Оформление экспозиции заняло 20 дней. Семь студентов 1-го и 2-го курсов выполнили эту работу, среди них студенты С. Самохин (н.в. докторант УГМТУ) и С. Росляков (н.в. директор картинной галереи им. В. Верещагина).

Когда работы были в самом разгаре, студенты ВУЗа сообщили, что в чердачном помещении старого корпуса они видели шкаф, где среди конструкторских документов на французском языке находятся какие-то документы, относящиеся к С. О. Макарову. Это были случайно уцелевшие материалы музея 1949–54 гг. Уцелела даже инвентарная тетрадь. С её помощью были найдены на складе, в кладовых другие экспонаты. Недоставало только подлинной визитной карточки С. О. Макарова, полученной из ЦВММ в 1949 г. Все элементы экспозиции прежнего музея были реставрированы и включены в экспозицию воссоздаваемого музея.

Для оценки исторической достоверности экспозиции был приглашен историограф Черноморского флота и г. Николаева директор музея судостроительного завода им. 61 Коммунара А. Л. Журавель (флотский полковник в отставке).

21 сентября 1970 г., незадолго до торжеств по поводу 50-летия НКИ, мемориальный музей адм. С. О. Макарова был открыт. Из числа студентов создали совет музея, в его состав в разные годы входило от 9 до 20 студентов. Они вели поисковую работу, проводили экскурсии, читали доклады по истории флота в школах, Дворце пионеров, участвовали в макаровских чтениях в НКИ и других ВУЗах.

В г. Ленинграде они разыскали внучатую племянницу адм. Макарова Тихонову Милицу Васильевну, у которой сохранилось 12 предметов, имевших отношение к адмиралу. Она не рискнула передать их в общественный музей и через несколько лет с нашей помощью их получил музей судостроения и флота г. Николаева. В г. Кронштадте обнаружили дочь дворника Макаровых, которая рассказала об отношении адмирала к простым людям.

Активно работали председатели совета музея Н. Фирсова, А. Бадякин, Н. Загребельная. Большую помощь в работе музея оказывали студенты В. Заблоцкий, В. Левицкий, которые вместе с А. Бадякиным до настоящего времени серьезно занимаются историей нашего флота.

К концу 1985 года в музее числилось более 270 экспонатов.

В этот же период велась большая работа по созданию в НКИ фонда старой книги, связанной с историей флота. Закуплено через библиотеку НКИ у частных лиц более 200 книг XVIII–XIX веков и начала XX века, большая часть из них — раритеты. «Морской Устав» изд. 1780 г., «Регламент адмиралтейств и верфей» 1780 г., макаровская книга «О непотопляемости судов» 1870 г., двухтомник «Исторический обзор развития и деятельности морского министерства за 100 лет его существования», «История морского кадетского корпуса со списком его выпускников», книги Беклемишева, Елагина, Боголюбова, Вальдемара, Березина, Семечкина, Глотова, Витте, Вахтина, Висковатова, Бутакова, Веселаго, Черкасова, Посьета, Мертваго, Дунаева, Кроткова, Скаловского, Семёнова и др. Закуплено большое количество «Морских сборников», начиная с 1848 года, а также альбомы «Вооружение парусных судов», «Российский Императорский флот» Ганзена и др. Силами совета музея и военно-морской кафедры была организована во Дворце судостроителей всесоюзная конференция, посвященная 125-летию со дня рождения Макарова. На ней духовой оркестр военного гарнизона города исполнил забытые музыкальные произведения 1904–1905 гг., посвященные памяти адмирала. Сделана юбилейная медаль.

Музей включен в «Морской энциклопедический словарь», ему вручена медаль областного общества охраны памятников.

В конце 1986 года ректоратом принято решение о переносе музея в здание главного корпуса. Материалы экспозиции в 1987 г. демонтированы и перевезены в новое помещение. С помощью студентов и преподавателей кафедры «Архитектура судов» дважды без финансового обеспечения делалась попытка оформить экспозицию, но дело сдвинулось с мёртвой точки только тогда, когда в институте был введен штат директора музея. На эту работу пригласили старшего научного сотрудника музея судостроения Костенко Нелли Михайловну и выделили средства на оформление интерьера музея и размещения экспозиции.

С помощью кооператива «Наш дом» по проекту дизайнера С. И. Чигинцева (председатель Николаевского отделения союза дизайнеров Украины) в главном корпусе УГМТУ была создана новая экспозиция. Музей был вновь открыт в мае 1991 года.

За последующие годы экспозиция расширилась:

— оборудован штурманский стол корабля (карты, прокладочный инструмент, секстан, протрактор, гониометр и пр.);

— изготовлены андреевский и украинский военно-морские флаги;

— собраны и включены в экспозицию фрагменты керамики из древнегреческого г. Ольвия;

— создана иллюзия присутствия экскурсанта на корабле (звучит запись шумов моря, криков чаек, светятся ходовые огни и т. п.);

— собраны и размещены в экспозиции материалы о кругосветном плавании институтской яхты «Икар» (капитан Б. С. Немиров).

В 2001 г. музей завоевал первое место среди общественных музеев города и области в смотре, проводимом мэрией г. Николаев.

В 2004 году был выполнен ремонт помещений музея и его частичная реконструкция. В холле музея создан макет мачты парусного корабля и выполнен фриз из красочных панно по истории флота. Разработан дизайн-проект реконструкции холла. В экспозиции значительно расширен штурманский уголок.

Силами научно-исследовательской части и музея НУК с 14 по 16 апреля 2004 года проведена областная научная конференция, посвященная памяти адмирала С. О. Макарова и его друга художника-баталиста В. В. Верещагина (к 100-летию их трагической гибели). Конференция была совмещена с возобновлением макаровских чтений, которые традиционно проводились многими ВУЗами кораблестроительного профиля в течение многих лет. Инициаторами конференции в НУК были:

Николаевская областная государственная администрация: Министерство образования и науки Украины; Национальный университет кораблестроения им. адмирала Макарова;

Николаевский художественный музей им. В. В. Верещагина. В рамках этой конференции проведена научно-техническая конференция профессорско-преподавательского состава НУК (макаровские чтения). На планерном заседании и в работе 35 секций приняли участие представители: облгосадминистрации г. Николаева;

Киевского музея русского искусства; музея судостроения и флота г. Николаева; художественного музея им. В. В. Верещагина г. Николаева; Очаковского музея им. Г. Г. Судковского;

Харьковского областного архива;

Херсонского музея им. О. Шовкунского;

Пушкинского клуба;

Херсонского морского университета;

Николаевского краеведческого музея; мемориального музея адм. Макарова при НУК; областной универсальной научной библиотеки им. Н. Гмырева, г. Николаев;

научно-технической библиотеки НУК.

В 35 научных секциях было заслушано 474 доклада профессорско-преподавательского состава, аспирантов НУК и ряда других ВУЗов Украины.

1. Аппендикс — кормовая оконечность ограждения боевой рубки (народный термин).

2. Бакштаг — снасть стоячего такелажа, раскрепляющая мачту с носа и кормы.

3. Балясина — поперечная планка (ступенька) трапа.

4. Барк — морское парусное транспортное судно (3–5 мачт) с прямыми парусами на всех мачтах, кроме кормовой (бизань-мачты), несущей косые паруса.

5. Бимс — элемент набора корпуса корабля.

6. Ватервейс — на подводной лодке это желоб, где примыкает к прочному корпусу обшивка балластных цистерн в верхней их части. Вода, стекающая с прочного корпуса, отводится в море через трубы, привариваемые вверху балластных цистерн в районе ватервейса.

7. Губа — название морских заливов, далеко заходящих в сушу. Понятие распространено на севере европейской части России. В Норвегии — фиорд (фьорд).

8. Губа — в обиходе сокращённое название гаупвахты.

9. Гальюн — свес в носовой части парусного судна, на котором устанавливалось носовое украшение. На этом же месте по бортам устанавливались отхожие места для экипажа. В настоящее время гальюном называют туалеты на судах и кораблях, независимо от их расположения.