Дальнейшее развитие специализации и кооперирования производства в военной промышленности способствовало внедрению высокопроизводительного оборудования, снижало его потери и простои, стимулировало рост производительности труда. Специализация дала возможность рассредоточить промышленность по территории страны.

В те годы развивались формы предметной, подетальной, поузловой и технологической (производство литья, поковок и т.д.) специализации.

В авиационной промышленности имелись группы заводов, занятых производством самолетов, и группы заводов, выпускавших моторы. В отдельную группу были выделены заводы, производившие узлы и детали самолетов: агрегаты, винты, колеса, электро- и радиооборудование, приборы зажигания, авиационные приборы и т.д. Были созданы также специализированные заводы по производству вооружения для самолетов, резиновых и лакокрасочных изделий, изделий из стекла.

Большое развитие в авиационной промышленности получило кооперирование. Предприятия авиационной промышленности получали от специализированных заводов разные полуфабрикаты: литье, поковки, штамповки, арматуру, баки и т.п. Специализировавшиеся на выпуске отдельных узлов или агрегатов предприятия в свою очередь имели кооперированные связи с заводами, специализировавшимися на выпуске более мелких узлов и деталей. Например, моторостроительные предприятия получали в порядке кооперации от других заводов карбюраторы, регуляторы оборотов, бензонасосы, магнето и т.д. Часто головные заводы по существу становились сборочными заводами, так как выпускали готовую продукцию из сборных узлов и полуфабрикатов, полученных от других предприятий.

Большие возможности для специализации и кооперирования имелись в промышленности боеприпасов. К производству отдельных узлов и деталей боеприпасов были привлечены многие предприятия самых различных отраслей промышленности — тяжелого и среднего машиностроения, станкостроения, черной металлургии, цветной металлургии, бумажной, лесной, пищевой, текстильной и местной промышленности, Наркомата путей сообщения и т.д. До войны они изготовляли гражданскую продукцию. Если в 1941 г. боеприпасы производили 382 предприятия 34 наркоматов и ведомств, то в 1942 г. — уже 1108 предприятий 58 наркоматов и ведомств.

Существовала и такая форма кооперации: гражданские заводы получали от военных заводов заготовки и полуфабрикаты для производства различных деталей, обрабатывали и собирали их, а затем собранные узлы направляли на комплектование военным заводам.

Развитию специализации во многом способствовало то обстоятельство, что военная промышленность выпускала продукцию массового производства, которое открывает большие возможности для расширения и углубления предметной специализации, сокращения ассортимента продукции, производимой отдельными предприятиями.

Характерной особенностью организации промышленного производства в годы войны было внутрирайонное кооперирование. Особенно широкое развитие такая форма кооперирования получила в районах, непосредственно прилегающих к фронту, и в прифронтовой полосе. Например, ленинградские предприятия в условиях блокады были вынуждены ограничить территориально-производственные связи рамками своего города. В таком же примерно положении оказалась и Москва в октябре 1941 г., когда враг находился на ближайших подступах к столице и вследствие этого ее связи с другими районами страны были крайне ограниченными. В этот тяжелый период много инициативы в изыскании возможностей для осуществления производственной кооперации в Москве и Московской области проявил Московский автомобильный завод. На ряде предприятий он организовал производство комплектующих деталей для танков, которые раньше выпускали предприятия других областей. Например, на Щелковском заводе, в пригороде Москвы, стали изготовлять гранитоль.

Внутрирайонное кооперирование развивалось и в тыловых районах. Транспортные затруднения, необходимость быстрого получения деталей и узлов в порядке кооперации потребовали организовать производство тех или иных боевых средств в пределах области и даже одного города, так как существовавшие до войны территориально-производственные связи были нарушены. Заводам, эвакуированным на восток, приходилось создавать их заново. Конечно, в первую очередь выбор падал на близлежащие заводы, которые находились в черте города или в пределах области. Именно такого рода кооперированные связи создавались в Поволжье, Сибири и Казахстане.

Особенно большое развитие получила эта форма кооперации на Урале, который в годы войны стал подлинным арсеналом Красной Армии. В рапорте уральцев Центральному Комитету партии говорилось: «На боевые уральские машины мы ставим нами же произведенные пушки, моторы, подшипники, свою электропроводку, радиоаппаратуру, резину техническую, пластмассовые изделия. Все это мы научились вырабатывать у себя на Урале».

Расширение внутрирайонных связей явилось существенной чертой советской экономики на протяжении всех военных лет. В условиях войны была создана по существу новая система территориально-производственных связей, которая характеризовалась усилением кооперирования в рамках экономического района, области и одного города. Война стимулировала начавшийся накануне войны процесс возрастания роли внутрирайонного кооперирования и комплексного развития целых экономических районов.

Существенной особенностью взаимоотношений заводов-заказчиков с заводами-поставщиками было повышение производственной дисциплины предприятий в выполнении кооперированных поставок. В этом деле поставщики проявляли чувство высокой ответственности, принимали самые решительные меры для того, чтобы все заказы выполнить в установленные сроки.

Большой вклад в развитие военной экономики внесли научные учреждения страны. Интенсивному росту научных исследований в годы войны во многом способствовал высокий уровень развития в СССР технических наук, математики, физики, химии.

Важную работу, связанную с перестройкой промышленности Урала на военный лад, выполняла созданная в сентябре 1941 г. Комиссия по мобилизации ресурсов Урала, которую возглавил президент Академии наук СССР академик В. Л. Комаров. В работе этой Комиссии принимали активное участие виднейшие ученые Советского Союза — академики А. А. Байков, И. П. Бардин, Э. В. Брицке, В. А. Обручев и другие, более 800 работников науки и техники, около 60 научных учреждений и организаций. Благодаря напряженным научным поискам этого большого творческого коллектива были разработаны и внедрены в производство новые технологические приемы, способствовавшие созданию и массовому выпуску более совершенной военной техники.

Одним из эффективных результатов научных исследований явилось внедрение на металлургических заводах Магнитогорска, Кузнецка и других городов Урала технологии скоростной плавки металла в мартеновских печах, производства сложных профилей проката для танков, изготовления труб для минометов различных систем. Широкое применение в промышленности нашла разработанная учеными технология производства заменителей дефицитного сырья и материалов. Ее внедрение дало большую экономию таких дорогостоящих стратегических металлов, как никель и молибден. Найденные заменители кокса для литейных цехов машиностроительных заводов позволили избежать дальних перевозок кокса и высвободить таким образом большое количество вагонов, в которых ощущался острый недостаток.

Потеря ряда важных сырьевых районов и необходимость их компенсировать путем вовлечения в хозяйственный оборот новых ресурсов заставляли форсировать поиск новых источников сырья. Особенно остро нуждалась в них перебазированная на восток промышленность. Уже в первые месяцы войны геологические партии обнаружили новые месторождения железной и других руд, нефти, бокситов. Так, при участии ученых-геологов А. Е. Ферсмана, К. И. Сатпаева и других были найдены новые месторождения железной руды в Кузбассе и на Урале, новые запасы нефти в Башкирии, большие залежи бокситов на восточных склонах Урала, месторождения молибденовых руд в Казахстане и др.