Курсы располагались в старинной усадьбе XVIII века на Покровке, дом 27. Именно со дня открытия этих курсов — с 26 апреля 1921 года — начинается история Академии, как постоянно действующего учебного заведения органов безопасности страны.

В 1922 они были преобразованы в Высшие курсы ГПУ, ставшие предшественником как сети курсов и школ ГПУ, так и будущей Высшей школы КГБ имени Ф.Э. Дзержинского, с 15 июля 1952 года — ВШ МГБ СССР.

В феврале-мае 1928 года курс лекций по контрразведке на Высших курсах читал член Коллегии ОГПУ Артузов, один из родоначальников советской контрразведки.

Нехватка чекистских кадров в стране в начале 1930-х годов, особенно в территориальных органах ОГПУ, привела к необходимости создания специализированного учебного заведения.

В 1930-м году Политбюро Центрального комитета ВКП(б) принимает решение о направлении на учёбу с последующим зачислением на службу в органы госбезопасности 1000 передовых рабочих-производственников.

В мае 1930-го года издается Приказ о сформировании в Москве школы по подготовке и переподготовке чекистских кадров, которая с 4 июня 1930 года именуется Центральной школой ОГПУ.

В июле 1934 года Центральная школа ОГПУ, в связи с образованием Народного комиссариата внутренних дел СССР, в состав которого вошло ОГПУ, была переименована в Центральную школу НКВД.

В марте 1939-го года Центральная школа Главного управления государственной безопасности НКВД СССР реорганизована в Высшую школу НКВД СССР.

За ней закрепляются два вида обучения — переподготовка и повышение квалификации кадров оперативных отделов НКВД. Высшая школа НКВД стала ведущим учебным заведением, готовящим кадры для руководящей работы в органах государственной безопасности.

К февралю 1941 года, к моменту разделения единого союзно-республиканского НКВД на Наркомат государственной безопасности — НКГБ и НКВД, 30 % руководителей республиканских наркоматов, а также краевых и областных управлений НКВД были выпускниками Высшей школы.

В первые дни Великой Отечественной войны, Приказом наркома внутренних дел СССР была создана Особая группа при НКВД, которой поручалась организация разведывательно-диверсионной работы и партизанской войны в тылу немецко-фашистских войск.

Уже 26 июня в специальный отряд при этой группе было откомандировано 140 слушателей основного отделения Высшей школы. 16 октября 1941 года отряд был преобразован в Отдельную мотострелковую бригаду особого назначения — ОМСБОН.

За годы войны шестеро выпускников Высшей школы были удостоены звания Героя Советского Союза — Медведев, Молодцов — посмертно, Рабцевич, Лягин — посмертно, Жидков и Мирковский.

Высшая школа НКВД внесла значительный вклад в разгром немецко-фашистских оккупантов. За период Великой отечественной войны в Высшей школе было подготовлено 7135 человек для работы в различных подразделениях органов безопасности.

За заслуги в подготовке чекистских кадров в годы Великой Отечественной войны, 30 августа 1945 года. Высшая школа НКВД Указом Президиума Верховного Совета СССР была награждена Красным Знаменем и Грамотой.

Собственно говоря, сама Высшая школа как специальное высшее учебное заведение с трехгодичным сроком обучения слушателей по программе юридических вузов страны, была образована в соответствии с Постановлением Совета Министров СССР от 15 июля 1952 года, а в апреле 1954 года первые 189 выпускников получили дипломы нового вуза, причем 37 из них окончили ее с отличием.

В 1954 году численность переменного состава — слушателей Высшей школы была установлена в 600 штатных единиц. На учебу направлялись абитуриенты, имевшие стаж не менее трех лет работы в органах госбезопасности, отвечавшие требованиям для поступления в ВУЗы страны.

Начало 1960 года было отмечено существенными изменениями в системе подготовки кадров для органов государственной безопасности. В Высшей школе Комитета государственной безопасности при Совете Министров СССР были образованы новые факультеты: технический, иностранных языков и военный.

Высшая школа КГБ при СМ СССР стала крупным многопрофильным высшим учебным заведением. Постановлением Совета Министров СССР от 2 августа 1962 года Высшей школе КГБ при СМ СССР было присвоено имя Ф.Э. Дзержинского.

В 1992 году Высшая школа вступает в новый этап своего развития. В соответствии с Указом Президента Российской Федерации от 24 августа 1992 года на базе Высшей школы им. Ф.Э. Дзержинского и Академии пограничных войск была образована Академия Министерства безопасности Российской Федерации.

Сегодня, после ряда изменений в структурах государственной власти России, это высшее учебное заведение преобразовано в Академию ФСБ России.

Переход Академии на обучение по образовательным стандартам высшего профессионального образования позволил гарантировать необходимый уровень и качество образования, реализовать ведомственные квалификационные требования к специалистам, подтвердил право Академии на выдачу выпускникам дипломов государственного образца.

В 2003 году представительная комиссия Миноборонауки России, с привлечением ведущих специалистов ведомства, провела аттестационную экспертизу Академии.

Итогом работы комиссии стал вывод о том, что в Академии сложился современный образовательный комплекс, реализующий профессиональные образовательные программы высшего, послевузовского и дополнительного профессионального образования. Качество подготовки специалистов отвечает всем предъявляемым требованиям.

В настоящее время Академия является многопрофильным высшим учебным заведением, закономерный престиж которого среди университетов и академий России обусловлен высоким профессиональным мастерством профессорско-преподавательского состава, уровнем организации и руководства учебным процессом.

Итогом деятельности Академии было и остается постоянное пополнение спецслужб России высококвалифицированными специалистами практически по всем направлениям деятельности.

Кого же сегодня готовят в стенах академии? В первую очередь, — оперативных работников, следователей, переводчиков, математиков, инженеров, специалистов по защите информации для ФСБ и других спецслужб и органов.

Примерно за год до поступления, то есть в конце 10-го класса, или во время летних каникул, не позже, кандидат на поступление должен обратиться в территориальный орган ФСБ по месту жительства.

Если говорить о Московском регионе — Московское управление ФСБ или Центральный аппарат. В течение года кандидат на учебу должен пройти военно-врачебную комиссию, проверку на профпригодность с точки зрения его личностных качеств, физического, психического, психологического состояния. Если прошел все проверки, — можно сдавать экзамены.

В Москве сдают экзамены только жители Московского и ближайших регионов. Для всех территориальных органов выделяется определенная квота, и вступительные экзамены, как и конкурсный отбор, проводятся непосредственно на месте. Ребята из регионов прибывают в Академию уже в качестве слушателей.

Экзамены сложные. Человек с уровнем ниже среднего в Академию, безусловно, не поступит. Необходимы твердые знания по русскому и иностранному языкам, по истории, обществознанию.

Те, кто идет по линии связи и информатики, — должны быть подготовлены на уровне абитуриентов мехмата МГУ. В Академии очень тяжелый процесс обучения, скидок никому не дается, и выдерживает только тот, кто имеет хорошую базовую подготовку и действительно занимается. Зато и специалисты получаются качественные.

За минувшие годы Академия прошла большой и славный путь, стала многопрофильным высшим учебным заведением Федеральной службы безопасности Российской Федерации.

Качество подготовки специалистов в Академии обусловлено высоким профессиональным уровнем профессорско-преподавательского состава и широким внедрением в учебный процесс достижений науки.

На кафедрах специальных дисциплин, юридического и гуманитарного циклов — трудятся лауреаты Государственной премии Российской Федерации, заслуженные деятели науки, заслуженные юристы, кандидаты, доктора наук.