Около 1440 г. было открыто много еретиков – вальденцев и уиклефистов – инквизиторами и Арагона, и Валенсии. Одним из еретиков позволили воссоединиться с Церковью, других сожгли, как упорствующих.
Николай V в 1447 г. отделил инквизицию Каталонии от арагонской, а в 1459 г. было произведено новое разделение: генерал-министр доминиканцев преобразовал в самостоятельный трибунал барселонскую епархию.
Фердинанд Католик, занявший уже в 1474 г., по праву своей супруги Изабеллы, трон Кастилии, принял в 1479 г. корону Арагона. Влияние Фердинанда много содействовало восстановлению могущества арагонской инквизиции. При Фердинанде инквизиция Арагона действовала под управлением доминиканца.
Королевство Кастилии и Леона, занимавшее большую часть Пиренейского полуострова, не знало тяжести средневековой инквизиции; это государство пользовалось большей независимостью от Рима, чем все остальные в ту эпоху. Частные затруднения, которые создавало присутствие в Кастилии большого числа покоренных евреев и мавров, скорее осложнялись, чем разрешались инквизицией. Объединение Арагона и Кастилии под владычеством Фердинанда и Изабеллы и завоевание Гренады позволило королевской чете серьезно приняться за дело водворения силой единства веры. До этой поры, несмотря на доминиканские легенды, в Кастилии на практике не было инквизиции.
Между тем даже в таком отдаленном городе, как Леон, катаризму удалось пустить корни. Один катар был сожжен около 1218 г. в том месте, где сваливались все нечистоты. Много катаров изгнал епископ Родриго, умерший в 1232 г.
Открыв в 1236 г. еретиков в Валенсии, Фердинанд III приказал опалить им лица, и эта мера заставила их одуматься и просить прощение. Король часто требовал от своих подданных доставки дров для наказания не раскаявшихся еретиков.
Кодексы Альфонса Мудрого, первый из которых был издан в 1255 г., а второй лет десять спустя, считаются с инквизицией, упорядочивая светским законом отношения между Церковью и светской властью. Ересь подсудна духовным судам, и всякий гражданин мог донести о еретике своему епископу или его викарию; если будет установлено, что обвиняемый верит иначе, чем учит Церковь, его нужно постараться склонить к обращению и простить его, если он вернется в лоно Церкви; если же он будет упорствовать в заблуждении, то его должно выдать светскому судье. Если обвиняемый придерживался еретических взглядов и исполнял еретические обряды, то подлежал сожжению; не соблюдавший еретических обрядов должен быть изгнан или заключен в тюрьму до тех пор, пока не вернется к истинной вере; всякий сочувствующий ереси, но еще не сделавшийся верующим еретиком подвергался в пользу государственной казны штрафу, а в случае несостоятельности его наказывали пятьюдесятью ударами плети; имущество умерших еретиками или казненных переходило к их прямым наследникам католикам, а за неимением таковых – к ближайшему родственнику; если же совсем не было родственников католиков, то имущество мирянина переходило в казну, а духовного лица – Церкви; а если Церковь не требовала в течение года подобного имущества, то оно переходило в казну. Дети, лишенные наследства за свое исповедание ереси, получали обратно свои части, если приносили отречение. Осужденный за ересь не имел права занимать общественной или государственной должности, получать по духовным завещаниям, оставлять завещания, вести торговлю, быть свидетелем в суде. Дом, где дано было убежище странствующему еретическому миссионеру, отдавался Церкви, если в нем жил сам хозяин, а если он был в аренде, то владелец подвергался штрафу в десять ливров золотом или публичному наказанию кнутом. Если знатный будет укрывать еретиков в своих землях или замках и будет упорствовать в этом после года отлучения, то его имение или замок должны быть отобраны для короля; а если виновным будет простой человек, то и личность его и его имение предоставляются в полное распоряжение суверена.
Христианин, перешедший в иудейство или мусульманство, являлся еретиком и должен был быть сожжен; тому же наказанию подлежал и всякий, кто воспитывал ребенка в запрещенной вере. Но преследование мертвых имело давность до пяти лет после смерти.
Альфонс и его советники считали обязанностью государства охранять веру в ее чистоте, а Церкви предоставлялось только определить виновность обвиняемого. Каноническое право не применялось в Кастилии. По ее законодательству доминиканский провинциал не мог назначать здесь инквизиторов. Кастилия не знала инквизиции, и преследование ереси было там почти не известно.
В 1316 г. Бернар Ги Тулузский открыл в своем округе сектантов – дольчинистов, или псевдо-апостолов; от его преследований они бежали в Испанию. 1 мая 1316 г. Бернар писал всем прелатам и монахам Испании об отличительных чертах этой ереси и просил их хватать и наказывать этих еретиков. Епископ Компостелло уведомлял Ги, что схвачено пять лиц, отвечающих данным им приметам, и что они содержатся в оковах; при этом он спрашивал указаний, как надо судить их и какому наказанию подлежат они, если будут признаны виновными, «ибо,- добавлял он,- все это для нас дело совершенно новое».
В 1401 г. Бонифаций IX назначил инквизитором всей Испании доминиканского провинциала Винсента Лиссабонского (правда, к этому времени умершего) и предписал, чтобы все его издержки оплачивались епископами и чтобы ни один из высших лиц его ордена не имел права сместить его. Единственной ересью, упоминаемой в булле, является идолопоклонническое почитание растений, деревьев, камней, алтарей. Бонифаций в феврале 1402 г. предоставил на будущее время доминиканскому провинциалу Испании право назначать и отставлять инквизиторов или действовать самому в качестве таковых, пользуясь всеми привилегиями и властью, признанными канонами. Около этого же времени король Генрих III увеличил наказания, карающие ересь; половина имущества еретиков, осужденных духовными судьями, конфисковалась королевской казной.
В государстве видное место занимали обращенные евреи, которых подозревали в тайном исповедании иудейства. Иоанн II просил в 1451 г. папу Николая V дать для наказания этого вероотступничества некоторые полномочия, которыми предоставлялись бы инквизиторские привилегии. Николай охотно откликнулся и назначил инквизиторами епископа Осмы, его викария и схоластика из Саламанки.
Около 1460 г. отмечается отсутствие всякого преследования ереси. В 1464 г. собранные в Медине кортесы обратили на это внимание, но не поднимали даже вопроса о введении папской инквизиции в стране. Ограничились тем, что поручили строго разыскивать еретиков архиепископам и епископам. Короля Генриха IV просили оказать им содействие, чтобы можно было основательно обследовать всю подозреваемую область и чтобы все виновные были открыты, заключены в тюрьму и наказаны, а конфискованное имущество пошло в королевскую казну.
На другой день после восшествия на престол Фердинанда и Изабеллы (1474 г.) Сикст IV дал легату при испанском дворе все права инквизитора для преследования и наказания ложных христиан, которые и после крещения продолжали соблюдать иудейские обряды. Фердинанд и Изабелла, не желая допускать вмешательства легата во внутренние дела королевства, не дозволили ему воспользоваться властью, данной ему папой. В ноябре 1478 г. вышла булла Сикста IV об основании инквизиции в Испании, право папского вмешательства было низведено там до минимума.
В 1211 г., в начале своего царствования, Альфонс II Португальский проявил свое рвение к вере тем, что настоял на издании кортесами строгих законов о подавлении ереси; но когда первый доминиканский провинциал в Испании попытался ввести в Португалии инквизиторов из своего ордена, Альфонс отказался принять их и настоял, чтобы еретиков, как и прежде, судили обыкновенными епископскими судами. Буллой от 17 января 1376 г. Григорий XI предоставил Агапито Колонне, лиссабонскому епископу, назначить в виде исключения инквизитором францисканца, так как ересь сильно распространилась, а в королевстве не было инквизиторов. Вновь назначаемый инквизитор должен был получать ежегодное содержание в размере двухсот флоринов золотом, которые надлежало собирать со всех епархий в размере налога, взимаемого с каждой из них в пользу римской курии. Первым португальским инквизитором был Мартин Васкес.