В 1394 г. другой францисканец – инквизитор Португалии и Альгарвы просил утверждения у Бонифация IX, исполнившего его просьбу. Не дошло никаких следов деятельности этих инквизиторов. Преемником их был доминиканец Винсент из Лиссабона. В 1399 г. Бонифаций, по просьбе короля, сделал Винсента инквизитором; о деятельности его также ничего не известно. Когда в 1418 г. была образована независимая доминиканская провинция в Португалии, то все провинциалы были в силу буллы Бонифация IX (1402 г.) последовательно и генерал-инквизиторами, и шли они непрерывным рядом до 1531 г., когда была основана новая инквизиция. Но не сохранилось ни одного упоминания об их действиях в качестве инквизиторов. В первых годах XVI в. Дон Маноэль, обеспокоенный положением новых христиан, т. е. перешедших из иудейства и ислама, добился от папы назначения инквизитора-францисканца, хотя в Португалии был доминиканский провинциал. Сведений о деятельности этого инквизитора не сохранилось.

Горячим католикам Португалии в начале XVI в. казалось необходимым устроить и у себя, подобно Испании, новую инквизицию ввиду многочисленности новых христиан, бежавших от испанского преследования. В 1515 г. Маноэль приказал своему посланнику в Риме обратиться к папе Льву X с просьбой о предоставлении португальской инквизиции тех же привилегий, которые были даны инквизиции в Кастилии. Но, однако, введение инквизиции по образцу испанской замедлилось на целых десять лет. Борьба, возникшая по поводу этого мероприятия, не принадлежит к эпохе Средних веков, и ее история выходит уже за пределы нашей работы.

В Италии ересь и политику по временам трудно бывает отделить друг от друга. Здесь в течение нескольких столетий притязания государства на верховную власть разбивались попытками пап распространить на всю Италию свою светскую власть. Церковь была поглощена мирскими делами. Во время борьбы пап с антипапами ересь беспрепятственно распространялась. Когда папы одерживали верх, то суровые эдикты против еретиков Луция III были приняты Генрихом VI в 1194 г. и Отгоном IV в 1210 г. Но так как все города были разбиты на партии, к ереси относились снисходительно и она могла даже участвовать в делах правления. Споры одного города с другим и папы с императором открыли широкое поле для дипломатических комбинаций, которыми еретики сумели воспользоваться. Когда при Гонории III, Григории IX и Фридрихе II были выработаны принципы преследования и соумышленники ереси были сравнены с еретиками, то партии и знатные, оказывавшие покровительство или терпимость в отношении еретиков, подверглись общей анафеме; населения целых областей были признаны впавшими в ересь, хотя в их глазах папы гибеллинов (сторонников императора) и еретики представлялись одним и тем же. Традиционная ненависть Милана к империи делала его абсолютно гвельфским (гвельфы – сторонники светской власти папы) городом, между тем он был всюду самым деятельным центром ереси.

В начале XIII в., по утверждению инквизитора Райнерио Сакконе, около двух третей всех катаров Европы было в Северной Италии, преимущественно в Ломбардии, откуда катаризм распространялся по всей Европе. Когда в 1236 г. Фридрих II приводил в повиновение восставших ломбардцев, он указывал папе, что жители Милана гораздо хуже сарацин и что покорение их гораздо важнее.

В некоторых округах число вальденцев не уступало числу катаров. В 1206 г. Иннокентий III старался изгнать этих еретиков из Фаэнцы. В Милане школа, где они открыто проповедовали свое учение, была разрушена архиепископом. Сожженные в 1212 г. в Страсбурге вальденцы заявляли, что глава их живет в Милане. Наиболее прочно вальденцы основались в долинах Коттийских Альп. В 1210 г. туринский епископ просил Оттона IV уничтожить ересь в своей епархии, но император посоветовал ему самому построже наказывать и изгонять виновных. Гонорий III добился в 1220 г. от Фридриха II Жестокого эдикта, дававшего возможность полного уничтожения ереси. Однако политика Фридриха II не позволяла ему порвать с вождями гибеллинов или усилить партию гвельфов. Поэтому на севере и в центре Италии его законы не исполнялись. Уже в 1221 г. один из наиболее могущественных гибеллинов Тревизской Марки, Эццелино да Романо, был обвинен в покровительстве еретикам; но он считал это выгодным для себя с политической точки зрения и продолжал действовать в том же духе. Когда в 1227 г. подестат Римини был обвинен гражданами за то, что сжег на костре как еретиков их дочерей и сестер и что хотел внести в городские законы указы Фридриха, то он обратился за поддержкой не к императору, а к папе Гонорию III. Пытаясь остановить распространение ереси, Гонорий отправил в 1224 г. епископов Брешии и Модены в Ломбардию для уничтожения еретиков. Это, в сущности, были инквизиторы. Это был первый шаг к устройству инквизиции. Делегаты начали с самой Брешии. Они приказали разрушить дома, в которых проповедовали еретические проповедники. Тотчас же вспыхнуло вооруженное восстание. Многие церкви были сожжены, и на их развалинах еретики провозглашали анафему всем членам римской Церкви; и только после долгой и кровопролитной борьбы католикам удалось победить их. Всем отлученным было приказано лично испросить прощение у Св. Престола. Укрепленные жилища сеньоров, которые стали во главе восставших, должны были быть снесены без права возобновления; остальные оказавшие сопротивление католикам крепости должны были быть разрушены на одну треть или на половину. Священники, родители которых были еретиками или соумышленниками ереси, отрешались от должности на три года или более, сообразно со степенью их участия в беспорядках. На духовенство Ломбардии и Тревизской Марки налагалась контрибуция на вознаграждение убытков, понесенных католиками. Муниципалитет Милана вступился за побежденных, и даже сами власти Брешии решили, что в интересах мира желательно смягчение наказания. 1 мая 1226 г. Гонорий поручил епископам уменьшить наказания по их усмотрению; однако доминиканцу, назначенному в 1230 г. епископом в Брешию, удалось вскоре внести в местные статуты законы, которыми в марте 1224 г. Фридрих определил, что еретики подлежат или сожжению на костре, или отрезанию языка, и епископ заставил даже подестата принести присягу на применение этих законов.

С восшествием на папский престол Григория IX в 1227 г. началась ожесточенная война против ереси. С благословения папы был заключен мирный договор между Фридрихом II и Ломбардской Лигой, одним из условий которого являлось уничтожение ереси. Папа потребовал от ломбардцев положить конец ереси; условия мирного договора должны были быть выполнены под угрозой кары Св. Престола. В Средней Италии Григорий признал пользу доминиканского ордена и заложил первые основания инквизиции во Флоренции. Но в 1231 г. он узнал, что ересь даже в самом Риме открыто заявляла о себе и привлекала к себе много священников и других лиц духовного звания. Первое аутодафе в Риме, о котором сохранилось воспоминание, было совершено сенатором Аннибальдо. Один из еретиков был сожжен,.другие осуждены на тюремное заключение. Григорий издал декреталий, легший в основу судопроизводства инквизиции, и от имени сенатора объявил применение суровых светских законов. Влиянию Григория следует приписать жестокое законодательство Сицилийских Конституций, опубликованных около этого времени, и Равеннских декретов, изданных в 1232 г. В 1228 г. папский легат добился от жителей Милана признания закона, предписывающего разрушение домов еретиков; светским властям приказывалось предавать в течение десяти дней смерти всех, кто будет осужден Церковью. Кардинал-легат в 1232 г. начал дело против еретиков в Бергамо; нескольких он заключил в тюрьму; но лишь только он удалился, граждане освободили еретиков из тюрьмы. Тогда легат отлучил весь город от Церкви. Григорий 3 ноября 1232 г. назначил инквизитора Ломбардии и поручил ему воссоединить город с Церковью, если население даст гарантии, что ересь будет уничтожена.

В 1233 г. кремонский инквизитор, доминиканец, приказал подестату Пьяченцы изгнать еретиков. Но с попустительства подестата еретики напали на священников, епископа и монахов. Один монах был убит; инквизитор и многие из его спутников были ранены. Григорий IX послал в Пьяченцу архидиакона с поручением отдать город под контроль католической партии и взять с него ручательство скорого уничтожения еретиков. В ответ вспыхнуло новое восстание, и были освобождены из тюрьмы заключенные. Тем не менее инквизитор в 1234 г. снова действует в Миланской области. Здесь один крупный феодал давал приют еретикам в своем замке близ Лоди. За это он был осужден на позорную епитимью. Месяц спустя инквизитор арестовал двух купцов и отобрал все их товары; но Григорий приказал освободить их, взяв с них огромный залог – две тысячи серебряных марок.