4. Поручая производство экспертизы, руководитель обязан решить вопрос о том, будет ли эксперт действовать самостоятельно или необходима комиссионная экспертиза. Руководитель определяет и вид комиссионной экспертизы — будет она состоять из экспертов одной специальности или разных специальностей. В комиссии, назначаемые руководителем, могут включаться только эксперты, работающие в учреждении, подчиненном руководителю. О принятом решении руководитель извещает инициатора экспертизы. Возможно привлечение сторонних экспертов. Но в этом случае руководитель обращается с соответствующим ходатайством к органу или лицу, назначившему экспертизу. Ходатайство разрешается путем вынесения соответствующего определения или постановления и по другим правилам, установленным процессуальным законодательством.

5. Деятельность руководителя в период проведения экспертизы заключается в создании условий для исследований, необходимых для научной обоснованности и юридической полноценности заключений экспертов. Эти условия носят организационную, финансовую, материально-техническую, информационно обеспечивающую и контрольную направленность.

6. Организационная направленность и остальные виды деятельности, названные в предыдущем пункте, предполагают наличие прав руководителя, реализуемых по отношению к структуре учреждения, его штатам, к подбору и расстановке кадров (в современном понимании этой деятельности — к управлению персоналом). Подробнее об этом см. комментарий к ст.15, а также комментарии к ст.ст.37, 38, 39.

7. Объекты контрольных полномочий руководителя — сроки экспертиз, их полнота и качество.

8. Процессуальное законодательство не устанавливает сроков проведения экспертиз. Но они могут определяться ведомственными нормативными актами. Срок проведения экспертиз целесообразно исчислять с момента получения постановления или определения о назначении экспертизы и направления экспертизы ее инициатору.

9. Полнота экспертизы выражается в исчерпывающих и конкретных ответах на предложенные вопросы. Эксперт вправе дополнить их и этим повысить достоверность своего заключения, однако он обязан обосновать необходимость такого дополнения. В ходе оценки полноты экспертизы особое внимание следует обратить на четкость ответов эксперта. Из них следует исключать неясные и неточные суждения, противоречивые выводы и гипотетические варианты.

10. Качество проведенного экспертного исследования находится в прямой зависимости от примененных научных положений и методик исследования. Руководитель должен знать состояние науки, относящейся к проведенной экспертизе, и требовать применения оправдавших себя достижений науки и способов изучения и исследования объектов экспертизы. Этой же цели служит информационное обеспечение деятельности учреждения в целом и проводимых им видов экспертиз в отдельности. Замечания, появляющиеся в ходе контроля, могут касаться содержания экспертного заключения. Такие замечания не должны противоречить принципу независимости эксперта и подменять его заключение. Но если между руководителем и экспертом возникли разногласия, руководитель, направляя заключение эксперта, вправе сообщить об этом в сопроводительном письме.

11. Соблюдение сроков, обеспечение надлежащей полноты и качества проведения экспертизы повышает значение экспертизы как доказательства. Строгое соблюдение законности проведения экспертизы придает исследованию значение допустимого доказательства, полнота экспертизы непосредственно связана с относимостью экспертного заключения, т.е. его соответствия предмету доказывания, высокое качество исследования определяет достоверность выводов, представленных субъектам судопроизводства.

12. Поскольку многочисленные обязанности контроля, возложенные на руководителя экспертного учреждения, не могут быть выполнены одним человеком, они осуществляются на основе распределения их по уровням управления, что отражается в соответствующих управленческих документах.

13. В обязанности руководителя входит создание материально-технических условий для деятельности экспертного учреждения. К материально-техническим условиям Закон отнес оборудование, приборы, материалы, средства информационного обеспечения. Экспертное учреждение обязано иметь перечень необходимых средств производства экспертиз, классифицированный по рубрикам „оборудование“, „приборы“, „материалы“, „средства информационного обеспечения“. Перечень должен отражать как наличие средств, так и потребность в них. Он является основой для решения вопросов финансирования, приобретения, ремонта, замены средств материально-технического обеспечения.

14. Руководитель экспертного учреждения должен принимать меры по обеспечению техники безопасности и производственной санитарии. Необходимы: разработка и утверждение правил техники безопасности и санитарии; проведение обучения сотрудников соблюдению этих правил; постоянный контроль за осуществлением режима санитарной и технической безопасности, сочетаемый с инструктивными занятиями и тренировками. При получении поручений о производстве экспертиз руководитель обязан потребовать, чтобы инициатор постановки вопроса об экспертизе сообщил о возможных опасностях, заключенных в объектах, представленных для экспертизы. До получения такой информации проведение экспертизы может быть приостановлено.

15. Представленные для исследования объекты должны быть сохранены. При этом надо учитывать процессуальные требования о сохранности вещественных доказательств, положения УПК и других процессуальных законов о том, что экспертные испытания не должны разрушать и изменять объекты исследования. Если возникает необходимость в изменениях или уничтожении их, руководитель или эксперт должны получить согласие лиц, назначивших экспертизу.

16. Закон адресует руководителю ряд запретов. Он не может самостоятельно назначать проведение экспертизы и истребовать объекты исследования и материалы дела. Руководителю запрещено привлекать дополнительных лиц, не состоящих в штате учреждения, для участия в экспертизах. У руководителя нет права давать эксперту указания, предрешающие его выводы. 

Руководитель вправе:

возвратить без исполнения постановление или определение о назначении судебной экспертизы, представленные для ее производства объекты исследований и материалы дела, если в данном учреждении нет эксперта конкретной специальности, необходимой материально-технической базы либо специальных условий для проведения исследований, указав мотивы, по которым производится возврат;

ходатайствовать перед органом или лицом, назначившими судебную экспертизу, о включении в состав комиссии экспертов лиц, не работающих в данном учреждении, если их специальные знания необходимы для дачи заключения;

организовывать производство судебной экспертизы с участием других учреждений, указанных в постановлении или определении о назначении судебной экспертизы;

передавать часть обязанностей и прав, связанных с организацией и производством судебной экспертизы, своему заместителю, а также руководителю структурного подразделения учреждения, которое он возглавляет;

требовать от органа или лица, назначивших судебную экспертизу, возмещения расходов, связанных с:

1) компенсацией за хранение транспортной организацией поступивших на судебную экспертизу объектов исследований, за исключением штрафов за несвоевременное их получение данным учреждением;

2) транспортировкой объектов после их исследования, за исключением почтовых расходов;

3) хранением объектов исследований в государственном судебно-экспертном учреждении после окончания производства судебной экспертизы сверх сроков, установленных нормативными правовыми актами соответствующих федеральных органов исполнительной власти;

4) ликвидацией последствий взрывов, пожаров и других экстремальных ситуаций, явившихся результатом поступления в данное учреждение объектов повышенной опасности, если орган или лицо, назначившие судебную экспертизу, не сообщили руководителю об известных им специальных правилах обращения с указанными объектами или они были ненадлежаще упакованы.