Есть свидетельства, что Сталин не смог сдержать гнев, когда увидел среди встречавших его на вокзале в Ленинграде представителей ОГПУ. Говорили, что он не то грубо отругал встретившего его Ф.Д. Медведя, не то даже ударил его по лицу. Правда, в дальнейшем Сталин старался контролировать свои эмоции. Об этом свидетельствует его спокойное поведение на предварительном следствии в Ленинграде, допросах Николаева. И все же было очевидно, что убийство Кирова застало его врасплох, так как не укладывалось в его представления о том, как должна развиваться политическая борьба в СССР. Поэтому Сталин пытался подогнать данные следствия под свои представления о классовой борьбе в СССР и идейно-политическом перерождении партийной оппозиции, что проявилось в написанном им «закрытом письме ЦК ВКП(б)» – «Уроки событий, связанных с злодейским убийством тов. Кирова».
Поскольку убийство совершил не кулак или нэпман и не гражданин иностранной державы, а член ВКП(б) Л. Николаев, Сталин обратил особое внимание на то, что у Леонида Николаева есть брат Петр, который «дважды дезертировал из Красной Армии» и якобы «якшался… с открытыми белогвардейцами». Из этого делался сомнительный вывод о том, что «Петр Николаев представлял законченный тип белогвардейца». Сведения о том, что Л. Николаев укрывал брата на своей квартире, послужили основой для другого скоропалительного вывода о том, что «между открытым белогвардейцем Петром Николаевым и братом его Леонидом Николаевым, членом зиновьевской группы в Ленинграде, а впоследствии убийцей тов. Кирова, не осталось никакой разницы». Из этого делался другой сомнительный вывод о том, что «Леонид Николаев задолго до убийства тов. Кирова был уже врагом партии и белогвардейцем чистой воды».
Эти сомнительные выводы сопоставлялись с фактами о том, что брат одного из лидеров зиновьевской оппозиции Владимира Румянцева Александр служил в армии Юденича. А из судеб братьев Румянцевых и Николаевых делалось заключение с огромной логической натяжкой о том, что «зиновьевская группа с ее ненавистью к партийному руководству и двурушничеством в партии… могла состряпать для этих выродков «подходящую» идеологию, могущую служить «оправданием» их белогвардейских дел».
В то же время стремление Сталина обратить внимание на окружение Николаева было обоснованным. Зная историю революционного террора, Сталин мог заподозрить, что сама мысль об убийстве Кирова возникла у Николаева под влиянием его окружения, точно так же, как мысль о покушении на жизнь Александра II появилась у Каракозова под воздействием зажигательных призывов к расправе с царем в революционной организации ишутинцев. Поскольку следствие утверждало, что в окружении Николаева были зиновьевцы, Сталин имел основание считать их ответственными за провоцирование убийцы.
О том, что оппозиция могла быть причастна или по меньшей мере заинтересована в этом убийстве, свидетельствовало то, что Троцкий расценил «убийство Кирова, умного и безжалостного ленинградского диктатора», как признак кризиса власти Сталина. В «Бюллетене оппозиции» Троцкий философствовал: «Как и в царское время, политические убийства являются безошибочным симптомом грозовой атмосферы и предсказывают начало открытого политического кризиса».
Еще в ходе следствия в Ленинграде Сталину показали записку о деятельности зиновьевской группы, подготовленную работниками НКВД в середине 1934 года. Авторы записки просили у Кирова дать им санкцию на арест членов группы, но Киров ответил им отказом. Теперь членов этой группы арестовали по обвинению в подготовке антиправительственного заговора. Выбор зиновьевцев в качестве основной мишени вряд ли был случайным. Как бывший сторонник Бухарина Ягода был давним противником Зиновьева и Каменева. Он имел основание и лично ненавидеть Каменева. Известно, что Каменев распространял запись своей беседы с Бухариным 1928 года, из которой следовало, что Ягода является надежным сторонником Бухарина.
На основе данных следствия вместе с Николаевым судили членов так называемого «ленинградского центра» зиновьевцев во главе с бывшим секретарем Выборгского райкома ВЛКСМ И.И. Котолыновым. Все подсудимые были приговорены к смертной казни за участие в террористическом заговоре с целью уничтожить руководителей партии. Приговор был приведен в исполнение 29 декабря. Позже по делу «ленинградской контрреволюционной зиновьевской группы Сафарова, Залуцкого и других» было привлечено 77 человек, в том числе 65 членов ВКП(б).
Однако состоявшийся 15—16 января 1935 года в Ленинграде процесс по делу «московского центра» зиновьевцев не увенчался столь же суровым приговором, как в отношении Николаева и его подельников, несмотря на то, что во время процесса по всей стране проходили митинги, на которых выдвигались требования о расстреле обвиняемых. Зиновьев был приговорен к 10 годам заключения, Каменев – к5. Приговор гласил: «Судебное следствие не установило фактов, которые давали бы основание квалифицировать преступления зиновьевцев как подстрекательство к убийству С.М. Кирова». Приговор соответствовал оценке Сталина роли Зиновьева и Каменева, изложенной в написанном им «закрытом письме ЦК ВКП(б)»от 18 января 1935 года – «Уроки событий, связанных со злодейским убийством тов. Кирова».
С одной стороны, в письме подчеркивалось, что «зиновьевцы ради достижения своих преступных целей скатились в болото контрреволюционного авантюризма, в болото антисоветского индивидуального террора, наконец, – в болото завязывания связей с латвийским консулом в Ленинграде, агентом немецко-фашистских интервенционистов». С другой стороны, указывалось, что «московский центр» «не знал, по-видимому, о подготовлявшемся убийстве т. Кирова». Судя по всему, Сталин в это время убедился, что нет оснований признать Зиновьева и Каменева ответственными за убийство Кирова.
Кроме того, в первых же строках письмо ЦК обвиняло лидеров «московского центра» не в терроризме, а в карьеризме: «Их объединяла одна общая беспринципная, чисто карьеристская цель-добраться до руководящего положения в партии и правительстве и получить во что бы то ни стало высокие посты». Таким образом, Сталин видел в убийстве Кирова прежде всего проявление острой борьбы за власть в стране. В то же время вряд ли можно было считать, что убийство Кирова расчистило бы Зиновьеву и Каменеву путь к высоким постам. Очевидно, что от убийства Кирова выгадывали лица из нынешних партийных верхов. Однако Сталин, видимо, не был готов предъявить подобные обвинения кому бы то ни было из высшего руководства в стране, а потому удары наносились по давно поверженным оппозиционерам.
В письме Сталин обращал внимание на утрату бдительности членами Ленинградской партийной организации. Таким образом, критике подвергался посмертно и сам Киров, который не придал должного значения ни сообщениям о задержании Николаева, ни записке о подпольной деятельности зиновьевцев. Сталин обвинял членов Ленинградской парторганизации в «опасном для дела» благодушии, «недопустимой для большевиков» халатности. В письме вновь повторялся известный тезис Сталина об усилении сопротивления классовых врагов по мере укрепления социализма: «Партия уже давно провозгласила, что чем сильнее становится СССР и чем безнадежнее положение врагов, тем скорее могут скатиться враги – именно ввиду их безнадежного положения – в болото террора, что ввиду этого необходимо всемерно усиливать бдительность наших людей. Но эта истина осталась, очевидно, для некоторых наших товарищей в Ленинграде тайной за семью печатями». Очевидно, что эти заявления были обращены не только к Ленинградской парторганизации.
То обстоятельство, что члены Ленинградской парторганизации не замечали появления в их городе групп, в которых рождались террористы и убийцы, что сам руководитель парторганизации отмахивался от предупреждений об опасности терроризма, Сталин расценил как вопиющую беспечность коммунистов. После же убийства Кирова Сталин стал свидетелем не только искренней скорби миллионов людей, но и злорадства многих, увидевших в этом событии сигнал для выступления против существовавшего строя. В сводках НКВД из так называемого «смоленского архива» (материалах государственных учреждений Смоленской области, вывезенных в ходе войны в Германию, а затем в США) сообщалось о студенте, который говорил: «Сегодня убили Кирова, завтра убьют Сталина». В смоленской деревне распевали частушку, в которой говорилось, что за убийством Кирова последовала отмена карточек, а за убийством Сталина последует роспуск колхозов. Получая эту информацию, Сталин приходил к выводу, что питательная среда для появления новых Николаевых сохраняется, а поэтому выступал за принятие самых жестких мер по разгрому «гнезд неразоружившихся врагов».