Объем всех ремонтных работ в ВМФ в ходе войны вырос в 1,5–2 раза по сравнению с мирным временем. Потребность флотов и флотилий во всех видах ремонта из месяца в месяц возрастала в связи с большим напряжением боевых действий корабельных сил, морской авиации и береговой артиллерии, наличием боевых и аварийных повреждений, а также износом корпусов и механизмов, перевооружением кораблей и дополнительной установкой на них нового вооружения и технических средств. Так, в течение войны корабли ВМФ два раза меняли зенитную артиллерию, оснащались радиолокационными станциями, новой гидроакустической аппаратурой, радиостанциями, неконтактными тралами и другой новой техникой. В то же время потеря основных судоремонтных предприятий на Черном и Балтийском морях, блокада Ленинграда вызвали сокращение производственных мощностей тыла Черноморского и Краснознаменного Балтийского флотов, а налеты авиации противника на действующие ремонтные предприятия тормозили выполнение ремонтных работ.

В начале войны был принят ряд важных решений по обеспечению ВМФ судоремонтом и ремонтом вооружения. В июле 1941 г. ЦК ВКП(б) и Совет Народных Комиссаров обязали Наркоматы судостроительной промышленности, морского и речного флота, Главное управление Северного морского пути производить ремонт кораблей ВМФ на своих предприятиях в первую очередь Указом Президиума Верховного Совета СССР от 14 июля 1941 г. было утверждено Положение об использовании для военных нужд гражданских судов, портов, пристаней и других сооружений водного транспорта, в том числе и для ремонта кораблей. Это положение распространялось и на судоремонтные предприятия гражданских ведомств и организаций. Наркомат ВМФ имел право использовать эти предприятия для всех видов ремонта боевых кораблей и вспомогательных судов. Осенью 1941 г. все судоремонтные предприятия других наркоматов, находящиеся в Мурманске, решением Советского правительства были оперативно подчинены Военному совету Северного флота, который руководил их работой через технический отдел флота. В мае 1943 г. один из судоремонтных заводов Мурманска полностью перешел в ведение ВМФ. Эти меры имели исключительно важное значение для расширения возможностей судоремонта и ремонта вооружения сил флотов и военных флотилий.

Техническое управление ВМФ и органы тыла флотов принимали все меры для расширения производственных мощностей, усиления ремонтных предприятий. Во всех военно-морских базах и во многих соединениях флотов для текущего и мелкого ремонта кораблей и вспомогательных судов были созданы судоремонтные мастерские, расширена местная ремонтная база. Ко всем ремонтным работам привлекался личный состав кораблей и частей. В суровую блокадную зиму Ленинграда почти весь ремонт боевых кораблей и береговых батарей Краснознаменного Балтийского флота был выполнен их личным составом с использованием оборудования, инструмента, материалов и запасных частей ленинградских заводов.

Недостаток производственных мощностей судоремонтных предприятий вынуждал органы тыла флотов до минимума сокращать плановые ремонты, уделяя главное внимание ремонту аварийных боевых кораблей и ремонту в межоперационный период. В задачу этого ремонта входило максимальное поддержание боевых кораблей и вспомогательных судов в технически исправном состоянии. Во время ремонта аварийных боевых кораблей по возможности производился ремонт всех механизмов. В районах, где замерзали акватории, основной объем текущего ремонта планировался на зимний период. В навигационный период ограничивались только неотложным ремонтом.

В ходе продолжительных операций сил флота важное значение приобретал срочный ремонт кораблей на военно-морских базах. Например, при высадке десанта в порту Новороссийск в сентябре 1943 г. повреждения катеров, полученные ночью, устранялись в течение дня судоремонтной мастерской в Геленджике, и следующей ночью эти катера снова выходили на боевое задание. В ходе наступательных операций на приморском направлении ремонт кораблей и вооружения передовых соединений флота осуществлялся подвижными силами и средствами.

Героическими усилиями судоремонтников и личного состава флотов обеспечивалась высокая боевая способность кораблей ВМФ. Нередко даже сильно поврежденные корабли восстанавливались и вводились в строй в очень короткие сроки. Судоремонтники Кронштадта и Ленинграда вернули в строй даже ряд подорвавшихся на вражеских минах, затонувших и поднятых кораблей. В течение всей войны только на трех действующих флотах было отремонтировано 8815 боевых кораблей и вспомогательных судов, в том числе на Северном флоте — 2949, Краснознаменном Балтийском — 4357, Черноморском (до 1 сентября 1944 г.) — 1509⁵³³. Это был большой вклад судоремонтников ВМФ, Наркомата судостроительной промышленности и других наркоматов в обеспечение боевых действий сил флотов. В условиях ограниченных возможностей постройки новых боевых кораблей и вспомогательных судов ремонт их в годы войны являлся важнейшим средством сохранения корабельного состава.

Вторым по объему и сложности видом ремонтных работ на флотах и флотилиях являлся ремонт артиллерийского вооружения, занимавший 10,4 процента всех ремонтных работ. Трудности его объяснялись наличием значительного количества громоздких орудий тяжелого калибра (от 180- до 406-мм), сложностью устройства артиллерийских систем, их энергетического хозяйства, особенно автоматических приборов управления стрельбой, а также необходимостью производства работ непосредственно на кораблях (батареях). Нередко ремонт артиллерийского вооружения выполнялся в непосредственной близости от линии фронта, под огнем противника, что требовало высоких темпов работ, большого напряжения сил, мужества воинов-ремонтников и личного состава орудийных расчетов. Например, в Севастополе в период напряженных боев была произведена вручную замена стволов 305-мм орудий на башенных батареях № 30 и № 35. Новые стволы на батарею № 35 перевезли (на 1,5 км) с помощью опорных тележек козлового крана. Подъем старых стволов из люльки, погрузка и съемка с тележки, укладка в люльку новых стволов производились при помощи домкратов. Батарея № 30 находилась в 1,5–2 км от линии фронта, под обстрелом противника. С помощью тракторов и домкратов орудийные стволы сменили в течение 16 суток — в два раза быстрее, чем в обычных условиях с помощью крана. За успешное выполнение этих работ на батарее № 30 восемь человек были награждены орденами⁵³⁴. Такой же трудовой героизм и находчивость проявили ремонтники при восстановлении одной из береговых батарей форта «Ф» около Ораниенбаума в октябре 1941 г. и в других местах.

Большой объем ремонтных работ выполняли мастерские складов минно-торпедных отделов флотов. В 1943–1944 гг. ежемесячно на каждом флоте ремонтировалось 100–200 торпед. За годы войны мастерские трального склада № 189 Балтийского флота изготовили 5305 комплектов различных тралов и 37 тыс. запасных узлов к ним, отремонтировали 14 тыс. комплектов поврежденных тралов и 62 тыс. узлов к ним⁵³⁵.

В ходе боевых действий интенсивно использовалась морская авиация. На трех действующих флотах в течение всей войны она произвела 346 817 самолето-вылетов. Потребовалось организовать массовый ремонт авиационной техники и вооружения.

Эту задачу выполняли полевые авиаремонтные мастерские в частях и ремонтные базы военно-воздушных сил флотов. В отдельных случаях оказывали помощь ремонтные предприятия ВВС Советской Армии. Наиболее массовый текущий ремонт самолетов и авиационных моторов в войсковом тылу выполняли подвижные авиационные мастерские, которые имелись в каждой авиационной базе. Их количество в авиации ВМФ за время войны увеличилось в 3 раза. Общий объем работ по ремонту самолетов и авиационной техники в ВМФ составлял 4,9 процента всего объема ремонтных работ⁵³⁶.