В чешских землях возникли научные общества: чешских врачей, чешских математиков (оба в 1862), чешских химиков (1871), геологическое (1884), географическое (1894). В 1864 при Национальном музее создан комитет по изучению естественных ресурсов Чехии. В 1863 Пражский политехнический институт разделился на чешский и немецкий институты. Чешский институт стал первым высшим учебным заведением, где преподавание велось на чешском языке. В 1882 Пражский университет аналогичным образом разделился на два университета. С деятельностью первых чешских учебных заведений связано становление ряда школ в чехословацкой науке 20 в. На рубеже 19 и 20 вв. практически по всем отраслям имелась научная литература на чешском языке. В 1890 создана Чешская академия наук и искусств.
Значительные успехи в геологии связаны с деятельностью жившего в 1831 в Чехии Й. Барранда (иностранный член-корреспондент Петербургской АН с 1877), автора 24-томной монографии, признанной классическим палеонтологическим трудом 19 в. Ф. Б. Пошепни стал одним из основоположников учения о рудных месторождениях. Ц. Пуркине и Й. В. Данеш положили начало чешской геоморфологии. К. Коржистки составил географические карты большей части Чехии. В области биологических наук получили известность ботаник, пропагандист дарвинизма Л. Челаковский, зоологи А. Фрич и Ф. Вейдовский (труды по анатомии животных и др.). В монастыре в Брно вёл опыты основоположник генетики Г. Мендель. В 1866 в записках местного общества естествоиспытателей он опубликовал свою классическую работу «Опыты над растительными гибридами», получившую мировое признание в 20 в. Развитию химии способствовали труды Б. Браунера по редкоземельным элементам, В. Шафаржика по неорганической химии и Ю. Стокласы по биохимии растений и агрохимии. Для чешской медицины существенное значение имела деятельность микробиолога Я. Главы, хирурга К. Майндля, гинеколога и уролога К. Павлика. Мировое признание получило описание Я. Янским системы групп крови (1907).
В области математики стали известны исследования Эдуарда Вейра (по проективной теории кривых) и его брата Эмиля Вейра, Ф. Й. Студнички, автора трудов по теории определителей. М. Лерх опубликовал работы по теории чисел, теории специальных функций и др.
С практикой металлургического производства связаны труды Ф. Вальда по физической химии. Крупный вклад в решение проблем добычи полезных ископаемых внесли инженер Э. Горжовский и Й. Грабак, признанный родоначальником чехословацкий горнозаводской механики. Ф. Кржижик построил первую в Чехии электростанцию (1888), электрическую железную дорогу (1903). Сформировалась чешская школа в области строительной механики (Й. Шолин и др.). Получила известность чешская школа сахароварения (К. Прейс, К. Андрлик). Из других технических достижений выделялись разработка Я. Гусником фототипии (1868), изобретение Ф. Грушкой медогонки (1865).
Естественные и технические науки в 1918 — 45. После образования самостоятельного чехословацкого государства в Праге организованы государственные научно-исследовательские институты: геологический (1919, под руководством Ц. Пуркине), гидрологический (1919), метеорологический (1920). При Карловом университете развернули работу несколько научно-исследовательских институтов и лабораторий. Был основан чешский университет в Брно (1919; факультет естественных наук открылся в 1920). Созданный в 1919 Чехословацкий научно-исследовательский совет выполнял главным образом представительские функции. В Словакии в Братиславе был организован университет им. Я. А. Коменского (1919; факультет естественных наук открылся в 1938), воссоздана Матица словацкая. Значительную роль в поддержке научной работы сыграло научное общество им. П. Й. Шафарика (1926). Государственное финансирование науки было незначительным, а в период экономического кризиса 1929—33 снизилось до минимального уровня.
Больших успехов добилась чехословацкая наука в области химии. Я. Гейровский (иностранный член АН СССР с 1966) предложил (1922) метод полярографии. Получили известность также труды Э. Воточека по аналитической химии и химии сахаров, Я. Дубского по комплексным соединениям и др. В математике Э. Чех стал одним из создателей проективно-дифференциальной геометрии. Активным популяризатором науки был математик Ф. Й. Студничка. Труды Ф. Завишки охватывали вопросы кристаллографии, гидродинамики и др. В. Долейшек вёл исследование рентгеновских лучей.
Заметное место в науке заняли труды чехословацких учёных-биологов. Б. Немец явился одним из основоположников экспериментальной цитологии. Видную роль в развитии традиций национальной школы физиологов сыграл Э. Бабак, автор трудов по исследованию адаптации организма в экстремальных условиях. Получили известность труды В. Ружички по генетике. В области медицины выделялись труды хирурга Й. Дивиша, кардиолога В. Либенского. Под руководством В. Дедины выпущено многотомное издание по страноведению Ч. (1929—31). Минералогические и геохимические исследования вели Ф. Ульрих, Р. Новачек и др.
Оккупация Ч. фашистскими войсками нанесла тяжёлый урон национальной науке. Научные учреждения и чехословацкие университеты были закрыты. В клерикально-фашистском государстве на территории Словакии власти пошли на создание (в демагогических целях) Словацкой академии наук и искусств (1943). В период оккупации погибли Завишка, Долейшек, Ульрих, Новачек и многие другие учёные.
Естественные и технические науки после 1945. После освобождения Ч. Советской Армией и особенно после победы трудящихся в 1948 перед наукой встали принципиально новые задачи, связанные с созданием материально-технической базы социализма и перестройкой общественной жизни на социалистических началах. Были восстановлены старые и созданы новые высшие учебные заведения, сформировалась сеть учреждений по научному обеспечению различных отраслей народного хозяйства. В 1952 основана Чехословацкая академия наук (ЧСАН), в 1953 — Словацкая академия наук (САН). Сеть научных учреждений постоянно совершенствовалась, более чёткой стала координация работ. Научно-исследовательские и проектно-конструкторские организации созданы, помимо Праги и Братиславы, во многих городах, в том числе в индустриальных центрах: Брно, Остраве, Готвальдове, Кошице и др. Активизировали научно-исследовательскую работу высшие учебные заведения.
Значительных успехов достигла математика благодаря трудам Э. Чеха, В. Ярника (теория функции и др.), В. Коржинека (теория групп и др.). Получили развитие новые для чехословацкой науки отрасли математики — дифференциальные уравнения, функциональный анализ, теория вероятностей и математическая статистика, математическая логика, некоторые разделы кибернетики. Разрабатываются проблемы прикладной математики. В 1951 состоялась конференция чехословацких физиков, впервые определившая основные направления исследований в этой отрасли науки в стране. Были продолжены работы по рентгеновскому излучению. Успешно развивались исследования по физике полупроводников, ферритов, магнитным свойствам металлов, кристаллографии, физике низких температур, сверхпроводимости. С помощью советских специалистов развернулось изучение проблем физики элементарных частиц и атомного ядра. В 1957 вступил в строй первый чехословацкий ядерный реактор в г. Ржеж. В сотрудничестве с АН СССР начаты работы по физике плазмы, в том числе с использованием установки Токамак. Создан ряд образцов электронных микроскопов и других уникальных приборов, в том числе для исследования структуры и энергетических состояний поверхности. В астрономии ведутся работы по изучению межпланетного вещества (В. Гут), проблем физики Солнца, звёзд и звёздных систем. Известность приобрёл Ондржейовский астрономический институт .
Успехи в химии связаны с трудами Я. Гейровского (Нобелевская премия, 1959, за разработку теории и техники полярографии) и его школы (Р. Брдичка, исследовавший также проблемы химической кинетики; Д. Илькович, получивший известность трудами по термодинамике, и др.). Существенное развитие получили химия природных соединений, химия гетероциклических соединений (Р. Лукеш и его школа). В области геологических наук велось изучение минералов и руд (Ф. Славик и др.), разрабатывались проблемы тектоники (В. Зоубек, иностранный член АН СССР с 1976, и др.), инженерной геологии, связанные главным образом с обеспечением крупных строительных проектов. Была издана геологическая карта ЧССР (в масштабе 1: 200000), проведено геоморфологическое картографирование. Издан Национальный атлас ЧССР. Ф. Витасек опубликовал один из самых полных курсов физической географии (4 изд., 1956—1965). Развернулись исследования по ландшафтоведению (Я. Демек и др.), по защите окружающей среды.
