Похожая ситуация складывалась в Центральной Сибири, где возник ряд партизанских республик463. Для борьбы с ними был образован целый Канско-Тайшетский фронт, на который были отвлечены значительные силы белых464. В конце мая – начале июня 1919 года белые войска провели широкомасштабную антипартизанскую операцию на фронте в 500 км465. В результате её Шиткинский и Баерский фронты были уничтожены, а остатки партизан ушли на север за Ангару. В середине июля действовавшие на Ангаре небольшие партизанские отряды объединились под началом Баженова. В начале августа партизанский отряд И. Г. Смолина в 300 человек осадил Николаевский железоделательный завод, обороняемый отрядом поручика Давыдова. Ему на помощь были направлены части из состава 14-й Сибирской дивизии и подразделения 4-го чешского полка466, разгромившие партизан. К концу августа фронт возглавил Н.А. Бурлов467.
Испытывая недостаток в людях, управляющий Иркутской губернией П. Д. Яковлев обнаружил необычный резерв для формирования отряда особого назначения (ООН). 5 мая 1919 г. он, желая «избавить от страданий в тюрьмах сотни молодёжи», посетил Александровский централ и призвал заключённых искупить свою вину перед Родиной участием в борьбе против ее врагов. Таким образом он навербовал в отряд 144 добровольца. Управляющий губернией понимал ненадежность подобного пополнения. Поэтому 26 июня он сообщил министру внутренних дел о том, что по соглашению с начальником ООН капитаном Ф. С. Решетиным в отряде учреждено «внутреннее освещение». Объектом такой слежки была жизнь отряда и поведение «выделяющихся одиночек». Предполагалось иметь в каждом взводе по 3-5 информаторов. Опасения властей были оправданы, ибо некоторые из заключённых, судя по воспоминаниям, вступили в отряд по совету Иннокентьевского большевистского подпольного комитета.
21 июля 1919 г. Иркутский ООН468 на пароходе «Бурят» проследовал из Иркутска в район Братска – Илимска по Ангаре. По сообщению управляющего Енисейской губернией эти солдаты совершенно разложились в Балаганске: «пьяные, растерзанные врывались в дома, требовали водку и девочек, насильничали и убивали». Полковник Крутицкий, направленный штабом Иркутского военного округа для координации действий правительственных войск, в письме начальнику 14-й Сибирской дивизии сообщал: «…сейчас следую на пароходе «Бурят» с отрядом на Братск. Две роты не отходят, а бегут по берегу, с парохода прикрывают их огнём. Люди какие-то уставшие… и совершенно потерявшие дух. Застава при появлении 2-х или 3-х красных… бежит и всё бросает, паника передаётся на роты, и они по принуждению и угрозе расстрелом из своего пулемёта залегают за буграми и стреляют в небо». 19 августа в деревне Паново несколько взводов ООН во главе с Д.Е. Зверевым469 и Н.В. Дворяновым убили своего командира470 и перешли к партизанам Н.А. Бурлова вместе со своим оружием471. 25 сентября партизаны захватили Братск-Острожный и атаковали Николаевский завод, где встретились с отрядом полковника Крутицкого. Бои продолжались до декабря, когда белые были вынуждены отойти к железной дороге к Иркутску472.
Пока основные силы приангарских партизан готовились атаковать Братск, Д.Е. Зверев и Дворянов с группой бойцов двинулся на восток и заняли ряд пунктов по Илимскому тракту473 и объединились с местными партизанами474. После разгрома отряда капитана Белоголового, они в начале ноября образовали Приангарский фронт, целью которого стало овладение Витимо-Ленским золотопромышленным районом. На контролируемой партизанами территории возникло региональное правительство – Временный Центросовет Северо-Востока Сибири. В его состав вошли большевики и эсеры475. Тем временем, партизаны, к которым присоединились местные эвенки, повели наступление на Усть-Кут и 13 ноября заняли его476. У Киренска завязались тяжёлые бои, поскольку белые подтянули на пароходах крупные силы из Иркутска и Бодайбо477.
Появление красных партизан в северном Прибайкалье заставило военное командование в Якутске предпринять ряд дополнительных мер по усилению обороны области. В частности, В. Каменский в конце месяца командировал в Олекминск прапорщика И. Шипкова для формирования отдельного взвода отряда особого назначения, а некоторое время спустя478 издал приказ о мобилизации якутских казаков в возрасте 18-43 лет в ООН. Чуть позже под Усть-Кут был командирован отряд И.С. Захаренко, квартировавший в Олёкминске479. Уже на Подымахинском фронте к нему присоединился взвод прапорщика Арбатского. Всего из Якутска против партизан было отправлено около сотни местных добровольцев и солдат местной команды с двумя офицерами.
Отправив часть войск против партизан, В. Каменский приказом от 30 сентября/13 октября организовал в Якутске «Комитет самоохраны» под председательством коменданта города штабс-капитана Н.Д. Кузнецова, в который вошло по одному представителю Думы и земства. В его распоряжении находилась местная и учебная команы и часть ООН480. После того, как под Киренск были отосланы наиболее надёжные солдаты и офицеры якутского гарнизона481 в распоряжении капитана В. Каменского осталась горстка верных солдат, и он очень рассчитывал на сбор добровольцев-якутов. В связи с этим «Комитету самоохраны» вменялось разработать мероприятия по организации самоохраны в ночное время. Были также предприняты меры по повышению боеспособности ООН. Так, 5/18 ноября В. Каменский запросил штаб ООН о боеспособности отряда, а 2 декабря он предписал начальнику Якутской местной команды «обеспечить вверенную вам команду и управление воинского начальника достаточным количеством стеариновых свеч на случай каких-либо беспорядков в городе и возможного, в связи с этим, прекращения работы электрической станции»482. Одновременно с Якутском была также усилена оборона Олёкминска, где прапорщик И.И. Шипков недавно закончил формировать взвод ООН. С его развёртыванием гарнизон483 городка, включая милицию484, достигли пятидесяти человек485. Он состоял исключительно из добровольцев, из которых только писарь и фельдфебель были взяты по мобилизации.
После высылки сторонников советской власти за пределы Якутии руководство Областного совета на некоторое время самоуспокоилось и утратило бдительность в отношении оппозиционеров, освободив часть из них из-под стражи. Уже 8 февраля левые эсеры и большевики486 решили объединить свои усилия для свержения Областного совета, создав самостоятельную партийную организацию. Осенью в область вернулась часть высланных большевиков, а из северных районов прибыли бывшие ссыльные. В результате усилилась подпольная работа, в частности, началось восстановление и формирование новых «пятков» из рабочих и учащейся молодежи, а среди якутской молодежи возникла нелегальная организация «Юный коммунист» во главе с М.В. Ксенофонтовым (Мегежекским). Усилилась агитационная работа среди солдат Якутского гарнизона, которую вёл прибывший из Иркутска Н.Т. Романченко. В начале декабря на заседании комитетов партийных организаций большевиков и левых эсеров был образован объединенный штаб по подготовке вооруженного восстания в составе шести человек487, намеченного на 18 декабря 1919 г. и разработало план действий, но не успело привести его в исполнение.
