К 22 июня 1941 г. генерал-майор Р. Я. Малиновский командовал 48-м стрелковым корпусом Одесского военного округа. Приграничные сражения в Молдавии с 22 июня по 26 июля 1941 г. (в немецкой военной историографии – операция «Мюнхен») разворачивались относительно благополучно для советских войск. Во-первых, атакующие силы немцев и румын (11-я немецкая армия – командующий генерал-полковник Ойген фон Шоберт, 3-я румынская армия – командующий корпусной генерал Петре Думитреску и 4-я румынская армия – командующий корпусной генерал Николае Чуперца, 4-й немецкий авиационный корпус – командир генерал-лейтенант Курт Пфлюгбейль) не смогли в этом регионе застать части Красной армии врасплох. Руководство Одесского военного округа еще до получения из Москвы в ночь на 22 июня директивы о приведении войск в боевую готовность распорядилось занять позиции на границе и рассредоточить авиацию по запасным аэродромам. Тогда же штаб округа был переведен в полевой командный пункт под Тирасполем.

Р. Я. Малиновский, 1945 год

Поступившая директива, среди прочего, гласила: «Задача наших войск – не поддаваться ни на какие провокационные действия, могущие вызвать крупные осложнения», однако войска Одесского округа были сразу подняты по тревоге.

А во-вторых, поначалу немцы отводили южному направлению второстепенную роль, предполагалось сковывать здесь советские силы, пока группа армий «Юг» не продвинется достаточно далеко в направлении главного удара по Украине. Румынскими войсками здесь руководил лично сам кондукэтор (вождь) Ион Антонеску. Интенсивное наступление в направлении Яссы – Бельцы началось утром 2 июля.

5 июля командующий Южным фронтом И. В. Тюленев без согласования с Москвой приказал отвести войска за Днестр и организовать оборону по линии укрепленных районов. Но Ставка разрешила отвести только правый фланг 18-й армии, приказав бросить остальные силы в контрнаступление.

Утром 8 июля 48-й стрелковый корпус, которым командовал Р. Я. Малиновский, вместе с другими частями атаковал наступающего противника. Генерал Ойген фон Шоберт даже запросил у начальства разрешения остановить наступление.

Отбросить немцев и румын обратно за реку Прут оказалось невозможно, но двое суток яростных встречных боев задержали две армии противника, позволив советской 18-й армии отойти в полном порядке и занять Могилев-Подольский укрепленный район.

В ходе отступления под натиском превосходящих сил противника Р. Я. Малиновский смог сохранить основные силы корпуса. В августе 1941 г. был назначен командующим 6-й армией. 9 ноября произведен в генерал-лейтенанты, а в декабре был назначен командующим Южным фронтом.

В январе 1942 г. войска Южного фронта в ходе Барвенково-Лозовской операции нанесли поражение немцам в районе Харькова и оттеснили их на 100 км. Подготовка к этой операции, проведенной силами Южного и Юго-Западного (командующий – Ф. Я. Костенко) фронтов, началась в первых числах января. Изначально планировалось прорвать оборону противника между Балаклеей и Артемовском, выйти в тыл донбасско-таганрогской группировки, прижать ее к берегу Азовского моря и уничтожить. Это означало, что Красной армии пришлось бы форсировать реку Северский Донец в невыгодных условиях, наступая с левого пологого берега на высокий берег, занятый противником, а именно – 17-й полевой армией под командованием Германа Гота. Кроме нее, в группу армий «Юг» входили 6-я армия Фридриха Паулюса и 1-я танковая армия Эвальда фон Клейста.

Утром 18 января войска Юго-Западного и Южного фронтов пошли в наступление на участке от Балаклеи до Славянска и прорвали оборону противника. К вечеру 23 января был взят город Барвенково, где тотчас был оборудован вспомогательный пункт управления наступающими войсками. Ожесточенные бои велись на берегах реки Самара, которую части Красной армии форсировали или пытались форсировать в нескольких местах. 4-я гвардейская (132-я) танковая бригада перерезала автодорогу Краматорск – Петропавловка. Точки активного сопротивления противника, если не удавалось подавить его сразу, старались окружить и обойти. В наступлении участвовали моторизованные, кавалерийские и пехотные части.

Причем, несмотря на очевидную значимость техники в этой войне, конники достаточно часто достигали успеха. Так, 27 января 34-я кавалерийская дивизия 5-го кавалерийского корпуса форсировала реку Бык и захватила село Криворожье, разгромив немецкую пехоту.

В связи с угрозой прорыва советских войск со стороны Лозовой Герман Гот перевел свой штаб из Павлограда в Красноармейское, где базировались значительные силы. А кому-то из руководства немецких частей пришлось и лично сражаться, подобно командиру 134-го полка 44-й пехотной дивизии Бойсу. «О том, насколько ожесточенные шли бои на этом участке фронта, – пишет военный историк из Германии П. Карелл, – свидетельствует тот факт, что полковник Бойс лично и его штаб неоднократно отбивались в ближнем бою с пистолетами и ручными гранатами. В конце концов русский лыжный батальон достиг важной дороги Балаклея – Яковенково на южном фланге боевой группы и закрепился в огромных соломенных скирдах. Бойс атаковал его со своим последним резервом, чтобы избавить боевую группу от смертельной опасности окружения. Русские не сделали ни шагу назад».

Д. И. Рябышев, который в это время командовал 57-й армией в составе Южного фронта, впоследствии писал в своей книге «Первый год войны»: «Наши войска освободили города Барвенково, Лозовая и более 400 населенных пунктов, нанесли врагу большие потери. Не считая того, что было уничтожено в ходе боев, войска захватили 658 орудий, 40 танков и бронемашин, 843 пулемета, 331 миномет, 6013 автомашин, 573 мотоцикла, 1095 велосипедов, 23 радиостанции, более 100 тысяч мин, около 80 тысяч снарядов, более миллиона патронов, свыше 23 тысяч ручных гранат, 430 вагонов с боеприпасами и военными грузами, 8 эшелонов с военно-хозяйственным имуществом, 24 склада с разными военными запасами, 2400 повозок, 2800 лошадей. При этом полностью были разгромлены 298, 68 и 257-я пехотные дивизии, 236-й противотанковый полк, 179-й пехотный полк 57-й пехотной дивизии, венгерский кавалерийский полк. Разгромлен штаб 257-й пехотной дивизии, и захвачены ее штабные документы, знамена 457-го и 516-го пехотных полков. Кроме того, нанесены значительные потери 44-й и 295-й пехотным дивизиям и некоторым частям 62, 46 и 94-й пехотных дивизий. За это время немцы потеряли свыше 25 тысяч убитыми, несколько тысяч фашистов попало в плен. В пехотных дивизиях гитлеровцев осталось от 30 до 50 процентов штатного состава».

Но в полной мере воплотить в реальность план операции советским войскам не удалось – окружение немецкой группировки не состоялось. Однако в этом районе были скованы значительные силы противника, в том числе и спешно переброшенные сюда подкрепления. Тем временем советское контрнаступление под Москвой успешно развивалось. Психологический эффект тоже оказался заметным. «Кое-кто из строевых офицеров был настроен мрачно, – писал в мемуарах полковник Адам из 6-й немецкой армии. – У многих солдат не осталось и следа от прежнего подъема, от веры в победу, воодушевлявшей их в первый год войны. Достоверно было одно: Гитлер и Главное командование сухопутных сил сознательно или невольно лгали, когда бахвалились перед всем миром, что Красная армия разбита. Разбитая армия не может без передышки атаковать в разных местах посреди зимы».

Спустя четыре месяца в ходе Харьковской операции советские войска под командованием Р. Я. Малиновского, понесшие большие потери, отступили от Харькова к Дону.

Еще в конце марта 1942 г., когда в Ставке проходило совещание, посвященное Харьковской наступательной операции, мнения о ее целесообразности разделились. Г. К. Жуков и Б. М. Шапошников были против, считая, что надо развить уже достигнутый успех Западного фронта. И. В. Сталин, поддержавший предложение командующего юго-западным направлением С. К. Тимошенко, дал указание считать операцию внутренним делом юго-западного направления и Генштабу в ее ход не вмешиваться. За проявленную на совещании «строптивость» Г. К. Жуков по приказу Ставки был понижен – из его подчинения был выведен Калининский фронт, а руководимое им западное направление было ликвидировано…