Обнаружив Х-6, а затем Х-7 и поняв, что в атаке участвуют несколько лодок, командир «Тирпица» решил сменить место стоянки. Однако вскоре почти одновременно раздались два взрыва, а через полтора часа 500 тонн воды уже затопили два турбинных отделения линкора. Все три главные турбины вышли из строя, было повреждено почти все электрическое оборудование. До весны 1944 года линкор простоял в Альтен-фьорде, после чего вернулся в состав действующего флота, продолжая представлять собой потенциальную опасность для конвоев союзников. Англичане не успокоились, решив раз и навсегда разделаться с «Тирпицем». 3 апреля самолеты с авианосцев «Викториес» и «Фьюриес» добились полутора десятков попаданий в линкор бомб по полтонны каждая, и он снова вышел из строя. Затем его периодически атаковали бомбардировщики с береговых аэродромов.

15 сентября в его носовую часть попала шеститонная бомба. После этого «Тирпиц» был переведен в Тромсё-фьорд, где 12 ноября 1944 года 29 самолетов типа «Ланкастер» в последний раз атаковали линкор, похоронив его на дне.

Но все это будет позже, а тогда, в 43-м году, положение для немцев в Заполярье еще более осложнилось из-за все растущей нехватки самолетов и применения противником радиолокационных установок, жертвой которых пал еще один линкор — «Шарнхорст».

После выхода из строя «Тирпица» угрозу конвоям на северных путях кроме подводных лодок и авиации представлял еще линкор «Шарнхорст», находившийся в северных норвежских шхерах с марта 1943 года. Временами там появлялись и другие германские большие корабли. Англичане опасались их, поэтому кроме усиленного эскорта их конвои прикрывала эскадра крупных кораблей. Ноябрьский конвой из 72 транспортов прибыл по назначению без потерь, так же как и конвой, шедший в обратном направлении.

В конце декабря 43-го года в море снова должны были выйти два конвоя: один из 19 транспортов, 14 эсминцев, двух шлюпов и тральщиков — из Лох-Ю в Мурманск, другой из 22 транспортов, восьми эсминцев и шести других кораблей охранения — из северных советских портов в Англию. В качестве общего их эскорта в северных водах находилась английская эскадра в составе крейсеров «Белфаст», «Шеффилд», «Норфолк» и 14 эсминцев. Эскадра прикрытия состояла из линкора «Дьюк оф Йорк», крейсера «Ямайка» и четырех эсминцев.

Командование Кригсмарине не имело сведений о конвое, следовавшем из советских портов, но знало о выходе конвоя из Англии в Советский Союз. Выполняя требование Гитлера, Дениц отдал приказ «Шарнхорсту» и пяти эсминцам атаковать этот конвой при уверенности в успехе, а также увеличить число подводных лодок, действующих в северных водах.

Германские самолеты обнаружили конвой в районе Фарерских островов, после чего днем 23 декабря его безрезультатно атаковали пять бомбардировщиков. 25 декабря подводная лодка U-601 обер-лейтенанта Отто Хансена, находившаяся к югу от острова Медвежий, тоже обнаружила конвой и в течение пяти часов безрезультатно преследовала его, пока корабли охранения не загнали ее на глубину. U-601 навела на конвой U-716 обер-лейтенанта Ханса Дункельберга, но и последняя также была отогнана. Ожидая новых нападений противника, командующий эскадрой прикрытия адмирал Фрезер приказал второму конвою следовать севернее острова Медвежий. Преодолев там ледовый покров, этот конвой благополучно прибыл в английские порты.

«Шарнхорст» был потоплен 26 декабря 1943 года во время нападения на следующий конвой, охранявшийся тремя крейсерами и многочисленными эсминцами. О выходе «Шарнхорста» англичане знали заранее. Корабли охранения не допустили приближения его к конвою и вошли с ним в боевое соприкосновение, когда он попытался уйти. Тогда же «Шарнхорст» атаковали подоспевшие позже английские линкор «Дьюк оф Йорк» и крейсер «Ямайка». Британский линкор нанес германскому сильные повреждения, а после прямого попадания выпущенной с «Ямайки» торпеды «Шарнхорст» затонул.

В арктических водах сразу же после потопления «Шарнхорста» немецкое командование усилило флотилию подводных лодок, базировавшихся в норвежских портах, до 24 единиц. Лодки в этом районе продолжали действовать методом «волчьей стаи», развертываясь завесой между островами Медвежий и Ян-Майен. Обнаружив конвой, они атаковали его с разных сторон. После первой атаки лодки обгоняли конвой, и атака возобновлялась. Такая тактика была возможна в условиях полярного театра военных действий, а также вследствие тихоходности арктических конвоев. Дальнее охранение конвоев осуществляли авиация и ударно-поисковые группы кораблей, ближнее — эскортные корабли в круговом порядке. Задача противовоздушной обороны конвоя возлагалась на 1–2 крейсера. Большие конвои имели также эскадру прикрытия на случай появления германских надводных кораблей. В эскортировании в своей операционной зоне принимали участие корабли советского Северного флота. Кроме того, у берегов Норвегии развертывались советские подводные лодки. После уничтожения германскими лодками в январе 1944 года в районе острова Ян-Майен трех транспортов и эскортного корабля из состава конвоя, шедшего из Исландии, в конвои стали включать два эскортных авианосца с истребителями и противолодочными самолетами.

Германские подлодки продолжали шнырять в Северном Ледовитом океане и прилегающих морях. 26 августа 1944 года в окрестностях острова Диксон небольшое гидрографическое судно «Норд» было обстреляно германской подводной лодкой U-957 капитан-лейтенанта Герхарда Шаара, который, похоже, не хотел тратить торпеду. «Норд» передал радиограмму, и к Диксону подошел тральщик Т-116, которому поставили задачу отыскать «Норд» и подводную лодку. 1 сентября капитан-лейтенант В. А. Бабанов вышел на поиск, но только 5 сентября в Карском море в районе островов Мона он заметил характерный белый дымок, который бывает при зарядке аккумуляторов подлодкой. Сблизившись, тральщик засек цель гидролокатором, после чего провел несколько атак глубинными бомбами. Заметив перископ, советские моряки обстреляли место погружения субмарины из реактивного бомбомета. Раскаты взрыва сигнализировали о прямом попадании. На поверхности показались пятна масла и пробковая крошка. Туда же сбросили еще серию глубинных бомб — и из воды вырвались большие пузыри воздуха, какие-то тряпки, щепки и шкура белого медведя. Удивленные моряки бросились было ее ловить, но она утонула. Победителям достались только деревянная коробка от запасной катушки гирокомпаса и рваные штаны, которые упорно не хотели тонуть. Позже выяснилось, что пострадала совсем другая субмарина, оказавшаяся в зоне поиска в районе Краковки — U-362 обер-лейтенанта Людвига Франца из 13-й флотилии подводных лодок, экипаж которой, кроме охоты на белого медведя, похоже, больше ничего натворить не успел.

Иногда при обороне северных конвоев применялись ракеты с самолетов. При возвращении союзного конвоя JW-57 его прикрывал авианосец «Честер». В очень сложных метеорологических условиях бипланы «свордфиш» с открытыми кабинами, в которых летчики замерзали до окостенения, потопили три субмарины. 4 марта 1944 года самолет из 816-й эскадрильи повредил одну из германских лодок; потерявшую способность погружаться, ее добил английский эсминец. На другой день залпы ракет с самолета той же эскадрильи разнесли U-366 обер-лейтенанта Бруно Лангенберга, а 6 марта точно так же погибла U-973 обер-лейтенанта Клауса Пепенмёллера. Все эти лодки принадлежали группе «Хартмут», не одержавшей ни одной победы. Похоже, командиры лодок не имели достаточного опыта…

Движение конвоев не было сколько-нибудь заметно нарушено «волками» ни зимой 1944 года, ни в последнюю зиму войны. С августа 1944 по апрель 1945 года более 250 судов достигли русских портов и только два из них были потоплены.

К концу 1944 года Дениц потерял все 26 подводных лодок, действовавших в северных широтах. Несколько субмарин просто пропали без вести и погибли, очевидно, из-за больших трудностей навигации в ледовых условиях.

В Балтийской зоне немецкие лодки базировались на Киль — главную базу германского флота в Балтийском море, Гдыню, Пиллау, Данциг, Мемель, Хельсинки и на большое количество опорных пунктов на оккупированных территориях Дании и советской Прибалтики. Лодки этой зоны, служившей прежде всего в качестве тыловой, действовали главным образом в Балтийском море и частично в Атлантическом океане.