Подавление волнений в Антиохии с помощью иностранцев не прибавило популярности Деметрию ни среди горожан, ни среди воинов. Этим воспользовался некий Диодот, командир гарнизона в его родной Апамее. Он направился к арабам, где воспитывался юный сын Александра Ба-ласа и Клеопатры Антиох и убедил арабского шейха Малха (впрочем, может быть, это не имя, а титул — царь) отпустить с ним мальчика. Явившись в Антиохию, Диодот провозгласил его царем под именем Антиоха VI. Деметрий бежал из Антиохии. Но очередной переворот не прошел спокойно. Если столица с радостью признала нового царя, то на периферии положение было более сложным. В Палестине фактически правящему Диодоту пришлось пойти на соглашение с Ионатаном и от имени юного Антиоха не только утвердить его первосвященником, но и назначить его брата Симона командующим царскими войсками на палестинском побережье. Только с помощью этих уже довольно сильных правителей ему удалось здесь утвердиться. И тогда, видимо, рассчитывая на свою популярность, Диодот решил избавиться от Антиоха. Он убил его и провозгласил царем себя самого, приняв при этом новое имя — Трифон. Впервые на антиохийском троне оказался человек, даже не пытавшийся объявлять себя Селевкидом (I Мас., 11, 54–84; Ios. Ant. Iud., 5, 1–6, 1. Арр. Syr., 68).
Но Трифон переоценил свои силы. Киликия и Месопотамия продолжали признавать Деметрия. В Палестине слишком сильным стал прежний союзник Ионатан, и Трифон решил от него отделаться. Он заманил Ионатана в Птолемаиду и захватил там его в плен. Однако созванные на собрание иудеи избрали своим предводителем брата Ионатана Симона, так что Трифон ничего не выиграл. Вслед за тем он убил пленного Ионатана, но Симон сумел отбить тело брата и похоронить его в семейной гробнице. Затем Симон обратился к Деметрию. И тот, нуждаясь в поддержке иудеев, прекратил военные действия и отменил все налоги. Симон был утвержден первосвященником, селевкидский гарнизон выведен из Иерусалима, а сама крепость уничтожена (I Мас., 11–13; Ios. Ant. Iud., XIII, 6, 7). Это событие было воспринято в Иудее как полное освобождение от власти язычников. В его память была установлена новая эра летосчисления" начинавшаяся с первого года Симона, "великого первосвященника, вождя и правителя Иудеи" (II Мас., 3, 41–42). С точки зрения Селевкидов, Симон был признан династом, т. е. царьком, управляющим своей территорией по поручению верховного царя (ср.: Бикерман, 1985, 155–157). Он был первосвященником (духовным главой народа), стратегом (командующим войсками) и меридархом (правителем провинции), причем территория, которой он управлял, выходила теперь далеко за рамки собственно Иудеи. Важно и то, что все эти должности закреплялись за Хасмонеями наследственно. Считать, что речь идет о восстановлении суверенного Иудейского царства (Stern, М., 1981, 266), пожалуй, еще нельзя, но решающий шаг к обретению суверенитета был сделан.
Добившись мира на юге, Деметрий мог бы начать войну за возвращение себе трона. Но события на востоке заставили его сначала позаботиться об обеспечении тыла. Парфянский царь Митридат I, укрепившись в Иране, начал наступление на Месопотамию и (не позже 141 г. до н. э.) захватил Вавилон. В его руки попала и Селевкия на Тигре, вторая столица Селевкидов. И Деметрий, для которого без обладания Месопотамией начинать войну с Трифоном было бессмысленно, предпринял поход против Митридата. Поначалу ему сопутствовала удача, но в глубине Ирана армия Деметрия была разбита, а сам он попал в плен. Парфянский царь начал вести свою политическую игру. Он милостиво обошелся с царственным пленником, явно готовя его для будущего возможного вмешательства в дела соседнего государства. И через несколько лет время пришло.
Когда известие о поражении и пленении Деметрия II достигло запада, его брат Антиох, воспитывавшийся в малоазийском городе Сиде и поэтому прозванный Сидетом, но в то время находившийся на Родосе, стал собирать войско с намерением отвоевать отцовский трон, занятый Трифоном. Используя как базу Малую Азию, он с этим войском вторгся в Сирию. Трифон бежал в Дор на побережье Средиземного моря и был там осажден. В конце концов город был взят, и Трифон снова бежал, но был настигнут и убит. Для укрепления своей власти Антиох VII женился все на той же Клеопатре, своей мачехе и "соломенной вдове" своего брата, которая была много старше его.
Целью нового царя было восстановление прежнего могущества Селевкидов. Для этого надо было покончить с сепаратистскими движениями внутри государства и отразить парфянский натиск с востока. Призвав себе на помощь во время борьбы с Трифоном Симона и подтвердив его сан первосвященника и привилегии иудейского "этноса", Антиох после окончательной победы над узурпатором резко порвал со слишком могущественным династом. Он потребовал от Симона отказаться от всех городов и территорий вне собственно Иудеи, но тот не соглашался. Тогда по приказу царя стратег Приморья Кеддевей начал военные действия против Иудеи. Впрочем, это были, скорее, мелкие пограничные стычки, которые не приносили решающего успеха ни той, ни другой стороне. В сложившейся ситуации больше надежд Антиох возлагал на дипломатию, подкуп и внутренние смуты. Он явно подкупил зятя Симона Птолемея, правившею Иерихоном, по-видимому, пообещав ему власть во всей Иудее. Расчет оказался верен, Птолемей убил и Симона, и двух его сыновей, и сделал попытку убить третьего сына Симона — Иоанна Гиркана, а также завладеть Иерусалимом. Но этот замысел провалился. Первосвященником и главой Иудеи стал Иоанн Гиркан, выступивший против Птолемея. Правда, взять крепость, где укрылся Птолемей, Гиркан не смог. В итоге Птолемей был вынужден бежать в Заиорданье к правителю Филадельфии Зенону. Таким образом, избавиться, путем интриг от иудейского династа Антиох не смог и в 132 г. до н. э. перешел к активным действиям. Его армия осадила Иерусалим и после долгой осады взяла его. Иоанн Гиркан был вынужден пойти на переговоры. Он добился некоторых уступок, но в целом условия мира были довольно суровы. За Иудеей было сохранено внутреннее самоуправление под властью первосвященника, каковым был утвержден Иоанн Гиркан, последний должен был выдать оружие, платить налоги с тех территорий, которые находились за пределами собственно Иудеи, участвовать в войнах царя и выдать ему заложников. Практически речь шла о восстановлении почти полного суверенитета Селевкидов над Иудеей.
Восстановив свою власть внутри государства, Антиох VII начал поход на Парфию, где к этому времени умер энергичный Митридат I, на троне сидел его сын Фраат II. Как и предыдущий поход, этот тоже начался с побед, так что Фраат даже пошел на переговоры. Однако Антиох потребовал не только отпустить из плена брата, но и отказаться от всех владений Парфии, кроме наследственных (без уточнения этих владений). Парфянский царь на это, естественно, не согласился. Он предпринял два важных шага: отпустил из плена Деметрия, надеясь, что между братьями вспыхнет конфликт, и обратился за помощью к центральноазиатским кочевым племенам, которых источники обычно называют скифами. Те наголову разбили селевкидскую армию, и сам Антиох VII погиб в этом сражении. Парфия была спасена от Селевкидов, но сама стала объектом опустошительных набегов "скифов", с которыми Фраат был вынужден начать войну. Таким образом, Сирия была избавлена от неминуемого парфянскою вторжения. А Деметрий II, вернувшись из парфянского плена, снова занял трон (I Мас., 14–16; Ios. Ant. Iud., XIII, 5–8; Арр. Syr., 67–68; lust., XXXVI, 1, 2–6; 9, 4—10; 11).
Второе царствование Деметрия II было недолгим и неспокойным. Он вмешался в очередной династический конфликт в Египте, но потерпел поражение. Птолемей VIII, утвердившийся в Александрии, следуя примеру Птолемея VI, выдвинул фигуру некоего Александра Забинаса, которого представил приемным сыном Антиоха VII (на самом деле он был сыном какого-то грека от рабыни). С помощью Птолемея и при поддержке антиохийцев, ненавидевших Деметрия, Александр Забинас сумел захватить трон. Деметрий бежал в Дамаск. Собрав там силы, он выступил против узурпатора, но потерпел поражение и отступил к Птолемаиде, где находилась его жена Клеопатра, но та отказалась впустить его в город. Деметрий ушел в Тир, где был захвачен в плен и погиб после жестоких мучений. Тем не менее, подчинить всю территорию царства Александр Забинас не смог. Клеопатра провозгласила царем своего (и Деметрия II) сына Селевка V и фактически стала править вместо него. Она даже стала выпускать монету от собственного имени (Бикерман, 1985, 203). Затем Клеопатра устранила и сына, стремясь к единовластному правлению. Но этого ей не позволил Птолемей VIII.