был создан Военно-морской центр научно-технической разведки (Naval Scientific and Technical Intelligence Center), размещавшийся на наблюдательной базе ВМС США в Вашингтоне. Эта структура фактически во многом дублировала функции Военно-морского центра дешифрования фотоснимков, который в 1964 г. был преобразован в Военно-морской центр разведки и технического обеспечения (Naval Reconnaissance and Technical Support Center).

В 1967 г. в связи с коренной реорганизацией ВМС в целях сокращения штабного персонала и объединения разрозненных служб было создано Командование морской разведки (Naval Intelligence Command), подчинившее себе многие разведподразделения, в том числе и два упомянутых центра.

В 1972 г. Военно-морской центр научно-технической разведки и Военно-морской центр разведки и технического обеспечения были слиты в единую структуру — Военно-морской центр разведобеспечения (Naval Intelligence Support Center). В 1988 г. он был переименован в Военно-морской центр технической разведки (Naval Technical Intelligence Center).

Тем временем подразделение оперативной разведки УМР, известное как Отдел специальной разведки, в 1957 году было переименовано в Отдел морской оперативной разведки (Navy Field Operational Intelligence Office) и переведено в Форт Мид (Мэриленд), где находилась штаб-квартира АНБ. В 1970 г. на базе этого отдела был дополнительно развёрнут Центр морского слежения и разведки (Naval Ocean Surveillance Intelligence Center), разместившийся в Сьютленде.

В 1981 г. в целях налаживания более эффективного противодействия стремительному росту активности СССР на море ВМС США объединили Отдел морской оперативной разведки и Центр морского слежения и разведки в единый Военно-морской центр оперативной разведки (Naval Operational Intelligence Center), разместившийся в Сьютленде и в комплексе международного аэропорта Балтимор-Вашингтон. На новый центр, способный отслеживать все действия советских военно-морских сил в Мировом океане, были возложены задачи по обеспечению предупреждения и оповещения, ведению текущей оперативной разведки и всестороннему анализу получаемой информации.

Параллельно с этим в 1969 г. в помощь разведслужбам флотов была создана оперативная разведывательная группа 168, которая с течением времени оформилась в самостоятельную влиятельную структуру морской разведки, представители которой работали в самых различных уголках земного шара.

В 1964 г. в Александрии (Вирджиния) была образована Служба обработки данных морской разведки (Naval Intelligence Processing System Support Activity) — техническое подразделение по обслуживанию корабельного компьютерного оборудования. Позже на эту службу возложили задачи по обслуживанию всех разведывательных телекоммуникационных систем США. Поначалу в Сьютленде находилось лишь несколько представителей этой службы, прикомандированных к главному разведцентру ВМС, а с 1979 г. сюда переехала вся служба. В 1985 г. на неё возложили задачи по обеспечению безопасности обработки разведданных. В 1988 г. она была переименована в Автоматизированный центр морской разведки (Naval Intelligence Automation Center), а в 1990 г. — в Службу обеспечения морской разведки (Naval Intelligence Activity).

Как это ни парадоксально, но решительные шаги по объединению всех этих структур военно-морской разведки в единое целое были предприняты тогда, когда, собственно говоря, нужда в ней во многом отпала — после развала Советского Союза. В октябре 1991 г. Военно-морской центр технической разведки, Военно-морской центр оперативной разведки, Оперативная разведывательная группа 168 и частично Служба обеспечения морской разведки были объединены в Центр военно-морской и приморской разведки (Naval Maritime Intelligence Center) со штаб-квартирой в Сьютленде.

Наконец в январе 1993 г. в состав Центра вошли оставшиеся разрозненные спецслужбы ВМС США, и он был переименован в Национальный центр морской разведки (National Maritime Intelligence Center), напрямую подчинённый Управлению морской разведки. Более того, позднее в него вошли также разведки Корпуса морской пехоты и Береговой охраны.

Общая численность персонала Управления морской разведки составляет приблизительно 16 тысяч человек. Его бюджет оценивается в 1,2 млрд долларов.

До 1911 г. — начальник разведки (Chief Intelligence Officer).

С 1911 г. — директор военно-морской разведки.

июнь 1882 — апрель 1885:

лейтенант Мэйсон, Теодор Б.М. (Mason, Theodorus B.M.);

апрель 1885 — июль 1889:

лейтенант Роджерс, Рэймонд П. (Rodgers, Raymond P.);

сентябрь 1889 — август 1892:

коммандер Дэвис, Чарльз Г., младший (Davis, Charles H.);

сентябрь 1892 — июнь 1893:

коммандер Чедвик, Френч Э. (Chadwick, French E.);

июнь 1893 — апрель 1896:

лейтенант Зингер, Фредерик (Singer, Frederick);

апрель 1896 — ноябрь 1897:

лейтенант-коммандер Вайнригз, Ричард (Wainwright, Richard);

ноябрь 1897 — май 1898:

коммандер Клэвер, Ричардсон (Clover, Richardson);

май-октябрь 1898:

капитан Бартлетт, Джон Р. (Bartlett, John R.);

октябрь 1898 — февраль 1900:

коммандер Клэвер, Ричардсон (Clover, Richardson);

февраль 1900 — апрель 1903:

капитан Сигсби, Чарльз Д. (Sigsbee, Charles D.);

май 1903 — апрель 1906:

коммандер Шредер, Ситон (Schroeder, Seaton);

апрель 1906 — май 1909:

капитан Роджерс, Рэймонд П. (Rodgers, Raymond P.);

май-декабрь 1909:

капитан Вриленд, Чарльз Е. (Vreeland, Charles E.);

декабрь 1909 — январь 1912:

капитан Поттс, Темплин М. (Potts, Templin M.);

январь 1912 — декабрь 1913:

капитан Роджерс, Томас С. (Rodgers, Thomas S.);

декабрь 1913 — январь 1914:

капитан Брайн, Генри Ф. (Bryan, Henry F.);

январь 1914 — март 1917:

капитан Оливер, Джеймс Гаррисон (Oliver, James Harrison);

апрель 1917 — январь 1919:

контр-адмирал Уэллс, Роджер, младший (Welles, Roger);

май 1919 — сентябрь 1920:

контр-адмирал Ниблэк, Альберт П. (Niblack, Albert P.);

сентябрь 1920 — июнь 1921:

контр-адмирал Лонг, Эндрю Т. (Long, Andrew T.);

сентябрь 1921 — ноябрь 1923:

капитан Макнейми, Люк (McNamee, Luke);

декабрь 1923 — сентябрь 1925:

контр-адмирал Хоуг, Генри Х. (Hough, Henry H.);

октябрь 1925 — июнь 1926:

капитан Гэлбрейт, Уильям В. (Galbraith, William W.);

июль 1926 — сентябрь 1927:

капитан Хепберн, Артур Дж. (Hepburn, Arthur J.);

декабрь 1927 — июнь 1930:

капитан Джонсон, Альфред В. (Johnson, Alfred W.);

июнь 1930 — май 1931:

капитан Болдридж, Гарри А. (Baldridge, Harry A.);

июнь 1931 — май 1934:

капитан Эллис, Хайн (Ellis, Hayne);

июнь 1934 — апрель 1937:

капитан Пулестон, Уильям Д. (Puleston, William D.);

май 1937 — июнь 1939:

контр-адмирал Хьюз, Ральстон С. (Hughes, Ralston S.);

июнь 1939 — январь 1941:

контр-адмирал Андерсон, Уолтер С. (Anderson, Walter S.);

январь-февраль 1941:

капитан Джеймс, Жюль (James, Jules);

март 1941 — октябрь 1941:

адмирал Кирк, Алан Г. (Kirk, Alan G.);

октябрь 1941 — июль 1942:

контр-адмирал Уилкинсон, Теодор С. (Wilkinson, Theodore S.);

июль 1942 — сентябрь 1943:

контр-адмирал Трейн, Гарольд C. (Train, Harold C.);