В августе 2000 года Юрий Демин, бывший главный военный прокурор, был назначен первым заместителем министра юстиции России. Внешне в этом назначении ничего неестественного не было. Но в Главную военную прокуратуру Демин пришел с должности начальника договорно-­правового управления ФСБ. Офицер госбезопасности назначался министром юстиции впервые.

Тогда же первым заместителем министра по делам федерации, нацио­нальной и миграционной политики назначили первого зама директора ФСБ Александра Медяника.

В августе 2001 года первым заместителем директора Федеральной службы налоговой полиции стал Сергей Веревкин-­Рахальский, родившийся в 1948 году. Он закончил Ленинградский институт точной механики и оптики, и с 1986 года возглавлял Управление ФСБ по Сахалинской области, а с марта 1999 года — Управление ФСБ по Приморскому краю. В апреле 2000 года его вернули в Москву на должность заместителя министра по налогам и сборам.

Одновременно заместителем директора ФСНП назначили начальника одного из управлений ФСБ Анатолия Цибулевского (1950 года рождения).

В 2001 году Путин уволил ставленника «семьи» Ельцина Владимира Рушайло с поста министра внутренних дел и заменил его карьерным чекистом, коллегой Путина по ГКУ Борисом Грызловым, учившимся в одном классе с Патрушевым423.

Таким образом, уже в 2001 году абсолютно все ключевые министерские посты оказались во власти ФСБ.

Став президентом, Путин не забыл тех, кто помогал ему в проведении операции по вывозу Собчака во Францию. Заместитель директора ФСБ в 1998–2001 годах. Григорьев возглавил Федеральное агентство по государственным резервам. В 2008 году его даже включали в список возможных преемников Путина, но не срослось — он скоропостижно скончался 10 декабря 2008 года на 60-м году жизни. Юрий Шевченко стал министром здравоохранения России, где получил прозвище Доктор Смерть, так как в период его руководства медициной смертность среди россиян резко увеличилась, а во время освобождения заложников «Норд-­Оста» на Дубровке в Москве 23 октября 2002 года в результате неадекватных медицинских мер по спасению людей, отравленных усыпляющим газом, погибли 129 человек. После пяти лет провальной деятельности Шевченко отправи­ли в отставку.

Символичным оказалось и назначение 3 июня 2002 года заместителем генерального директора Всероссийской государственной телевизионной и радиовещательной компании (ВГТРК) генерала ФСБ Здановича, выведенного для этого в ОДР в том же 2002 году в чине генерал-­лейтенанта. Это был открытый вызов общественности и СМИ. В знак протеста против этого знакового назначения ушел со своего поста главный редактор программы «Вести» Александр Абраменко. На вопрос, остается ли Зданович в действующем резерве ФСБ, генерал с позволенной временем наглостью ответил:

Как известно, бывших чекистов не бывает. Но не хотелось бы уточнять детали. В тех проблемах, которые я буду решать, конечно, мне будут помогать коллеги. Из чувства солидарности.

24 апреля 2001 года был издан секретный приказ № 094 за подписью директора ФСБ Николая Патрушева, озаглавленный «Об организации работы по прикомандированию военнослужащих органов Федеральной службы безопасности». Согласно этому документу в случае, если зарплата прикомандированного сотрудника на новом месте была выше, чем в ФСБ (в частном секторе она всегда была выше), разницу в зарплате необходимо вернуть на Лубянку. По этой причине многие офицеры, уходившие в ОДР/АПС, предпочитали эту разницу получать наличными в конвертах, формально нарушая закон, используя классический мафиозный способ ухода от налогов и становясь обычными преступниками. Остальные, закон не нарушавшие, честно кормили свое ведомство, создавшее таким образом для российских бизнесов и учреждений некую скрытую форму дополнительного налогообложения (или открытую форму вымогательства) в пользу госбезопасности424.

Параллельно с открытыми назначениями высших офицеров ФСБ на руководящие должности в государстве происходило создание различных учреждений, в которые не сильно стесняясь, но и не слишком афишируя происходившее, уходили офицеры ДР, продолжавшие инкогнито служить в интересах госбезопасности. В частности, в первой половине 2000 года, предвидя неизбежный арест Гусинского и разгром его медиаимперии, Бобков создал новую структуру: Институт стратегических оценок и анализа (ИСОА). Именно в это учреждение, расположенное по адресу ул. А. Солженицына (бывшая Коммунистическая), д. 40/14, строение 1, плавно перетекли основные аналитические кадры некогда могущественной службы безопасности «Мост-банка».

На сайте института об этапах его развития была представлена не слишком исчерпывающая информация:

Основан в 2000 году на базе аналитического центра, функционировавшего с 1995 года. В совет директоров и штат института входят крупные специалисты в вопросах внутренней, внешней, геостратегической и военной политики, экономики, современной истории и права, большинство из которых имеют богатый опыт руководящей работы на государственных постах.

ИСОА был закрытым акционерным обществом. Информация о его акционерах в открытых источниках отсутствовала, как и информация о сотрудниках Института. Отсутствовало также название аналитического центра, «функционировавшего с 1995 года», на базе которого был создан ИСОА, потому что этим центром на самом деле был «Мост-банк».

Бобков, как и раньше, предпочитал оставаться в тени. Директором и главным редактором издаваемого институтом журнала «Вестник аналитики» с момента создания института был бывший председатель КГБ Азербайджанской ССР Вагиф Гусейнов, экстрадиции которого азербайджанские власти добивались с 1996 года (Россия в экстрадиции Азербайджану отказала).

Под «крышей» ИСОА укрылся также бывший начальник 5-го Управления генерал-­лейтенант Е. Ф. Иванов, кадровый офицер 5-го Управления Владимир Масленников и его подчиненный по времени службы в 5-м Управлении Валерий Ширяев, перешедший затем как офицер ДР на должность заместителя редактора в «Новую газету».

В ИСОА оказался также Сергей Петрович Чаплинский, в прошлом офицер 8-го отдела (разработка сионистских националистов) 5-го Управления, помощник начальника 5-го Управления генерала Ивана Абрамова и секретарь комсомольской организации 5-го Управления. Его преемник и по комсомольской линии, и по службе в 5-м Управлении Александр Львович Свечников тоже оказался в ИСОА на должности главного научного консультанта.

Сам Свечников, окончивший в 1973 году географический факультет МГУ и защитивший в 1987 году кандидатскую, служил в КГБ/ФСБ с 1974 по 1995 год. В 1995–2003 годах он был сотрудником информационно-­аналитических и пиарных структур различных частных компаний. В отдельных публикациях указывалось, что он еще и профессор кафедры мировой экономики и политики Государственного университета Высшей школы экономики. Однако в настоящих списках преподавателей он не значился.

Совместный труд Чаплинского и Свечникова, опубликованный в 2003 году, назывался «Современный глобальный капитализм». Он был написан в соавторстве с еще двумя авторами: Бобковым и Ивановым. Годом ранее в соавторстве с Бобковым Свечников издал книгу «Глобальный капитализм: размышления на тему».

На этом, однако, тяга к написанию книг у Бобкова не угасла. Соавтором его воспоминаний стал писатель Святослав Рыбас, завербованный в агентурную сеть госбезопасности в период его обучения на втором курсе литературного института им. Горького в Москве. Вербовал его офицер 1-го отделения 2-го отдела 5-го Управления старший лейтенант Юрий Балас.

Настоящим пристанищем для бывших офицеров КГБ/ФСБ стала Государственная дума и политические партии, почти всегда создающиеся при активном участии госбезопасности. В итоге в высшем законодательном органе России сформировалась нелегальная резидентура спецслужб из числа бывших офицеров госбезопасности и их агентов. Одним из них был Отари Аршба.

По окончании Высшей школе КГБ в 1978 году его зачислили для прохождения дальнейшей службы в 3-й отдел 5-го Управления, которым руководил полковник Владимир Головин. Офицеры данного подразделения оперативно курировали Министерство высшего и специального образования СССР, МГУ, УДН и КМО.